Analysis of genetic diversity in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis = Análise da diversidade genética em dois plantios de Pinus caribaea var. hondurensis
- Autores
- Schmid, Patricia Griselda; García, Nahuel Martín; Gauchat, Maria Elena; Scherer, Rafael; Reis, Hugo Daniel; Gallo, Leonardo Ariel; Marcucci Poltri, Susana Noemi
- Año de publicación
- 2022
- Idioma
- inglés
- Tipo de recurso
- artículo
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- Forest tree breeding activities in plantations with exotic species implies several instances of material selection where genetic variation can be affected. The objective of the work was to verify the genetic variability present in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis by microsatellite markers, initially designed for Pinus taeda. Thus, 299 individuals were analyzed using eight polymorphic microsatellite markers. The results indicate that both plantations have adequate levels of genetic diversity that are representative of the Pinus genus. Through the Bayesian method, it was possible to detect two different population genetic structure(K = 2) between both plantations analyzed. In conclusion, this study suggests that microsatellites markers are useful tools to monitor genetic variation in genetic breeding programs. The genetic diversity estimated in both plantations is similar and typical for Pinus plantations, and as expected, there was a slight decrease in genetic variability in the commercial plantation in comparation with the base plantation.
As atividades de melhoramento genético florestal em plantios com espécies exóticas envolvem várias instâncias de seleção de material, onde a variação genética pode ser afetada. O objetivo do trabalho foi verificar a variabilidade genética presente em duas plantações de Pinus caribaea var. hondurensis através de marcadores microssatélites, inicialmente desenhados para Pinus taeda. Assim, 299 indivíduos foram analisados utilizando oito marcadores microssatélites polimórficos. Os resultados indicam que ambas plantações têm níveis adequados de diversidade genética que são representativos do gênero Pinus. Através do método Bayesiano, foi possível detectar duas populações genéticas estruturadas (K = 2) entre as duas plantações analisadas. Em conclusão, este estudo sugere que os marcadores microssatélites são ferramentas úteis para monitorar a variação genética nos programas de melhoramento genético. A diversidade genética estimada em ambas plantações é semelhante e típica das plantações de Pinus, e como se esperava verificou-se uma ligeira diminuição da variabilidade genética na plantação comercial, em comparação com a plantação base.
EEA Montecarlo
Fil: Schmid, Patricia Griselda. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; Argentina
Fil: García, Nahuel Martín. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Gauchat, Maria Elena. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; Argentina
Fil: Scherer, Rafael. Empresa PINDÓ S.A., Misiones; Argentina
Fil: Reis, Hugo M. Empresa PINDÓ S.A., Misiones; Argentina
Fil: Gallo, Leonardo Ariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. Área de Recursos Forestales. Unidad de Genética Forestal; Argentina
Fil: Marcucci Poltri, Susana Noemi. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina - Fuente
- Ciência Florestal 32 (4) : 1759–1771 (2022)
- Materia
-
Mejoramiento Genético
Sistemas Agroforestales
Biotecnología Vegetal
Genetic Improvement
Agroforestry Systems
Plant Biotechnology
Pinus caribaea
SSRs
Pino caribea
Caribbean Pine - Nivel de accesibilidad
- acceso abierto
- Condiciones de uso
- http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Repositorio
- Institución
- Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
- OAI Identificador
- oai:localhost:20.500.12123/13493
Ver los metadatos del registro completo
id |
INTADig_7016821ee82bae770b540eac26609cdb |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:localhost:20.500.12123/13493 |
network_acronym_str |
INTADig |
repository_id_str |
l |
network_name_str |
INTA Digital (INTA) |
spelling |
Analysis of genetic diversity in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis = Análise da diversidade genética em dois plantios de Pinus caribaea var. hondurensisSchmid, Patricia GriseldaGarcía, Nahuel MartínGauchat, Maria ElenaScherer, RafaelReis, Hugo DanielGallo, Leonardo ArielMarcucci Poltri, Susana NoemiMejoramiento GenéticoSistemas AgroforestalesBiotecnología VegetalGenetic ImprovementAgroforestry SystemsPlant BiotechnologyPinus caribaeaSSRsPino caribeaCaribbean PineForest tree breeding activities in plantations with exotic species implies several instances of material selection where genetic variation can be affected. The objective of the work was to verify the genetic variability present in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis by microsatellite markers, initially designed for Pinus taeda. Thus, 299 individuals were analyzed using eight polymorphic microsatellite markers. The results indicate that both plantations have adequate levels of genetic diversity that are representative of the Pinus genus. Through the Bayesian method, it was possible to detect two different population genetic structure(K = 2) between both plantations analyzed. In conclusion, this study suggests that microsatellites markers are useful tools to monitor genetic variation in genetic breeding programs. The genetic diversity estimated in both plantations is similar and typical for Pinus