Integración de bases de datos bioinformáticas a la plataforma Multiomix, para mejorar la interpretación de potencíales biomarcadores oncológicos

Autores
Bebczuk, Franco
Año de publicación
2023
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis de grado
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Pons, Claudia Fabiana
Descripción
En el marco de la plataforma Multiomix,que tiene por objetivo acelerar la identificación y validación de biomarcadores en cáncer, el presente trabajo resolvió la necesidad de que los investigadores (usuarios de Multiomix) puedan disponer de información médica y molecular detallada durante la interpretación de los hallazgos. Esta etapa de interpretación es clave como complemento de los tests estadísticos que ofrece la plataforma. Para abordar este trabajo, se investigaron diferentes bases de datos y aplicaciones bioinformáticas como Gene Ontology, PharmGKB, STRING y Drugbank, para luego realizar la descarga, curación, transformación de la estructura para optimizar los accesos requeridos y exposición de la funcionalidad a través de una API.
Asesor profesional: Matías Butti
Licenciado en Sistemas
Universidad Nacional de La Plata
Facultad de Informática
Materia
Informática
Bioinformática
ingeniería de datos
API REST
Enriquecimiento de Datos
Estudios Omicos
Bases de Datos
Cáncer
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
SEDICI (UNLP)
Institución
Universidad Nacional de La Plata
OAI Identificador
oai:sedici.unlp.edu.ar:10915/162231
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