Genotipificación de mutaciones frecuentes en pacientes con hipoacusia no sindrómica

Autores
Pace, Mariela Vanina
Año de publicación
2023
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis de maestría
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Dalamón, Viviana
Fernández, Cecilia Soledad
López Nigro, Marcela
Surace, Ezequiel
Descripción
Hearing loss is the most common sensorineural disorder and congenital defect in developed countries, affecting 5% of the global population. The purpose of this study is to establish the presence of the most frequent variants in GJB2 and GJB6 genes in patients with non-syndromic hearing loss. In those who are heterozygous, the study will be broadened by analyzing non-frequent variants in GJB6 gene and in splicing sites of GJB2 gene. Fifty samples are analyzed from patients referred from several Otolaryngology, Genetics and Phonoaudiology Services and samples from the laboratory's archives, resulting in a total of 84 samples studied. Several molecular biology methodologies are used, such as Sequencing-PCR, GAP-PCR and RFLP-PCR.\nPathogenic variants in both alleles are detected in 12 of the 84 samples studied (14%), heterozygous genotypes are identified in 47 (56%), while 25 left remain undiagnosed (30%). Variant c.35delG in GJB2 gene resulted the most frequent mutated allele in the diagnosed patients, representing 58%, followed by variants in GJB2 gene c.59T>C p.Ile20Thr and c.101T>C p.Met34Thr (8% each). The remaining variants are 4% each. In conclusion, the techniques used show that 12 patients out of the 84 studied with non-syndromic hearing loss present pathogenic variants in genes that codify proteins of inner ear expression. The initial screening for variants in GJB2 and GJB6 genes is a suitable practice with excellent diagnostic yields.
Fil: Pace, Mariela Vanina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina
La pérdida auditiva es el defecto congénito y desorden neurosensorial más frecuente en los países desarrollados, afectando al 5% de la población mundial. El propósito del presente trabajo consiste en establecer la presencia de las variantes más frecuentes en los genes GJB2 y GJB6 en pacientes con hipoacusia no sindrómica. En aquellos que resultaran heterocigotas, ampliar el estudio analizando variantes poco frecuentes en el gen GJB6 y variantes en los sitios de splicing del gen GJB2. Para ello se trabaja con 50 muestras de pacientes derivados de distintos servicios de Otorrinolaringología, Genética y Fonoaudiología y muestras de archivo del laboratorio, resultando un total de 84 muestras estudiadas. Se utilizan distintas metodologías de biología molecular, como PCR-secuenciación, PCR-GAP y PCR-RFLP.\nDel total de las 84 muestras estudiadas, se detectan variantes patogénicas en ambos alelos en 12 de ellas (14%), en 47 se identifican genotipos heterocigotas (56%), permaneciendo las 25 restantes, sin diagnóstico (30%). El alelo mutado más frecuente en los pacientes diagnosticados es el c.35delG en el gen GJB2, representando el 58%, le siguen con un 8% cada uno las variantes c.59T>C p.Ile20Thr y c.101T>C p.Met34Thr, ambas en el gen GJB2. Las restantes corresponden a un 4% cada una. En conclusión las técnicas utilizadas permiten evidenciar que 12 pacientes de los 84 estudiados, con hipoacusia no sindrómica presentan variantes patogénicas en genes que codifican para proteínas de expresión en el oído interno. La pesquisa inicial de variantes en los genes GJB2 y GJB6, es una práctica robusta y con excelentes réditos diagnósticos.
Magíster de la Universidad de Buenos Aires en Biología Molecular Médica
Materia
Hipoacusia
Oido interno
DFNB1
Conexina 26
Conexina 30
GJB2
GJB6
Hearing loss
Hearing impairment
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Ciencias de la vida
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires
Institución
Universidad de Buenos Aires
OAI Identificador
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Fil: Pace, Mariela Vanina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina
La pérdida auditiva es el defecto congénito y desorden neurosensorial más frecuente en los países desarrollados, afectando al 5% de la población mundial. El propósito del presente trabajo consiste en establecer la presencia de las variantes más frecuentes en los genes GJB2 y GJB6 en pacientes con hipoacusia no sindrómica. En aquellos que resultaran heterocigotas, ampliar el estudio analizando variantes poco frecuentes en el gen GJB6 y variantes en los sitios de splicing del gen GJB2. Para ello se trabaja con 50 muestras de pacientes derivados de distintos servicios de Otorrinolaringología, Genética y Fonoaudiología y muestras de archivo del laboratorio, resultando un total de 84 muestras estudiadas. Se utilizan distintas metodologías de biología molecular, como PCR-secuenciación, PCR-GAP y PCR-RFLP.\nDel total de las 84 muestras estudiadas, se detectan variantes patogénicas en ambos alelos en 12 de ellas (14%), en 47 se identifican genotipos heterocigotas (56%), permaneciendo las 25 restantes, sin diagnóstico (30%). El alelo mutado más frecuente en los pacientes diagnosticados es el c.35delG en el gen GJB2, representando el 58%, le siguen con un 8% cada uno las variantes c.59T>C p.Ile20Thr y c.101T>C p.Met34Thr, ambas en el gen GJB2. Las restantes corresponden a un 4% cada una. En conclusión las técnicas utilizadas permiten evidenciar que 12 pacientes de los 84 estudiados, con hipoacusia no sindrómica presentan variantes patogénicas en genes que codifican para proteínas de expresión en el oído interno. La pesquisa inicial de variantes en los genes GJB2 y GJB6, es una práctica robusta y con excelentes réditos diagnósticos.
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