Extensión de secuencias de Bruijn en alfabetos más grandes

• Autores: Cortés, Lucas
• Año de publicación: 2018
• Idioma: inglés
• Tipo de recurso: tesis de grado
• Colaborador/a o director/a de tesis: Becher, Verónica Andrea
• Materia: SECUENCIAS DE BRUIJN; CICLOS EULERIANOS; BRUIJN SEQUENCES; EULERIAN CYCLES
• Institución: Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

Un secuencia circular de Bruijn de orden n en k colores es una secuencia en la que cada palabra de longitud n ocurre exactamente una vez. En esta tesis demostramos que para cada secuencia circular de Bruijn v de orden n en k colores hay otra secuencia circular de Bruijn w de orden n pero en k + 1 colores tal que v es una subsecuencia de w y entre cualesquiera dos ocurrencias sucesivas del nuevo símbolo en w hay a lo sumo n + 2k − 2 símbolos consecutivos de v. Damos un algoritmo que recibe una tal secuencia v y produce la secuencia w. Damos además un algoritmo mucho más rápido que recibe una tal secuencia v y produce una secuencia w pero sin la garantía de que el nuevo símbolo esté balanceado.
A circular de Bruijn sequence of order n in k colors is a sequence in which every possible word of length n occurs exactly once. In this thesis we show that for any given circular de Bruijn sequence v of order n in k colors there is another circular de Bruijn sequence w of order n but in k + 1 colors such that v is a subsequence of w and such that in between two successive occurrences of the new colored symbol in w there are at most n + 2k − 2 consecutive symbols of v. We provide an algorithm that given such an input sequence v produces the output sequence w. And we give a much faster algorithm that also receives as input such a sequence v and outputs a sequence w without the guarantee of the fair distribution of the new colored symbol.
Fil: Cortés, Lucas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.