Análisis de datos de expresión con R como herramienta para el estudio de familias génicas

Autores
Chiriotto, Tai S.; Saura Sánchez, Maite
Año de publicación
2018
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Las proteínas B-box de Arabidopsis thaliana constituyen una familia de 32 miembros (BBX1 a BBX32) que están implicadas en múltiples procesos a lo largo de toda la vida de la planta. Participan en procesos de desetiolación, floración y germinación entre otros. También, actúan en respuestas ambientales como en las respuestas a la percepción de plantas vecinas o a la salinidad. Los datos proporcionados por microarreglos y RNAseq hechos en plantas bajo diversas condiciones experimentales pueden suministrar información importante y robusta acerca de la expresión de los genes de interés y pueden servir para plantear nuevas hipótesis de trabajo. En la actualidad, la base de datos existente es extensa y variada. Los datos publicados pueden estar crudos, procesados y también de ambas formas. Como consecuencia, realizar análisis con herramientas convencionales como tablas Excel es complejo y lento, pudiendo cometer múltiples errores en los numerosos pasos del proceso. El objetivo del siguiente trabajo es analizar la familia de proteínas B-box mediante el software R en microarreglos y RNAseq de plantas en distintas condiciones experimentales.
Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativa
Materia
Ciencias Informáticas
proteínas BBX
microarreglos
RNAseq
sorfware R
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/
Repositorio
SEDICI (UNLP)
Institución
Universidad Nacional de La Plata
OAI Identificador
oai:sedici.unlp.edu.ar:10915/72794
Acceder
id SEDICI_d3f7aa059693ce9304233282984c34c4
oai_identifier_str oai:sedici.unlp.edu.ar:10915/72794
network_acronym_str SEDICI
repository_id_str 1329
network_name_str SEDICI (UNLP)
spelling Análisis de datos de expresión con R como herramienta para el estudio de familias génicasChiriotto, Tai S.Saura Sánchez, MaiteCiencias Informáticasproteínas BBXmicroarreglosRNAseqsorfware RLas proteínas B-box de Arabidopsis thaliana constituyen una familia de 32 miembros (BBX1 a BBX32) que están implicadas en múltiples procesos a lo largo de toda la vida de la planta. Participan en procesos de desetiolación, floración y germinación entre otros. También, actúan en respuestas ambientales como en las respuestas a la percepción de plantas vecinas o a la salinidad. Los datos proporcionados por microarreglos y RNAseq hechos en plantas bajo diversas condiciones experimentales pueden suministrar información importante y robusta acerca de la expresión de los genes de interés y pueden servir para plantear nuevas hipótesis de trabajo. En la actualidad, la base de datos existente es extensa y variada. Los datos publicados pueden estar crudos, procesados y también de ambas formas. Como consecuencia, realizar análisis con herramientas convencionales como tablas Excel es complejo y lento, pudiendo cometer múltiples errores en los numerosos pasos del proceso. El objetivo del siguiente trabajo es analizar la familia de proteínas B-box mediante el software R en microarreglos y RNAseq de plantas en distintas condiciones experimentales.Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativa2018-09info:eu-repo/semantics/conferenceObjectinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionResumenhttp://purl.org/coar/resource_type/c_5794info:ar-repo/semantics/documentoDeConferenciaapplication/pdfhttp://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/72794spainfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://47jaiio.sadio.org.ar/sites/default/files/LatinR_57.pdfinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/issn/2618-3196info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported (CC BY-SA 3.0)reponame:SEDICI (UNLP)instname:Universidad Nacional de La Platainstacron:UNLP2025-09-29T11:12:04Zoai:sedici.unlp.edu.ar:10915/72794Institucionalhttp://sedici.unlp.edu.ar/Universidad públicaNo correspondehttp://sedici.unlp.edu.ar/oai/snrdalira@sedici.unlp.edu.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:13292025-09-29 11:12:04.606SEDICI (UNLP) - Universidad Nacional de La Platafalse
dc.title.none.fl_str_mv Análisis de datos de expresión con R como herramienta para el estudio de familias génicas
title Análisis de datos de expresión con R como herramienta para el estudio de familias génicas
spellingShingle Análisis de datos de expresión con R como herramienta para el estudio de familias génicas
Chiriotto, Tai S.
