Integración de datos de expresión génica asociados a líneas celulares de cánceres: un enfoque utilizando la metodología STATIS-ACT, métodos biplot y minería de textos
- Autores
- Zingaretti, María Laura
- Año de publicación
- 2016
- Idioma
- español castellano
- Tipo de recurso
- tesis de maestría
- Estado
- versión publicada
- Colaborador/a o director/a de tesis
- Demey, Jhonny Rafael
- Descripción
- Resumen - Lista de guras - Lista de tablas - Introducción - Objetivo general - Objetivos especícos - 1. Marco Teórico - 1.1 Nuevas perspectivas en la investigación sobre cáncer - 1.2 Análisis de datos económicos - 1.2.1 Normalización de datos - 1.3 Ontología de genes 1.4 Los métodos de k-tablas - 1.4.1 STATIS - 1.4.1.1 Interestructura - 1.4.1.2 Compromiso - 1.4.1.3 Intraestructura - 1.4.2 STATIS-Dual - 1.4.2.1 Interestructura - 1.4.2.2 Compromiso - 1.4.2.3 Intraestructura - 1.4.3 Análisis Parcial Triádico - 1.5 Medidas de calidad de representación - 1.5.1 Calidad de representación de las tablas - 1.5.2 Calidad de representación de los individuos - 1.5.3 Calidad de representación de las variables - 1.6 Variabilidad muestral - 1.7 Representación Biplot para medir interacción entre individuos y variables - 1.7.1 Formulación - 1.8 Redes y Grafos - 2. Ilustración de la metodología de análisis: integración de datos económicos provenientes de líneas celulares de cáncer del panel NCI60 - 2.1 Conjunto de Datos NCI60 - 2.2 Procesamiento de Datos - 2.2.1 Análisis de ontologías: integración de datos en una red - 2.3 Resultados - 2.3.1 Interestructura - 2.3.2 Configuración Compromiso - 2.3.3 Proyección de genes usando Biplot - 2.3.4 Selección de genes comunes a todas las tablas usando Biplot - 2.4 Análisis de ontologías: red de relaciones de genes seleccionados y genes activados ante la presencia de distintos tejidos - 2.5 Discusión - Conclusiones - Bibliografía - Anexo
Fil: Zingaretti, María Laura. Universidad Nacional de Córdoba; Argentina.
Los datos económicos, donde se analiza la expresión de miles de genes, proteínas, metabolitos en distintas muestras biológicas, comprenden una gran cantidad de áreas de aplicación y su estudio ha crecido de manera exponencial en los últimos a~nos. La integración de datos es uno de los principales objetivos actuales en bio-ciencias, dado que es común medir expresión simultánea de genes, proteínas y metabolitos o bien tener mediciones de la expresión genética de las mismas muestras en diferentes plataformas de análisis, generando, por lo tanto, distintas fuentes de información. La integración implica el meta-análisis de sus resultados o el análisis simultáneos de los datos originales. En el marco de este trabajo, se realiza una propuesta metodológica para abordar el problema de estudio y comparación de datos genéticos provenientes de distintas plataformas de microarreglos y el problema de selección de genes basada en los métodos estadísticos de k-tablas y Biplot. Se realiza una aplicación de la metodología propuesta a datos de expresión genética de 60 líneas celulares de 9 tipos diferentes de cáncer provenientes de cuatro plataformas de análisis del panel NCI-60.
