Estudio de la variabilidad genética de Brucella melitensis en el noroeste de la provincia de San Luis

• Autores: Arregui, Matias Ezequiel
• Año de publicación: 2020
• Idioma: español castellano
• Tipo de recurso: tesis doctoral
• Colaborador/a o director/a de tesis: Samartino, Luis Ernesto (director); Martino, Pablo Eduardo (co-director)
• Materia: Brucella; Brucella melitensis; Genetic Variation; Nannygoats; Genetic Markers; Genotypes; Variación Genética; Cabra; Marcadores Genéticos; Genotipos; San Luis, Argentina
• Institución: Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria

Tesis para obtener el grado de Doctor en Ciencias Veterinarias, de la Universidad Nacional de La Plata, en 2020
Los objetivos del presente trabajo fueron emplear técnicas de genotipificación molecular en un escenario real, describir genotipos circulantes de Brucella melitensis en el noroeste de la provincia de San Luis y poner a prueba la capacidad de discriminación de las técnicas. Con este propósito se identificaron rodeos con diferentes valores de prevalencia de brucelosis mediante técnicas serológicas. A partir de su identificación se procesaron tejidos caprinos y ovinos para obtener aislamientos en pureza de B. melitensis y a su vez, mediante diferentes métodos de extracción de ADN y PCR se evidenció la presencia del patógeno en tejidos. La genotipificación utilizó el ADN proveniente de aislamientos y ADN total de tejidos de animales infectados, sobre los cuales se identificó previamente ADN bacteriano de B. melitensis. Se empleó el esquema MLVA 16, que utiliza la variabilidad de 16 marcadores moleculares para generar una individualización inequívoca de los genomas de B. melitensis provenientes de distintos animales. Los genotipos se analizaron para determinar la relación filogenética entre ellos y se sumaron los datos de georreferenciación de los mismo para tener una información completa sobre la presencia y circulación de distintos genotipos en cada departamento. Este estudio permitió identificar 59 genotipos circulante en los departamentos productores caprinos de la provincia de San Luis. Inclusive el modelo de relación filogenética encontró algunos de los genotipos descriptos como potenciales candidatos a fundadores del linaje que se encuentra distribuido en diferentes áreas de la provincia. Se confirmó la capacidad discriminatoria de la técnica en una situación epidemiológica real, inclusive discriminando genotipos dentro de un mismo rodeo, aun trabajando con ADN proveniente tanto de aislamientos como de ADN total de tejidos proveniente de animales infectados.
The objective of this work was the analysis of the genetic variability of Brucella melitensis in the departments of Libertador General San Martín, Ayacucho and Belgrano that belong to the province of San Luis. For this purpose, rodeos with different prevalence values of brucellosis were identified by serological techniques. Goat and sheep tissues were processed to obtain isolates of B. melitensis and also, the presence of the pathogen in tissues samples was evidenced by different DNA and PCR extraction methods. The MLVA 16 scheme was used, which uses the variability of 16 molecular markers to generate an unequivocal individualization of the genomes of B. melitensis from different animals. The genotypes were analyzed to determine the phylogenetic relationship between them and their georeferenced data were added to have complete information on the presence and circulation of different genotypes in each department. This study allowed to identify 21 circulating genotypes in the goats. Even the phylogenetic relationship model found some of the genotypes described as potential candidates for founders of the lineage that is distributed in different areas of the province. The discriminatory ability of the technique in a real epidemiological situation was confirmed, including discriminating genotypes within the same herd, even working with DNA from both isolates and total DNA from tissues from infected animals. The genotypes from this work were no previously described in any international data base.
Instituto de Patobiología
Fil: Arregui, Matias Ezequiel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patobiología Veterinaria; Argentina
Fil: Arregui, Matias Ezequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina