Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescencia

Autores
Gillanders, Florencia
Año de publicación
2016
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis doctoral
Estado
versión publicada
Colaborador/a o director/a de tesis
Jovin, Thomas M.
Descripción
Las técnicas modernas de microscopía de fluorescencia requieren sondas cuyoscomportamientos fotoquímicos, combinados con las características ópticas del equipamiento,permitan resolver estructuras de dimensiones menores al límite impuesto por la difracciónnatural de la luz. Además de ser brillantes, estables, pequeñas y compatibles con el mediobiológico, las sondas ideales fluorescen y se tornan oscuras de manera controlada y conocida. En esta tesis se diseñaron nuevas sondas basadas en los diheteroariletenos oxidados (DHAOs)como plataforma de fluorescencia controlada. Los DHAOs son compuestos fotocrómicos que presentan dos isómeros fotoestables, unofluorescente y uno oscuro, alcanzados por irradiación con luz ultravioleta y visiblerespectivamente. Las propiedades espectroscópicas de los DHAOs se optimizaron estudiandoel efecto de sustituyentes dadores y aceptores de electrones sobre las mismas. La demandantecaracterización espectrofotométrica de los DHAOs se abordó con un espectrofotómetro yfotomodulador de construcción propia, el cual permitió automatizar las mediciones y explorarsistemáticamente diferentes condiciones de fotoconversión. Se descubrió que al aumentar elcarácter dador de electrones del sustituyente, se estabiliza particularmente el estado excitadodel isómero fluorescente, resultando en un aumento del desplazamiento de Stokes y unpronunciado solvatocromismo del fluoróforo. El solvatocromismo se utilizó para estudiar elcambio de polaridad del entorno de monómeros de α-sinucleína durante su agregación. A fin de conservar la fluoresencia fotomodulable de los DHAOs en agua, se explorarondiversas estrategias de solubilización con modificaciones covalentes y no-covalentes. Lainclusión en cavidades de ciclodextrina, la adsorción a albúmina, y la funcionalización congrupos hidrofílicos sirvieron para solubilizar efectivamente a los DHAOs en medios acuosos. Las propiedades de fluorescencia y fotoconversión se retuvieron exitosamente dentro de lacavidad de las proteínas de unión de ácidos grasos y mediante la conjugación a entidadesprotéicas de mayor tamaño, indicando la preferencia de los DHAOs a un entorno protegido delagua. Anticuerpos secundarios conjugados a DHAOs se utilizaron para marcar β-tubulinaen neuronas, y se lograron fotoconvertir selectivamente distintas áreas de las muestras enun microscopio que incorpora un arreglo programable para generar patrones espaciales deexcitación. El particular comportamiento fotoquímico de los diheteroariletenos permitió desarrollar unaestrategia para aumentar la resolución microscópica combinando DHAOs con fotocrómicosno-fluorescentes. Utilizando el fenómeno de transferencia de energía por resonancia de Förster, se postulan sondas que requieren de múltiples estímulos para la activación de laemisión, disminuyendo el volúmen de activación por debajo del límite de difracción de laluz y aumentando la resolución axial. La aplicación de las sondas sintetizadas y la propuestade nuevas estrategias relacionadas con los DHAOs denotan el potencial que tienen los mismosen la búsqueda de mayor resolución en la microscopía de fluorescencia.
