Model human clonal hematopoiesis : using the CRISPR/Cas9 system

Autores
Lo, Yi-Hsuan
Año de publicación
2019
Idioma
inglés
Tipo de recurso
tesis de maestría
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Roth, Berta
Wäsch, Ralph
Ranuncolo, Stella
Pereyra-Bonnet, Federico
Aktories, Klaus
Descripción
Hematopoietic malignancies are genetically complex diseases in which the serial acquisition of somatic mutations results in clonal diversity of hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs). This progressive event where clonal expansion and selection involved in clonal dynamics of HSPCs is called clonal hematopoiesis of indeterminate potential (CHIP). CHIP increases with age and can be found in 10% of the elderly. CHIP is associated with an increased risk to develop myelodysplastic syndrome (MDS) or acute myeloid leukemia (AML). In this study, we used CRISPR/Cas9 genome engineering in cell lines and primary human cells to introduce somatic mutations in the driver genes STAG2 and TP53 with the final goal to generate in vitro models of clonal hematopoiesis in primary adult CD34+ human HSPCs. We will use these models to further evaluate the underlying mechanism of clonal hematopoiesis and potential transformation into hematological malignancies related to dysregulation of the cell cycle, increased genomic alterations and chromosomal instability.
Fil: Lo, Yi-Hsuan. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina
Las enfermedades malignas hematopoyéticas son enfermedades genéticamente complejas en las que la adquisición en serie de mutaciones somáticas da como resultado la diversidad clonal de células madre y progenitoras hematopoyéticas (HSPCs). Este evento progresivo donde la expansión y selección clonal involucrada en la dinámica clonal de HSPCs se llama hematopoyesis clonal de potencial indeterminado (CHIP). CHIP aumenta con la edad y se puede encontrar en el 10% de los ancianos. CHIP se asocia con un mayor riesgo de desarrollar síndrome mielodisplásico (MDS) o leucemia mieloide aguda (AML). En este estudio, utilizamos la ingeniería del genoma CRISPR/Cas9 en líneas celulares y células humanas primarias para introducir mutaciones somáticas en los genes controladores STAG2 y TP53 con el objetivo final de generar modelos in vitro de hematopoyesis clonal en adultos adultos CD34+ HSPCs humanos. Utilizaremos estos modelos para evaluar más a fondo el mecanismo subyacente de la hematopoyesis clonal y la posible transformación en tumores malignos hematológicos relacionados con la desregulación del ciclo celular, el aumento de las alteraciones genómicas y la inestabilidad cromosómica.
Magíster de la Universidad de Buenos Aires en Ciencias Biomédicas
Materia
Clonal hematopoiesis
CRISPR/Cas9
Ciencias de la vida
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires
Institución
Universidad de Buenos Aires
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Fil: Lo, Yi-Hsuan. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina
Las enfermedades malignas hematopoyéticas son enfermedades genéticamente complejas en las que la adquisición en serie de mutaciones somáticas da como resultado la diversidad clonal de células madre y progenitoras hematopoyéticas (HSPCs). Este evento progresivo donde la expansión y selección clonal involucrada en la dinámica clonal de HSPCs se llama hematopoyesis clonal de potencial indeterminado (CHIP). CHIP aumenta con la edad y se puede encontrar en el 10% de los ancianos. CHIP se asocia con un mayor riesgo de desarrollar síndrome mielodisplásico (MDS) o leucemia mieloide aguda (AML). En este estudio, utilizamos la ingeniería del genoma CRISPR/Cas9 en líneas celulares y células humanas primarias para introducir mutaciones somáticas en los genes controladores STAG2 y TP53 con el objetivo final de generar modelos in vitro de hematopoyesis clonal en adultos adultos CD34+ HSPCs humanos. Utilizaremos estos modelos para evaluar más a fondo el mecanismo subyacente de la hematopoyesis clonal y la posible transformación en tumores malignos hematológicos relacionados con la desregulación del ciclo celular, el aumento de las alteraciones genómicas y la inestabilidad cromosómica.
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description Hematopoietic malignancies are genetically complex diseases in which the serial acquisition of somatic mutations results in clonal diversity of hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs). This progressive event where clonal expansion and selection involved in clonal dynamics of HSPCs is called clonal hematopoiesis of indeterminate potential (CHIP). CHIP increases with age and can be found in 10% of the elderly. CHIP is associated with an increased risk to develop myelodysplastic syndrome (MDS) or acute myeloid leukemia (AML). In this study, we used CRISPR/Cas9 genome engineering in cell lines and primary human cells to introduce somatic mutations in the driver genes STAG2 and TP53 with the final goal to generate in vitro models of clonal hematopoiesis in primary adult CD34+ human HSPCs. We will use these models to further evaluate the underlying mechanism of clonal hematopoiesis and potential transformation into hematological malignancies related to dysregulation of the cell cycle, increased genomic alterations and chromosomal instability.
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