Caracterización de poblaciones nativas de maíz mediante análisis de procrustes generalizado y análisis factorial múltiple

Autores
Zuliani, Paola; Bramardi, Sergio; Lavalle, Andrea; Defacio, Raquel Alicia
Año de publicación
2012
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
El establecimiento de relaciones entre taxones es un paso esencial en el proceso de catalogación y evaluación del material conservado en un Banco de Germoplasma. Existen distintos métodos de evaluación en función del tipo de caracteres estudiados. Cuando el registro de caracteres se repite en el tiempo y en distintos ambientes, se debe separar la variabilidad intrínsecamente genética entre los taxones de aquella que se debe al ambiente, y más aún, de la posible variabilidad debida a la interacción genotipo*ambiente para el posterior establecimiento de relaciones puramente filogenéticas. En el presente trabajo se estudia comparativamente la factibilidad de aplicación de dos estrategias de análisis estadístico para dar solución a este problema. La primera corresponde al análisis tradicional donde se realiza un Análisis de Componentes Principales sobre los caracteres promedios a lo largo de los diferentes ambientes; y la segunda son métodos más complejos en los cuales cada dato es originado por tres modos: individuos, variables y condiciones ambientales, tales como el Análisis Factorial Múltiple y el Análisis de Procrustes Generalizado. Si bien las configuraciones resultantes fueron todas equivalentes, los métodos de tres vías permiten la interpretación de la interacción genotipo*ambiente.
The establishment of relationships among taxa is an essential step in the process of cataloging and evaluation of material conserved in a germplasm bank. There are several evaluation methods according to the types of the characters in the study. When the registration of the characters should be repeated in diverse environments and times, it is necessary to separate the genetic variability of the taxa from the variability dueto the environment, and from the possible genotype*environment interaction variability. Consequently, pure phylogenetic relationships may be established. In this work, the feasibility of application of two strategies of statistical analysis to give solution to this problem is studied comparatively. The first one is a traditional Principal Component Analysis applied on the average characters. The second one is a set of more complex methods where each datum is originated by three ways: individuals, variables and environmental conditions, as the Multiple Factorial Analysis and the Generalized Procrustes Analysis. While the resulting configurations were all equivalent, three-way methods allow the interpretation of genotype*environment.
Estación Experimental Agropecuaria Pergamino
Fil: Zuliani, Paola. Universidad Nacional del Comahue. Facultad de Economía y Administración. Departamento de Estadística; Argentina.
Fil: Bramardi, Sergio. Universidad Nacional del Comahue. Facultad de Economía y Administración. Departamento de Estadística; Argentina.
Fil: Bramardi, Sergio. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Departamento de Ciencias Exactas; Argentina.
Fil: Lavalle, Andrea. Universidad Nacional del Comahue. Facultad de Economía y Administración. Departamento de Estadística; Argentina.
Fil: Defacio, Raquel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino; Argentina
Fuente
Revista de la Facultad de Ciencias Agrarias / Universidad Nacional de Cuyo 44 (1) : 49-64. (2012)
Materia
Banco de Germoplasma
Interacción Genotipo Ambiente
Variación Genética
Filogenia
Organismos Indígenas
Germplasm Banks
Genotype Environment Interaction
Genetic Variation
Phylogeny
Indigenous Organisms
Análisis Factorial Múltiple
Análisis De Procrustes Generalizado
Relaciones Filogenéticas
Plantas Nativas
Especies Nativas
Multiple Factorial Analysis
Generalized Procrustes Analysis
Phylogenetic Relationships
Native Plants
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
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Cuando el registro de caracteres se repite en el tiempo y en distintos ambientes, se debe separar la variabilidad intrínsecamente genética entre los taxones de aquella que se debe al ambiente, y más aún, de la posible variabilidad debida a la interacción genotipo*ambiente para el posterior establecimiento de relaciones puramente filogenéticas. En el presente trabajo se estudia comparativamente la factibilidad de aplicación de dos estrategias de análisis estadístico para dar solución a este problema. La primera corresponde al análisis tradicional donde se realiza un Análisis de Componentes Principales sobre los caracteres promedios a lo largo de los diferentes ambientes; y la segunda son métodos más complejos en los cuales cada dato es originado por tres modos: individuos, variables y condiciones ambientales, tales como el Análisis Factorial Múltiple y el Análisis de Procrustes Generalizado. Si bien las configuraciones resultantes fueron todas equivalentes, los métodos de tres vías permiten la interpretación de la interacción genotipo*ambiente.The establishment of relationships among taxa is an essential step in the process of cataloging and evaluation of material conserved in a germplasm bank. There are several evaluation methods according to the types of the characters in the study. When the registration of the characters should be repeated in diverse environments and times, it is necessary to separate the genetic variability of the taxa from the variability dueto the environment, and from the possible genotype*environment interaction variability. Consequently, pure phylogenetic relationships may be established. In this work, the feasibility of application of two strategies of statistical analysis to give solution to this problem is studied comparatively. The first one is a traditional Principal Component Analysis applied on the average characters. The second one is a set of more complex methods where each datum is originated by three ways: individuals, variables and environmental conditions, as the Multiple Factorial Analysis and the Generalized Procrustes Analysis. While the resulting configurations were all equivalent, three-way methods allow the interpretation of genotype*environment.Estación Experimental Agropecuaria PergaminoFil: Zuliani, Paola. Universidad Nacional del Comahue. Facultad de Economía y Administración. Departamento de Estadística; Argentina.Fil: Bramardi, Sergio. Universidad Nacional del Comahue. Facultad de Economía y Administración. Departamento de Estadística; Argentina.Fil: Bramardi, Sergio. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Departamento de Ciencias Exactas; Argentina.Fil: Lavalle, Andrea. Universidad Nacional del Comahue. Facultad de Economía y Administración. Departamento de Estadística; Argentina.Fil: Defacio, Raquel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino; ArgentinaFacultad de Ciencias Agrarias, Universidad Nacional de Cuyo2021-09-17T11:26:05Z2021-09-17T11:26:05Z2012info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/10285https://bdigital.uncu.edu.ar/app/navegador/?idobjeto=44870370-46611853-8665 (digital)Revista de la Facultad de Ciencias Agrarias / Universidad Nacional de Cuyo 44 (1) : 49-64. 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The establishment of relationships among taxa is an essential step in the process of cataloging and evaluation of material conserved in a germplasm bank. There are several evaluation methods according to the types of the characters in the study. When the registration of the characters should be repeated in diverse environments and times, it is necessary to separate the genetic variability of the taxa from the variability dueto the environment, and from the possible genotype*environment interaction variability. Consequently, pure phylogenetic relationships may be established. In this work, the feasibility of application of two strategies of statistical analysis to give solution to this problem is studied comparatively. The first one is a traditional Principal Component Analysis applied on the average characters. The second one is a set of more complex methods where each datum is originated by three ways: individuals, variables and environmental conditions, as the Multiple Factorial Analysis and the Generalized Procrustes Analysis. While the resulting configurations were all equivalent, three-way methods allow the interpretation of genotype*environment.
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