Modern fluorescence microscopy techniques require probes whose photochemical behaviour,combined with the optical characteristics of the microscope, enable the resolution of structuressmaller than the natural diffraction limit of light. In addition to being bright, stable, small andcompatible with the biological environment, the ideal probe’s fluorescence is activated anddeactivated in a controlled and predictable manner. New probes were designed using oxidizeddiheteroarylethenes (ODHAs) as a platform for controlled fluorescence and are presented inthis thesis. ODHAs are photochromic compounds with two photostable isomers, one fluorescent andone dark, which are formed upon irradiation with ultraviolet and visible light, respectively. In order to optimize their spectroscopic and photochemical properties, the ODHAs weremodified with electron-donating and -withdrawing substituents. The demanding spectroscopiccharacterization of the photochromes was tackled with a custom built spectrophotometerand photoconverter, which enabled automatization of the measurements and the systematicexploration of varying photoconversion conditions. By increasing the electron-donatingcharacter of the substituents, the excited state of the fluorescent isomer is particularlystabilized, resulting in an increase in the Stokes shift and pronounced solvatochromism ofthe fluorophore. The solvatochromic ODHA was used to probe the changes in local polarityaround monomers of the amyloid protein α-synuclein during their aggregation. Diverse solubilization strategies involving both covalent and non-covalent modificationswere employed with the aim of conserving the photoswitchable fluorescence of ODHAs inwater. Inclusion in cyclodextrin cavities, adsorption onto albumin, and functionalization withhydrophilic groups all served to effectively solubilize the ODHAs in aqueous solutions. Thefluorescence and photoconversion properties were conserved inside the cavities of fatty acidbinding proteins and by conjugation to larger protein entities, indicating the preference ofthe ODHAs for surroundings devoid of water. Secondary antibodies conjugated to ODHAswere used to immunostain β-tubulin in fixed neurons, and different areas of the samplewere selectively photoconverted using structured illumination with a structured illumination (programmable array) microscope. A new strategy for increasing microscopic resolution was developed, harnessing the uniquephotochemical behaviour of diheteroarylethenes by combining ODHAs with non-fluorescentphotochromes. The proposed probes require multiple stimuli for activation of the Försterresonance energy transfer-modulated emission, reducing the activation volume below thediffraction limit and increasing axial resolution. The application of the synthesized probesand the description of novel strategies related to ODHAs denote their potential in the searchfor increased resolution in fluorescence microscopy.
Fil: Gillanders, Florencia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar
Repositorio
Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
Institución
Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
OAI Identificador
tesis:tesis_n5997_Gillanders

id BDUBAFCEN_69561608bdd88a873cef227253d093d3
oai_identifier_str tesis:tesis_n5997_Gillanders
network_acronym_str BDUBAFCEN
repository_id_str 1896
network_name_str Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
spelling Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescenciaFluorescent diheteroarylethenes as probes for fluorescence microscopyGillanders, FlorenciaLas técnicas modernas de microscopía de fluorescencia requieren sondas cuyoscomportamientos fotoquímicos, combinados con las características ópticas del equipamiento,permitan resolver estructuras de dimensiones menores al límite impuesto por la difracciónnatural de la luz. Además de ser brillantes, estables, pequeñas y compatibles con el mediobiológico, las sondas ideales fluorescen y se tornan oscuras de manera controlada y conocida. En esta tesis se diseñaron nuevas sondas basadas en los diheteroariletenos oxidados (DHAOs)como plataforma de fluorescencia controlada. Los DHAOs son compuestos fotocrómicos que presentan dos isómeros fotoestables, unofluorescente y uno oscuro, alcanzados por irradiación con luz ultravioleta y visiblerespectivamente. Las propiedades espectroscópicas de los DHAOs se optimizaron estudiandoel efecto de sustituyentes dadores y aceptores de electrones sobre las mismas. La demandantecaracterización espectrofotométrica de los DHAOs se abordó con un espectrofotómetro yfotomodulador de construcción propia, el cual permitió automatizar las mediciones y explorarsistemáticamente diferentes condiciones de fotoconversión. Se descubrió que al aumentar elcarácter dador de electrones del sustituyente, se estabiliza particularmente el estado excitadodel isómero fluorescente, resultando en un aumento del desplazamiento de Stokes y unpronunciado solvatocromismo del fluoróforo. El solvatocromismo se utilizó para estudiar elcambio de polaridad del entorno de monómeros de α-sinucleína durante su agregación. A fin de conservar la fluoresencia fotomodulable de los DHAOs en agua, se explorarondiversas estrategias de solubilización con modificaciones covalentes y no-covalentes. Lainclusión en cavidades de ciclodextrina, la adsorción a albúmina, y la funcionalización congrupos hidrofílicos sirvieron para solubilizar efectivamente a los DHAOs en medios acuosos. Las propiedades de fluorescencia y fotoconversión se retuvieron exitosamente dentro de lacavidad de las proteínas de unión de ácidos grasos y mediante la conjugación a entidadesprotéicas de mayor tamaño, indicando