Monitoreo de la circulación de virus respiratorios en el período inter-olas de sars-Cov-2 en el contexto de la pandemia de Covid-19

• Autores: Scheffer, Jessica Noelia
• Año de publicación: 2024
• Idioma: español castellano
• Tipo de recurso: tesis doctoral
• Colaborador/a o director/a de tesis: Castro, Gonzalo; Masachessi, Gisela; Sicilia Don, Paola E.; Nates, Silvia Viviana; Barbás, María G.; Isa, María Beatriz; Ferreyra, Leonardo
• Materia: Covid 19; Virología; Enfermedades Respiratorias
• Institución: Universidad Nacional de Córdoba

Trabajo Integrador Final (Especialista en Virología) - - Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas, 2024.
Fil: Scheffer, Jessica Noelia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Virología "Dr. JM Vanella"; Argentina.
Las infecciones respiratorias agudas constituyen una importante causa de morbimortalidad, fundamentalmente en niños menores de 5 años, en personas mayores de 65 años y en individuos que presentan comorbilidades. Si bien los algoritmos nacionales de vigilancia de virus respiratorios del año 2020 sugerían iniciar el diagnóstico diferencial para virus influenza, la contingencia por SARS-CoV-2 dirigió los esfuerzos a la detección activa de casos de COVID-19, generando un déficit en la vigilancia de otros virus respiratorios. El objetivo del presente trabajo fue monitorear la circulación de virus respiratorios en el periodo inter-olas de SARS-CoV-2 en el contexto de la pandemia de COVID-19. Se seleccionaron muestras de aspirado nasofaríngeo (ANF) e hisopado orofaríngeo (HOF) de pacientes pediátricos y adultos, respectivamente, con resultado negativo para SARS-CoV-2, tomadas en los periodos inter-olas de COVID-19 (julio-agosto y octubre-noviembre de 2021). La extracción de ácidos nucleicos se realizó en plataforma automatizada y la detección de los diferentes agentes virales (Influenza A y B, RSV, PIV, hMPV, HAdV y HCoV 229E, OC43, HKU y NL63) por PCR en tiempo real utilizando reactivos comerciales. Las muestras positivas para HAdV se secuenciaron para identificar la cepa infectante. Se analizaron 332 muestras: 90 muestras de ANF del periodo julio-agosto y 242 muestras del periodo octubre-noviembre (142 ANF y 100 HOF). En el periodo julio-agosto, 6,7% (6/90) de los pacientes estudiados resultó positivo para alguno de los HCoV estudiados [83,3% (5/6) para OC43 y 16,7% (1/6) para 229E]. En el periodo octubre-noviembre, 21,9% (53/242) de los pacientes estudiados [67,9% (36/53) pediátricos y 32,1% (17/53) adultos] resultó positivo para alguno de los agentes virales estudiados. De los 36 pacientes pediátricos, 18 (50,0%) resultaron positivos para PIV, 9 (25,0%) para RSV, 5 (13,9%) para HAdV, 3 (8,3%) para HCoV OC43 y 1 (2,8%) presentó coinfección HAdV/HCoV OC43. De los 17 pacientes adultos, 7 (41,2%) resultaron positivos para PIV, 6 (35,3%) para HCoV OC43, 3 (17,6%) para HCoV 229E y 1 (5,9%) para RSV. Los signos/síntomas reportados con mayor frecuencia fueron tos y fiebre, odinofagia, dificultad respiratoria, diarrea y vómitos y secreción nasal. En 3/6 muestras positivas para HAdV fue posible definir serotipo y especie, detectando los serotipos 1, 2 y 5 de la especie C. Si bien la notificación de casos de otras infecciones respiratorias en el año 2021 fue afectada por la pandemia de COVID-19, la vigilancia epidemiológica de las IRAs resulta esencial para detectar precozmente el ascenso estacional en el número de casos, la ocurrencia de eventos inusitados, la identificación de los grupos poblacionales afectados, y la frecuencia, distribución y características de los agentes etiológicos responsables de los mismos.
2026-09-30
Fil: Scheffer, Jessica Noelia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Virología "Dr. JM Vanella"; Argentina.