plantations, and as expected, there was a slight decrease in genetic variability in the commercial plantation in comparation with the base plantation.As atividades de melhoramento genético florestal em plantios com espécies exóticas envolvem várias instâncias de seleção de material, onde a variação genética pode ser afetada. O objetivo do trabalho foi verificar a variabilidade genética presente em duas plantações de Pinus caribaea var. hondurensis através de marcadores microssatélites, inicialmente desenhados para Pinus taeda. Assim, 299 indivíduos foram analisados utilizando oito marcadores microssatélites polimórficos. Os resultados indicam que ambas plantações têm níveis adequados de diversidade genética que são representativos do gênero Pinus. Através do método Bayesiano, foi possível detectar duas populações genéticas estruturadas (K = 2) entre as duas plantações analisadas. Em conclusão, este estudo sugere que os marcadores microssatélites são ferramentas úteis para monitorar a variação genética nos programas de melhoramento genético. A diversidade genética estimada em ambas plantações é semelhante e típica das plantações de Pinus, e como se esperava verificou-se uma ligeira diminuição da variabilidade genética na plantação comercial, em comparação com a plantação base.EEA MontecarloFil: Schmid, Patricia Griselda. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: García, Nahuel Martín. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Gauchat, Maria Elena. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; ArgentinaFil: Scherer, Rafael. Empresa PINDÓ S.A., Misiones; ArgentinaFil: Reis, Hugo M. Empresa PINDÓ S.A., Misiones; ArgentinaFil: Gallo, Leonardo Ariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. Área de Recursos Forestales. Unidad de Genética Forestal; ArgentinaFil: Marcucci Poltri, Susana Noemi. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaUniversidade Federal de Santa María (UFSM), Brasil2022-11-30T14:28:26Z2022-11-30T14:28:26Z2022-11-23info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/13493https://periodicos.ufsm.br/cienciaflorestal/article/view/409301980-50980103-9954https://doi.org/10.5902/1980509840930Ciência Florestal 32 (4) : 1759–1771 (2022)reponame:INTA Digital (INTA)instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariaenginfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)2025-09-29T13:45:48Zoai:localhost:20.500.12123/13493instacron:INTAInstitucionalhttp://repositorio.inta.gob.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://repositorio.inta.gob.ar/oai/requesttripaldi.nicolas@inta.gob.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:l2025-09-29 13:45:49.27INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariafalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Analysis of genetic diversity in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis = Análise da diversidade genética em dois plantios de Pinus caribaea var. hondurensis |
title |
Analysis of genetic diversity in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis = Análise da diversidade genética em dois plantios de Pinus caribaea var. hondurensis |
spellingShingle |
Analysis of genetic diversity in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis = Análise da diversidade genética em dois plantios de Pinus caribaea var. hondurensis Schmid, Patricia Griselda Mejoramiento Genético Sistemas Agroforestales Biotecnología Vegetal Genetic Improvement Agroforestry Systems Plant Biotechnology Pinus caribaea SSRs Pino caribea Caribbean Pine |
title_short |
Analysis of genetic diversity in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis = Análise da diversidade genética em dois plantios de Pinus caribaea var. hondurensis |
title_full |
Analysis of genetic diversity in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis = Análise da diversidade genética em dois plantios de Pinus caribaea var. hondurensis |
title_fullStr |
Analysis of genetic diversity in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis = Análise da diversidade genética em dois plantios de Pinus caribaea var. hondurensis |
title_full_unstemmed |
Analysis of genetic diversity in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis = Análise da diversidade genética em dois plantios de Pinus caribaea var. hondurensis |
title_sort |
Analysis of genetic diversity in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis = Análise da diversidade genética em dois plantios de Pinus caribaea var. hondurensis |
dc.creator.none.fl_str_mv |
Schmid, Patricia Griselda García, Nahuel Martín Gauchat, Maria Elena Scherer, Rafael Reis, Hugo Daniel Gallo, Leonardo Ariel Marcucci Poltri, Susana Noemi |
author |
Schmid, Patricia Griselda |
author_facet |
Schmid, Patricia Griselda García, Nahuel Martín Gauchat, Maria Elena Scherer, Rafael Reis, Hugo Daniel Gallo, Leonardo Ariel Marcucci Poltri, Susana Noemi |
author_role |
author |
author2 |
García, Nahuel Martín Gauchat, Maria Elena Scherer, Rafael Reis, Hugo Daniel Gallo, Leonardo Ariel Marcucci Poltri, Susana Noemi |
author2_role |
author author author author author author |
dc.subject.none.fl_str_mv |
Mejoramiento Genético Sistemas Agroforestales Biotecnología Vegetal Genetic Improvement Agroforestry Systems Plant Biotechnology Pinus caribaea SSRs Pino caribea Caribbean Pine |
topic |
Mejoramiento Genético Sistemas Agroforestales Biotecnología Vegetal Genetic Improvement Agroforestry Systems Plant Biotechnology Pinus caribaea SSRs Pino caribea Caribbean Pine |