la preferencia de los DHAOs a un entorno protegido delagua. Anticuerpos secundarios conjugados a DHAOs se utilizaron para marcar β-tubulinaen neuronas, y se lograron fotoconvertir selectivamente distintas áreas de las muestras enun microscopio que incorpora un arreglo programable para generar patrones espaciales deexcitación. El particular comportamiento fotoquímico de los diheteroariletenos permitió desarrollar unaestrategia para aumentar la resolución microscópica combinando DHAOs con fotocrómicosno-fluorescentes. Utilizando el fenómeno de transferencia de energía por resonancia de Förster, se postulan sondas que requieren de múltiples estímulos para la activación de laemisión, disminuyendo el volúmen de activación por debajo del límite de difracción de laluz y aumentando la resolución axial. La aplicación de las sondas sintetizadas y la propuestade nuevas estrategias relacionadas con los DHAOs denotan el potencial que tienen los mismosen la búsqueda de mayor resolución en la microscopía de fluorescencia.Modern fluorescence microscopy techniques require probes whose photochemical behaviour,combined with the optical characteristics of the microscope, enable the resolution of structuressmaller than the natural diffraction limit of light. In addition to being bright, stable, small andcompatible with the biological environment, the ideal probe’s fluorescence is activated anddeactivated in a controlled and predictable manner. New probes were designed using oxidizeddiheteroarylethenes (ODHAs) as a platform for controlled fluorescence and are presented inthis thesis. ODHAs are photochromic compounds with two photostable isomers, one fluorescent andone dark, which are formed upon irradiation with ultraviolet and visible light, respectively. In order to optimize their spectroscopic and photochemical properties, the ODHAs weremodified with electron-donating and -withdrawing substituents. The demanding spectroscopiccharacterization of the photochromes was tackled with a custom built spectrophotometerand photoconverter, which enabled automatization of the measurements and the systematicexploration of varying photoconversion conditions. By increasing the electron-donatingcharacter of the substituents, the excited state of the fluorescent isomer is particularlystabilized, resulting in an increase in the Stokes shift and pronounced solvatochromism ofthe fluorophore. The solvatochromic ODHA was used to probe the changes in local polarityaround monomers of the amyloid protein α-synuclein during their aggregation. Diverse solubilization strategies involving both covalent and non-covalent modificationswere employed with the aim of conserving the photoswitchable fluorescence of ODHAs inwater. Inclusion in cyclodextrin cavities, adsorption onto albumin, and functionalization withhydrophilic groups all served to effectively solubilize the ODHAs in aqueous solutions. Thefluorescence and photoconversion properties were conserved inside the cavities of fatty acidbinding proteins and by conjugation to larger protein entities, indicating the preference ofthe ODHAs for surroundings devoid of water. Secondary antibodies conjugated to ODHAswere used to immunostain β-tubulin in fixed neurons, and different areas of the samplewere selectively photoconverted using structured illumination with a structured illumination (programmable array) microscope. A new strategy for increasing microscopic resolution was developed, harnessing the uniquephotochemical behaviour of diheteroarylethenes by combining ODHAs with non-fluorescentphotochromes. The proposed probes require multiple stimuli for activation of the Försterresonance energy transfer-modulated emission, reducing the activation volume below thediffraction limit and increasing axial resolution. The application of the synthesized probesand the description of novel strategies related to ODHAs denote their potential in the searchfor increased resolution in fluorescence microscopy.Fil: Gillanders, Florencia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y NaturalesJovin, Thomas M.2016-05-18info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:ar-repo/semantics/tesisDoctoralapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n5997_Gillandersspainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/arreponame:Biblioteca Digital (UBA-FCEN)instname:Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturalesinstacron:UBA-FCEN2025-09-29T13:41:08Ztesis:tesis_n5997_GillandersInstitucionalhttps://digital.bl.fcen.uba.ar/Universidad públicaNo correspondehttps://digital.bl.fcen.uba.ar/cgi-bin/oaiserver.cgiana@bl.fcen.uba.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:18962025-09-29 13:41:09.917Biblioteca Digital (UBA-FCEN) - Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturalesfalse
dc.title.none.fl_str_mv Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescencia
Fluorescent diheteroarylethenes as probes for fluorescence microscopy
title Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescencia
spellingShingle Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescencia
Gillanders, Florencia
title_short Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescencia
title_full Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescencia
title_fullStr Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescencia
title_full_unstemmed Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescencia
title_sort Diheteroariletenos fluorescentes como sondas para microscopía de fluorescencia
dc.creator.none.fl_str_mv Gillanders, Florencia
author Gillanders, Florencia
author_facet Gillanders, Florencia
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Jovin, Thomas M.
