Comparison of DNA extraction methods and real-time PCR assays for the molecular diagnostics of chronic Chagas disease

Autores
Silgado, Aroa; Moure, Zaira; de Oliveira, Maykon T; Serre-Delcor, Núria; Salvador, Fernando; Oliveira, Inés; Molina, Israel; Pumarola, Tomàs; Ramirez, Juan C.; Sulleiro, Elena
Año de publicación
2020
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Fil: Ramírez, Juan C. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Parasitología DR: Mario Fatala Chaben; Argentina.
Fil: Silgado, Aroa. Universitat Autònoma de Barcelona, PROSICS. Hospital Universitari Vall d'Hebron. Departament de Microbiologia; Barcelona, España.
Fil: Moure, Zaira. Universitat Autònoma de Barcelona, PROSICS. Hospital Universitari Vall d'Hebron. Departament de Microbiologia; España.
Fil: de Oliveira, Maykon T. Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Unidade de Cardiologia. Departamento de Clínica Médica; Brasil.
Fil: Serre-Delcor, Núria. Universitata Autònoma de Barcelona. Tropical Medicine Unit Vall d´Hebron-Drassanes; Barcelona, España.
Fil: Salvador, Fernando. Universitat Autònoma de Barcelona. Department of Infectious Diseases, Vall d'Hebron University Hospital; Barcelona, España.
Fil: Oliveira, Inés. Universitata Autònoma de Barcelona. Tropical Medicine Unit Vall d´Hebron-Drassanes; Barcelona, España.
Fil: Molina, Israel. Universitat Autònoma de Barcelona. Department of Infectious Diseases, Vall d'Hebron University Hospital; Barcelona, España.
Fil: Pumarola, Tomas. Universitat Autònoma de Barcelona, PROSICS. Hospital Universitari Vall d'Hebron. Departament de Microbiologia; España.
Fil: Sulleiro, Elena. Universitat Autònoma de Barcelona, PROSICS. Hospital Universitari Vall d'Hebron. Departament de Microbiologia; España.
Aim: This work aimed to compare the sensitivity of four protocols for the detection of Trypanosoma cruzi DNA in 98 blood samples from chronic Chagas disease patients. Materials & methods: Two DNA extraction (automated and manual) methods and two T. cruzi satellite DNA qPCRs (with a recent design and the usually used set of primers) were analyzed. Results: Both DNA extraction methods and qPCR assays tested in this work gave comparable qualitative results, although the lowest Ct values were obtained when samples were analyzed using the new set of primers for T. cruzi satellite DNA. Conclusion: Our results encourage the implementation of automated DNA extraction systems and the new T. cruzi qPCR for the molecular diagnostics and treatment response monitoring of chronic Chagas disease patients.
Materia
Enfermedad de Chagas
Extracción de ADN
Trypanosoma cruzi
Ensayo Clínico
Diagnóstico Molecular
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
none
Repositorio
Sistema de Gestión del Conocimiento ANLIS MALBRÁN
Institución
Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán"
OAI Identificador
oai:sgc.anlis.gob.ar:Publications/123456789/1660
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Aim: This work aimed to compare the sensitivity of four protocols for the detection of Trypanosoma cruzi DNA in 98 blood samples from chronic Chagas disease patients. Materials & methods: Two DNA extraction (automated and manual) methods and two T. cruzi satellite DNA qPCRs (with a recent design and the usually used set of primers) were analyzed. Results: Both DNA extraction methods and qPCR assays tested in this work gave comparable qualitative results, although the lowest Ct values were obtained when samples were analyzed using the new set of primers for T. cruzi satellite DNA. Conclusion: Our results encourage the implementation of automated DNA extraction systems and the new T. cruzi qPCR for the molecular diagnostics and treatment response monitoring of chronic Chagas disease patients.
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