dc.description.none.fl_txt_mv |
Forest tree breeding activities in plantations with exotic species implies several instances of material selection where genetic variation can be affected. The objective of the work was to verify the genetic variability present in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis by microsatellite markers, initially designed for Pinus taeda. Thus, 299 individuals were analyzed using eight polymorphic microsatellite markers. The results indicate that both plantations have adequate levels of genetic diversity that are representative of the Pinus genus. Through the Bayesian method, it was possible to detect two different population genetic structure(K = 2) between both plantations analyzed. In conclusion, this study suggests that microsatellites markers are useful tools to monitor genetic variation in genetic breeding programs. The genetic diversity estimated in both plantations is similar and typical for Pinus plantations, and as expected, there was a slight decrease in genetic variability in the commercial plantation in comparation with the base plantation. As atividades de melhoramento genético florestal em plantios com espécies exóticas envolvem várias instâncias de seleção de material, onde a variação genética pode ser afetada. O objetivo do trabalho foi verificar a variabilidade genética presente em duas plantações de Pinus caribaea var. hondurensis através de marcadores microssatélites, inicialmente desenhados para Pinus taeda. Assim, 299 indivíduos foram analisados utilizando oito marcadores microssatélites polimórficos. Os resultados indicam que ambas plantações têm níveis adequados de diversidade genética que são representativos do gênero Pinus. Através do método Bayesiano, foi possível detectar duas populações genéticas estruturadas (K = 2) entre as duas plantações analisadas. Em conclusão, este estudo sugere que os marcadores microssatélites são ferramentas úteis para monitorar a variação genética nos programas de melhoramento genético. A diversidade genética estimada em ambas plantações é semelhante e típica das plantações de Pinus, e como se esperava verificou-se uma ligeira diminuição da variabilidade genética na plantação comercial, em comparação com a plantação base. EEA Montecarlo Fil: Schmid, Patricia Griselda. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; Argentina Fil: García, Nahuel Martín. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Gauchat, Maria Elena. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Montecarlo; Argentina Fil: Scherer, Rafael. Empresa PINDÓ S.A., Misiones; Argentina Fil: Reis, Hugo M. Empresa PINDÓ S.A., Misiones; Argentina Fil: Gallo, Leonardo Ariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bariloche. Área de Recursos Forestales. Unidad de Genética Forestal; Argentina Fil: Marcucci Poltri, Susana Noemi. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina |
description |
Forest tree breeding activities in plantations with exotic species implies several instances of material selection where genetic variation can be affected. The objective of the work was to verify the genetic variability present in two plantations of Pinus caribaea var. hondurensis by microsatellite markers, initially designed for Pinus taeda. Thus, 299 individuals were analyzed using eight polymorphic microsatellite markers. The results indicate that both plantations have adequate levels of genetic diversity that are representative of the Pinus genus. Through the Bayesian method, it was possible to detect two different population genetic structure(K = 2) between both plantations analyzed. In conclusion, this study suggests that microsatellites markers are useful tools to monitor genetic variation in genetic breeding programs. The genetic diversity estimated in both plantations is similar and typical for Pinus plantations, and as expected, there was a slight decrease in genetic variability in the commercial plantation in comparation with the base plantation. |
publishDate |
2022 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2022-11-30T14:28:26Z 2022-11-30T14:28:26Z 2022-11-23 |
dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 info:ar-repo/semantics/articulo |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/20.500.12123/13493 https://periodicos.ufsm.br/cienciaflorestal/article/view/40930 1980-5098 0103-9954 https://doi.org/10.5902/1980509840930 |
url |
http://hdl.handle.net/20.500.12123/13493 https://periodicos.ufsm.br/cienciaflorestal/article/view/40930 https://doi.org/10.5902/1980509840930 |
identifier_str_mv |
1980-5098 0103-9954 |
dc.language.none.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.rights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0) |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
rights_invalid_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0) |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Santa María (UFSM), Brasil |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Santa María (UFSM), Brasil |
dc.source.none.fl_str_mv |
Ciência Florestal 32 (4) : 1759–1771 (2022) reponame:INTA Digital (INTA) instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria |
reponame_str |
INTA Digital (INTA) |
collection |
INTA Digital (INTA) |
instname_str |
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria |
repository.name.fl_str_mv |
INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria |
repository.mail.fl_str_mv |
tripaldi.nicolas@inta.gob.ar |
_version_ |
1844619171887841280 |
score |
12.559606 |