dc.description.none.fl_txt_mv Las técnicas modernas de microscopía de fluorescencia requieren sondas cuyoscomportamientos fotoquímicos, combinados con las características ópticas del equipamiento,permitan resolver estructuras de dimensiones menores al límite impuesto por la difracciónnatural de la luz. Además de ser brillantes, estables, pequeñas y compatibles con el mediobiológico, las sondas ideales fluorescen y se tornan oscuras de manera controlada y conocida. En esta tesis se diseñaron nuevas sondas basadas en los diheteroariletenos oxidados (DHAOs)como plataforma de fluorescencia controlada. Los DHAOs son compuestos fotocrómicos que presentan dos isómeros fotoestables, unofluorescente y uno oscuro, alcanzados por irradiación con luz ultravioleta y visiblerespectivamente. Las propiedades espectroscópicas de los DHAOs se optimizaron estudiandoel efecto de sustituyentes dadores y aceptores de electrones sobre las mismas. La demandantecaracterización espectrofotométrica de los DHAOs se abordó con un espectrofotómetro yfotomodulador de construcción propia, el cual permitió automatizar las mediciones y explorarsistemáticamente diferentes condiciones de fotoconversión. Se descubrió que al aumentar elcarácter dador de electrones del sustituyente, se estabiliza particularmente el estado excitadodel isómero fluorescente, resultando en un aumento del desplazamiento de Stokes y unpronunciado solvatocromismo del fluoróforo. El solvatocromismo se utilizó para estudiar elcambio de polaridad del entorno de monómeros de α-sinucleína durante su agregación. A fin de conservar la fluoresencia fotomodulable de los DHAOs en agua, se explorarondiversas estrategias de solubilización con modificaciones covalentes y no-covalentes. Lainclusión en cavidades de ciclodextrina, la adsorción a albúmina, y la funcionalización congrupos hidrofílicos sirvieron para solubilizar efectivamente a los DHAOs en medios acuosos. Las propiedades de fluorescencia y fotoconversión se retuvieron exitosamente dentro de lacavidad de las proteínas de unión de ácidos grasos y mediante la conjugación a entidadesprotéicas de mayor tamaño, indicando la preferencia de los DHAOs a un entorno protegido delagua. Anticuerpos secundarios conjugados a DHAOs se utilizaron para marcar β-tubulinaen neuronas, y se lograron fotoconvertir selectivamente distintas áreas de las muestras enun microscopio que incorpora un arreglo programable para generar patrones espaciales deexcitación. El particular comportamiento fotoquímico de los diheteroariletenos permitió desarrollar unaestrategia para aumentar la resolución microscópica combinando DHAOs con fotocrómicosno-fluorescentes. Utilizando el fenómeno de transferencia de energía por resonancia de Förster, se postulan sondas que requieren de múltiples estímulos para la activación de laemisión, disminuyendo el volúmen de activación por debajo del límite de difracción de laluz y aumentando la resolución axial. La aplicación de las sondas sintetizadas y la propuestade nuevas estrategias relacionadas con los DHAOs denotan el potencial que tienen los mismosen la búsqueda de mayor resolución en la microscopía de fluorescencia.
Modern fluorescence microscopy techniques require probes whose photochemical behaviour,combined with the optical characteristics of the microscope, enable the resolution of structuressmaller than the natural diffraction limit of light. In addition to being bright, stable, small andcompatible with the biological environment, the ideal probe’s fluorescence is activated anddeactivated in a controlled and predictable manner. New probes were designed using oxidizeddiheteroarylethenes (ODHAs) as a platform for controlled fluorescence and are presented inthis thesis. ODHAs are photochromic compounds with two photostable isomers, one fluorescent andone dark, which are formed upon irradiation with ultraviolet and visible light, respectively. In order to optimize their spectroscopic and photochemical properties, the ODHAs weremodified with electron-donating and -withdrawing substituents. The demanding spectroscopiccharacterization of the photochromes was tackled with a custom built spectrophotometerand photoconverter, which enabled automatization of the measurements and the systematicexploration of varying photoconversion conditions. By increasing the electron-donatingcharacter of the substituents, the excited state of the fluorescent isomer is particularlystabilized, resulting in an increase in the Stokes shift and pronounced solvatochromism ofthe fluorophore. The solvatochromic ODHA was used to probe the changes in local polarityaround monomers of the amyloid protein α-synuclein during their aggregation. Diverse solubilization strategies involving both covalent and non-covalent modificationswere employed with the aim of conserving the photoswitchable fluorescence of ODHAs inwater. Inclusion in cyclodextrin cavities, adsorption onto albumin, and functionalization withhydrophilic groups all served to effectively solubilize the ODHAs in aqueous solutions. Thefluorescence and photoconversion properties were conserved inside the cavities of fatty acidbinding proteins and by conjugation to larger protein entities, indicating the preference ofthe ODHAs for surroundings devoid of water. Secondary antibodies conjugated to ODHAswere used to immunostain β-tubulin in fixed neurons, and different areas of the samplewere selectively photoconverted using structured illumination with a structured illumination (programmable array) microscope. A new strategy for increasing microscopic resolution was developed, harnessing the uniquephotochemical behaviour of diheteroarylethenes by combining ODHAs with non-fluorescentphotochromes. The proposed probes require multiple stimuli for activation of the Försterresonance energy transfer-modulated emission, reducing the activation volume below thediffraction limit and increasing axial resolution. The application of the synthesized probesand the description of novel strategies related to ODHAs denote their potential in the searchfor increased resolution in fluorescence microscopy.
