Evolución de la interfaz de consulta de la SfGD : Un puente de entendimiento informático-biológico

• Autores: Pons, Alfonso; Reynares, Claudia; Angelone, Laura; Fernández, Paula; Bulacio, Pilar; Paniego, Norma; Tapia, Elizabeth
• Año de publicación: 2010
• Idioma: español castellano
• Tipo de recurso: documento de conferencia
• Materia: Ciencias Informáticas; Base de Datos; Comunicación informático-biólogo; Girasol; EST; Database; interface informatics-biologic; sunflower
• Institución: Universidad Nacional de La Plata

La base de datos SfGD (Sunflower Genomic Database) fue diseñada para almacenar, gestionar y consultar información genómica de ESTs de girasol dentro del marco de un proyecto llevado a cabo en INTA Castelar. Inicialmente los datos biológicos fueron registrados en una base de datos Access, recurso válido pero acotado por el enorme volumen de datos biológicos derivados de los estudios actuales. La ventaja de una base de datos radica en almacenar grandes volúmenes de datos en forma organizada. El biólogo expresa los resultados de su investigación "en un lenguaje" "con terminología específica" desconocida o poco conocida por los informáticos no avezados en la Biología. El informático logra abstraerse de la realidad para desarrollar un programa en un lenguaje sintáctica y semánticamente diferente al que maneja el biólogo. Esto genera un distanciamiento entre ambos que afecta a la aplicación desarrollada. Sin embargo, el informático debe interiorizarse de la dinámica de los datos biológicos para poder construir un gestor que a modo de puente permita unir ambas ciencias. En este trabajo presentamos la evolución de la interfaz que se utilizó para consultas en la base de datos SfGD, arribando a una interfaz que permite consultar la base en un lenguaje coloquial y menos técnico, sabiendo que esta herramienta será, en un futuro cercano, un recurso de acceso público para la comunidad científico/académica interesada en consultar información molecular asociada a esta especie de interés agronómico.
The SfGD (Sunflower Genomic Database) was designed to store, management and consult sunflower ESTs genomic information, within the framework of a project carried out at INTA Castelar. At the beginning the biological data was stored in an Access database, a valid but restricted resource due to the enormous amount of data coming from current research. The advantage of a database lies on the capacity to store large amounts of data in an organized way. The biologists express the results of their investigations in “a language with specific terminology” unknown for the informatics. The informatics manages to abstract way to develop a program with a language syntactically and semantically different from the one used by the biologist. This situation generates a gap between both professionals that affects the developed application. However, the informatics must embrace the biological data dynamics in order to build a program that works as a bridge between both sciences. In this work we introduce the evolution of the interface utilized to consult the SfGD. Arriving to an interface that allows consulting in a more colloquial and less technical language, knowing that this tool will be, in a close future, a public access resource for the scientific/academic community interested in consulting molecular information related to this species of agronomical interest.
Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativa