Minería de datos para análisis del microbioma humano

Autores
Santa María, Cristóbal; Santa María, Victoria; Ávila, Laura; López, Luis; Otaegui, Juan Carlos; Soria, Marcelo
Año de publicación
2017
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Se expone la línea de investigación que lleva adelante el Grupo de Investigación y Desarrollo en Data Mining del Departamento de Ingeniería e Investigaciones Tecnológicas de la UNLaM. Se detallan los resultados del proyecto de investigación “Aplicaciones de Data Mining al Estudio del Microbioma Humano”, C169 del Programa de Incentivos. La línea de trabajo intenta aportar procedimientos computacionales adecuados para analizar la relación clínica entre el microbioma intestinal y la presencia de patologías tales como el cáncer de colon y la enfermedad de Crohn. El trabajo hasta aquí realizado comprende la obtención de una muestra de microbiomas de pacientes desde el repositorio de NCBI, la identificación bacteriana a partir del gen marcador y la determinación de la distribución de frecuencias por especies en cada paciente. Se continuó luego con el agrupamiento de pacientes por enterotipos y la evaluación clínica de las categorías obtenidas.
Eje: Bases de datos y Minería de datos.
Red de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI)
Materia
Ciencias Informáticas
microbioma
Clasificación
secuencia
Diagnóstico
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
SEDICI (UNLP)
Institución
Universidad Nacional de La Plata
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