Fil: Gillanders, Florencia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.
description Las técnicas modernas de microscopía de fluorescencia requieren sondas cuyoscomportamientos fotoquímicos, combinados con las características ópticas del equipamiento,permitan resolver estructuras de dimensiones menores al límite impuesto por la difracciónnatural de la luz. Además de ser brillantes, estables, pequeñas y compatibles con el mediobiológico, las sondas ideales fluorescen y se tornan oscuras de manera controlada y conocida. En esta tesis se diseñaron nuevas sondas basadas en los diheteroariletenos oxidados (DHAOs)como plataforma de fluorescencia controlada. Los DHAOs son compuestos fotocrómicos que presentan dos isómeros fotoestables, unofluorescente y uno oscuro, alcanzados por irradiación con luz ultravioleta y visiblerespectivamente. Las propiedades espectroscópicas de los DHAOs se optimizaron estudiandoel efecto de sustituyentes dadores y aceptores de electrones sobre las mismas. La demandantecaracterización espectrofotométrica de los DHAOs se abordó con un espectrofotómetro yfotomodulador de construcción propia, el cual permitió automatizar las mediciones y explorarsistemáticamente diferentes condiciones de fotoconversión. Se descubrió que al aumentar elcarácter dador de electrones del sustituyente, se estabiliza particularmente el estado excitadodel isómero fluorescente, resultando en un aumento del desplazamiento de Stokes y unpronunciado solvatocromismo del fluoróforo. El solvatocromismo se utilizó para estudiar elcambio de polaridad del entorno de monómeros de α-sinucleína durante su agregación. A fin de conservar la fluoresencia fotomodulable de los DHAOs en agua, se explorarondiversas estrategias de solubilización con modificaciones covalentes y no-covalentes. Lainclusión en cavidades de ciclodextrina, la adsorción a albúmina, y la funcionalización congrupos hidrofílicos sirvieron para solubilizar efectivamente a los DHAOs en medios acuosos. Las propiedades de fluorescencia y fotoconversión se retuvieron exitosamente dentro de lacavidad de las proteínas de unión de ácidos grasos y mediante la conjugación a entidadesprotéicas de mayor tamaño, indicando la preferencia de los DHAOs a un entorno protegido delagua. Anticuerpos secundarios conjugados a DHAOs se utilizaron para marcar β-tubulinaen neuronas, y se lograron fotoconvertir selectivamente distintas áreas de las muestras enun microscopio que incorpora un arreglo programable para generar patrones espaciales deexcitación. El particular comportamiento fotoquímico de los diheteroariletenos permitió desarrollar unaestrategia para aumentar la resolución microscópica combinando DHAOs con fotocrómicosno-fluorescentes. Utilizando el fenómeno de transferencia de energía por resonancia de Förster, se postulan sondas que requieren de múltiples estímulos para la activación de laemisión, disminuyendo el volúmen de activación por debajo del límite de difracción de laluz y aumentando la resolución axial. La aplicación de las sondas sintetizadas y la propuestade nuevas estrategias relacionadas con los DHAOs denotan el potencial que tienen los mismosen la búsqueda de mayor resolución en la microscopía de fluorescencia.
publishDate 2016
dc.date.none.fl_str_mv 2016-05-18
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
info:ar-repo/semantics/tesisDoctoral
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n5997_Gillanders
url https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n5997_Gillanders
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
publisher.none.fl_str_mv Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
instname:Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
instacron:UBA-FCEN
reponame_str Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
collection Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
instname_str Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
instacron_str UBA-FCEN
institution UBA-FCEN
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital (UBA-FCEN) - Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
repository.mail.fl_str_mv ana@bl.fcen.uba.ar
_version_ 1844618701031079936
score 13.070432