Fil: Zingaretti, María Laura. Universidad Nacional de Córdoba; Argentina. - Materia
-
Biplot
Datos económicos
Microarreglos
k-tablas
STATIS
STATIS-Dual
Genómica estadística
Cancer - Nivel de accesibilidad
- acceso abierto
- Condiciones de uso
- Repositorio
- Institución
- Universidad Nacional de Córdoba
- OAI Identificador
- oai:rdu.unc.edu.ar:11086/4420
Ver los metadatos del registro completo
id |
RDUUNC_26e46d9a69fa63d8e625b49dcd575924 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:rdu.unc.edu.ar:11086/4420 |
network_acronym_str |
RDUUNC |
repository_id_str |
2572 |
network_name_str |
Repositorio Digital Universitario (UNC) |
spelling |
Integración de datos de expresión génica asociados a líneas celulares de cánceres: un enfoque utilizando la metodología STATIS-ACT, métodos biplot y minería de textosZingaretti, María LauraBiplotDatos económicosMicroarreglosk-tablasSTATISSTATIS-DualGenómica estadísticaCancerResumen - Lista de guras - Lista de tablas - Introducción - Objetivo general - Objetivos especícos - 1. Marco Teórico - 1.1 Nuevas perspectivas en la investigación sobre cáncer - 1.2 Análisis de datos económicos - 1.2.1 Normalización de datos - 1.3 Ontología de genes 1.4 Los métodos de k-tablas - 1.4.1 STATIS - 1.4.1.1 Interestructura - 1.4.1.2 Compromiso - 1.4.1.3 Intraestructura - 1.4.2 STATIS-Dual - 1.4.2.1 Interestructura - 1.4.2.2 Compromiso - 1.4.2.3 Intraestructura - 1.4.3 Análisis Parcial Triádico - 1.5 Medidas de calidad de representación - 1.5.1 Calidad de representación de las tablas - 1.5.2 Calidad de representación de los individuos - 1.5.3 Calidad de representación de las variables - 1.6 Variabilidad muestral - 1.7 Representación Biplot para medir interacción entre individuos y variables - 1.7.1 Formulación - 1.8 Redes y Grafos - 2. Ilustración de la metodología de análisis: integración de datos económicos provenientes de líneas celulares de cáncer del panel NCI60 - 2.1 Conjunto de Datos NCI60 - 2.2 Procesamiento de Datos - 2.2.1 Análisis de ontologías: integración de datos en una red - 2.3 Resultados - 2.3.1 Interestructura - 2.3.2 Configuración Compromiso - 2.3.3 Proyección de genes usando Biplot - 2.3.4 Selección de genes comunes a todas las tablas usando Biplot - 2.4 Análisis de ontologías: red de relaciones de genes seleccionados y genes activados ante la presencia de distintos tejidos - 2.5 Discusión - Conclusiones - Bibliografía - AnexoFil: Zingaretti, María Laura. Universidad Nacional de Córdoba; Argentina.Los datos económicos, donde se analiza la expresión de miles de genes, proteínas, metabolitos en distintas muestras biológicas, comprenden una gran cantidad de áreas de aplicación y su estudio ha crecido de manera exponencial en los últimos a~nos. La integración de datos es uno de los principales objetivos actuales en bio-ciencias, dado que es común medir expresión simultánea de genes, proteínas y metabolitos o bien tener mediciones de la expresión genética de las mismas muestras en diferentes plataformas de análisis, generando, por lo tanto, distintas fuentes de información. La integración implica el meta-análisis de sus resultados o el análisis simultáneos de los datos originales. En el marco de este trabajo, se realiza una propuesta metodológica para abordar el problema de estudio y comparación de datos genéticos provenientes de distintas plataformas de microarreglos y el problema de selección de genes basada en los métodos estadísticos de k-tablas y Biplot. Se realiza una aplicación de la metodología propuesta a datos de expresión genética de 60 líneas celulares de 9 tipos diferentes de cáncer provenientes de cuatro plataformas de análisis del panel NCI-60.Fil: Zingaretti, María Laura. Universidad Nacional de Córdoba; Argentina.Demey, Jhonny Rafael2016-06info:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:ar-repo/semantics/tesisDeMaestriaapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11086/4420spainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositorio Digital Universitario (UNC)instname:Universidad Nacional de Córdobainstacron:UNC2025-09-29T13:42:15Zoai:rdu.unc.edu.ar:11086/4420Institucionalhttps://rdu.unc.edu.ar/Universidad públicaNo correspondehttp://rdu.unc.edu.ar/oai/snrdoca.unc@gmail.comArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:25722025-09-29 13:42:15.968Repositorio Digital Universitario (UNC) - Universidad Nacional de Córdobafalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Integración de datos de expresión génica asociados a líneas celulares de cánceres: un enfoque utilizando la metodología STATIS-ACT, métodos biplot y minería de textos |
title |
Integración de datos de expresión génica asociados a líneas celulares de cánceres: un enfoque utilizando la metodología STATIS-ACT, métodos biplot y minería de textos |
spellingShingle |
Integración de datos de expresión génica asociados a líneas celulares de cánceres: un enfoque utilizando la metodología STATIS-ACT, métodos biplot y minería de textos Zingaretti, María Laura Biplot Datos económicos Microarreglos k-tablas STATIS STATIS-Dual Genómica estadística Cancer |
title_short |
Integración de datos de expresión génica asociados a líneas celulares de cánceres: un enfoque utilizando la metodología STATIS-ACT, métodos biplot y minería de textos |
title_full |
Integración de datos de expresión génica asociados a líneas celulares de cánceres: un enfoque utilizando la metodología STATIS-ACT, métodos biplot y minería de textos |
title_fullStr |
Integración de datos de expresión génica asociados a líneas celulares de cánceres: un enfoque utilizando la metodología STATIS-ACT, métodos biplot y minería de textos |
title_full_unstemmed |
Integración de datos de expresión génica asociados a líneas celulares de cánceres: un enfoque utilizando la metodología STATIS-ACT, métodos biplot y minería de textos |
title_sort |
Integración de datos de expresión génica asociados a líneas celulares de cánceres: un enfoque utilizando la metodología STATIS-ACT, métodos biplot y minería de textos |
dc.creator.none.fl_str_mv |
Zingaretti, María Laura |
author |
Zingaretti, María Laura |
author_facet |
Zingaretti, María Laura |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Demey, Jhonny Rafael |
dc.subject.none.fl_str_mv |
Biplot Datos económicos Microarreglos k-tablas STATIS STATIS-Dual Genómica estadística Cancer |
topic |
Biplot Datos económicos Microarreglos k-tablas STATIS STATIS-Dual Genómica estadística Cancer |
dc.description.none.fl_txt_mv |
Resumen - Lista de guras - Lista de tablas - Introducción - Objetivo general - Objetivos especícos - 1. Marco Teórico - 1.1 Nuevas perspectivas en la investigación sobre cáncer - 1.2 Análisis de datos económicos - 1.2.1 Normalización de datos - 1.3 Ontología de genes 1.4 Los métodos de k-tablas - 1.4.1 STATIS - 1.4.1.1 Interestructura - 1.4.1.2 Compromiso - 1.4.1.3 Intraestructura - 1.4.2 STATIS-Dual - 1.4.2.1 Interestructura - 1.4.2.2 Compromiso - 1.4.2.3 Intraestructura - 1.4.3 Análisis Parcial Triádico - 1.5 Medidas de calidad de representación - 1.5.1 Calidad de representación de las tablas - 1.5.2 Calidad de representación de los individuos - 1.5.3 Calidad de representación de las variables - 1.6 Variabilidad muestral - 1.7 Representación Biplot para medir interacción entre individuos y variables - 1.7.1 Formulación - 1.8 Redes y Grafos - 2. Ilustración de la metodología de análisis: integración de datos económicos provenientes de líneas celulares de cáncer del panel NCI60 - 2.1 Conjunto de Datos NCI60 - 2.2 Procesamiento de Datos - 2.2.1 Análisis de ontologías: integración de datos en una red - 2.3 Resultados - 2.3.1 Interestructura - 2.3.2 Configuración Compromiso - 2.3.3 Proyección de genes usando Biplot - 2.3.4 Selección de genes comunes a todas las tablas usando Biplot - 2.4 Análisis de ontologías: red