Ciencias Informáticas
proteínas BBX
microarreglos
RNAseq
sorfware R
title_short Análisis de datos de expresión con R como herramienta para el estudio de familias génicas
title_full Análisis de datos de expresión con R como herramienta para el estudio de familias génicas
title_fullStr Análisis de datos de expresión con R como herramienta para el estudio de familias génicas
title_full_unstemmed Análisis de datos de expresión con R como herramienta para el estudio de familias génicas
title_sort Análisis de datos de expresión con R como herramienta para el estudio de familias génicas
dc.creator.none.fl_str_mv Chiriotto, Tai S.
Saura Sánchez, Maite
author Chiriotto, Tai S.
author_facet Chiriotto, Tai S.
Saura Sánchez, Maite
author_role author
author2 Saura Sánchez, Maite
author2_role author
dc.subject.none.fl_str_mv Ciencias Informáticas
proteínas BBX
microarreglos
RNAseq
sorfware R
topic Ciencias Informáticas
proteínas BBX
microarreglos
RNAseq
sorfware R
dc.description.none.fl_txt_mv Las proteínas B-box de Arabidopsis thaliana constituyen una familia de 32 miembros (BBX1 a BBX32) que están implicadas en múltiples procesos a lo largo de toda la vida de la planta. Participan en procesos de desetiolación, floración y germinación entre otros. También, actúan en respuestas ambientales como en las respuestas a la percepción de plantas vecinas o a la salinidad. Los datos proporcionados por microarreglos y RNAseq hechos en plantas bajo diversas condiciones experimentales pueden suministrar información importante y robusta acerca de la expresión de los genes de interés y pueden servir para plantear nuevas hipótesis de trabajo. En la actualidad, la base de datos existente es extensa y variada. Los datos publicados pueden estar crudos, procesados y también de ambas formas. Como consecuencia, realizar análisis con herramientas convencionales como tablas Excel es complejo y lento, pudiendo cometer múltiples errores en los numerosos pasos del proceso. El objetivo del siguiente trabajo es analizar la familia de proteínas B-box mediante el software R en microarreglos y RNAseq de plantas en distintas condiciones experimentales.
Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativa
description Las proteínas B-box de Arabidopsis thaliana constituyen una familia de 32 miembros (BBX1 a BBX32) que están implicadas en múltiples procesos a lo largo de toda la vida de la planta. Participan en procesos de desetiolación, floración y germinación entre otros. También, actúan en respuestas ambientales como en las respuestas a la percepción de plantas vecinas o a la salinidad. Los datos proporcionados por microarreglos y RNAseq hechos en plantas bajo diversas condiciones experimentales pueden suministrar información importante y robusta acerca de la expresión de los genes de interés y pueden servir para plantear nuevas hipótesis de trabajo. En la actualidad, la base de datos existente es extensa y variada. Los datos publicados pueden estar crudos, procesados y también de ambas formas. Como consecuencia, realizar análisis con herramientas convencionales como tablas Excel es complejo y lento, pudiendo cometer múltiples errores en los numerosos pasos del proceso. El objetivo del siguiente trabajo es analizar la familia de proteínas B-box mediante el software R en microarreglos y RNAseq de plantas en distintas condiciones experimentales.
publishDate 2018
dc.date.none.fl_str_mv 2018-09
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/conferenceObject
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
Resumen
http://purl.org/coar/resource_type/c_5794
info:ar-repo/semantics/documentoDeConferencia
format conferenceObject
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/72794
url http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/72794
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://47jaiio.sadio.org.ar/sites/default/files/LatinR_57.pdf
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/issn/2618-3196
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/
Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported (CC BY-SA 3.0)
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/
Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported (CC BY-SA 3.0)
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:SEDICI (UNLP)
instname:Universidad Nacional de La Plata
instacron:UNLP
reponame_str SEDICI (UNLP)
collection SEDICI (UNLP)
instname_str Universidad Nacional de La Plata
instacron_str UNLP
institution UNLP
repository.name.fl_str_mv SEDICI (UNLP) - Universidad Nacional de La Plata
repository.mail.fl_str_mv alira@sedici.unlp.edu.ar
_version_ 1844615991157325824
score 13.070432

Publicaciones similares