de relaciones de genes seleccionados y genes activados ante la presencia de distintos tejidos - 2.5 Discusión - Conclusiones - Bibliografía - Anexo Fil: Zingaretti, María Laura. Universidad Nacional de Córdoba; Argentina. Los datos económicos, donde se analiza la expresión de miles de genes, proteínas, metabolitos en distintas muestras biológicas, comprenden una gran cantidad de áreas de aplicación y su estudio ha crecido de manera exponencial en los últimos a~nos. La integración de datos es uno de los principales objetivos actuales en bio-ciencias, dado que es común medir expresión simultánea de genes, proteínas y metabolitos o bien tener mediciones de la expresión genética de las mismas muestras en diferentes plataformas de análisis, generando, por lo tanto, distintas fuentes de información. La integración implica el meta-análisis de sus resultados o el análisis simultáneos de los datos originales. En el marco de este trabajo, se realiza una propuesta metodológica para abordar el problema de estudio y comparación de datos genéticos provenientes de distintas plataformas de microarreglos y el problema de selección de genes basada en los métodos estadísticos de k-tablas y Biplot. Se realiza una aplicación de la metodología propuesta a datos de expresión genética de 60 líneas celulares de 9 tipos diferentes de cáncer provenientes de cuatro plataformas de análisis del panel NCI-60. Fil: Zingaretti, María Laura. Universidad Nacional de Córdoba; Argentina. |
description |
Resumen - Lista de guras - Lista de tablas - Introducción - Objetivo general - Objetivos especícos - 1. Marco Teórico - 1.1 Nuevas perspectivas en la investigación sobre cáncer - 1.2 Análisis de datos económicos - 1.2.1 Normalización de datos - 1.3 Ontología de genes 1.4 Los métodos de k-tablas - 1.4.1 STATIS - 1.4.1.1 Interestructura - 1.4.1.2 Compromiso - 1.4.1.3 Intraestructura - 1.4.2 STATIS-Dual - 1.4.2.1 Interestructura - 1.4.2.2 Compromiso - 1.4.2.3 Intraestructura - 1.4.3 Análisis Parcial Triádico - 1.5 Medidas de calidad de representación - 1.5.1 Calidad de representación de las tablas - 1.5.2 Calidad de representación de los individuos - 1.5.3 Calidad de representación de las variables - 1.6 Variabilidad muestral - 1.7 Representación Biplot para medir interacción entre individuos y variables - 1.7.1 Formulación - 1.8 Redes y Grafos - 2. Ilustración de la metodología de análisis: integración de datos económicos provenientes de líneas celulares de cáncer del panel NCI60 - 2.1 Conjunto de Datos NCI60 - 2.2 Procesamiento de Datos - 2.2.1 Análisis de ontologías: integración de datos en una red - 2.3 Resultados - 2.3.1 Interestructura - 2.3.2 Configuración Compromiso - 2.3.3 Proyección de genes usando Biplot - 2.3.4 Selección de genes comunes a todas las tablas usando Biplot - 2.4 Análisis de ontologías: red de relaciones de genes seleccionados y genes activados ante la presencia de distintos tejidos - 2.5 Discusión - Conclusiones - Bibliografía - Anexo |
publishDate |
2016 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2016-06 |
dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc info:ar-repo/semantics/tesisDeMaestria |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/11086/4420 |
url |
http://hdl.handle.net/11086/4420 |
dc.language.none.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.rights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositorio Digital Universitario (UNC) instname:Universidad Nacional de Córdoba instacron:UNC |
reponame_str |
Repositorio Digital Universitario (UNC) |
collection |
Repositorio Digital Universitario (UNC) |
instname_str |
Universidad Nacional de Córdoba |
instacron_str |
UNC |
institution |
UNC |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Digital Universitario (UNC) - Universidad Nacional de Córdoba |
repository.mail.fl_str_mv |
oca.unc@gmail.com |
_version_ |
1844618922541711360 |
score |
13.070432 |