Bases moleculares de la interacción virus-planta : relación entre genes de defensa, ARNs pequeños y sintomatología

Autores
Conti, Gabriela
Año de publicación
2013
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis doctoral
Estado
versión publicada
Colaborador/a o director/a de tesis
Asurmendi, Sebastian (director)
Descripción
Tesis para obtener el grado de Doctor en el área de Ciencias Agropecuarias, de la Universidad de Buenos Aires, en 2013
Los virus fitopatógenos producen alteraciones en el metabolismo y la fisiología de sus huéspedes provocadas principalmente por alteraciones en la expresión génica durante las infecciones. Numerosos cambios están asociados a respuestas de estrés y defensa y sus efectos secundarios son probablemente causantes de los síntomas. El uso de plantas transgénicas que expresan proteínas virales constituye un sistema útil para estudiar la complejidad de la interacción planta-virus. Con el fin de determinar patrones de expresión génica alterados, se emplearon líneas que expresan proteínas del TMV sin función supresora del silenciamiento: la proteína de cápside mutada (CPT42W), la proteína de movimiento (MP) y una línea co-expresante (MPxCPT42W) que mostró alteraciones morfológicas (semejantes a síntomas) y de acumulación de miARNs. Se realizó un microarreglo para detectar cambios transcripcionales asociados a la coexpresión de CPT42W y MP, utilizando como control una línea isogénica con ambos transgenes silenciados y fenotipo normal (mpxcpT42W*). Se estudiaron procesos biológicos cuyos genes mostraron alteraciones por la co-expresión de CPT42W y MP, focalizando en vías relacionadas a estrés oxidativo, inmunidad innata y vías degradación de ARN. Se demostró que CPT42W y MP modularon la defensa innata de un modo complejo: MP parecería actuar como inductor de defensa, alterando los niveles de ERO y SA mientras que CP jugaría un rol antagónico, inhibiendo la expresión de PR-1 y RDR1. Por otro lado, estudios funcionales en vías de degradación de ARN, demostraron que genes componentes del ARN exosoma, inducidos por la expresión de MP y CPT42W, estarían implicados en la alteración de miARNs y constituirían mecanismos alternativos subyacentes a la generación de síntomas en infecciones virales. Este trabajo constituye un importante aporte al entendimiento de los mecanismos de defensa antiviral y de producción de síntomas, proporcionando herramientas para diseñar nuevas estrategias biotecnológicas de control de virosis en cultivos de interés agronómico.
Phytopathogenic viruses produce alterations in the metabolism and physiology of their hosts, caused largely by changes in gene expression during infection. Most changes are associated to stress and defense responses and side effects probably end up causing disease symptoms. The use of transgenic plants expressing TMV proteins is a useful system for studying the complex plant-virus interaction. In this study we used transgenic tobaccos with the aim of studying alterations in gene expression and defense mechanisms. Lines that express viral proteins without silencing suppressor function were used: a mutated capsid protein (CPT42W), a movement protein (MP) and a coexpressing line (MPxCPT42W); the latter showed morphological alterations (similar to some viral symptoms) and changes in the accumulation of miRNAs. We performed microarray analysis in MPxCPT42W in order to study the differential gene expression patterns resulting from the co-expression of CPT42W and MP. As a control we used an isogenic line with silenced transgenes and a normal phenotype (mpxcpT42W*). The biological processes linked to those genes whose expression was altered by CPT42W and MP were selected. This study demostrated that MP and CPT42W produced stress phenotypes and modulated innate immune defense responses in a complex manner: MP seemed to act as a defense elicitor by impairing ROS production and inducing SA while CP could play an antagonic role by inhibiting PR-1 and RDR1 expression levels. Furthermore, functional studies of RNA decay pathways showed that RNA exosome genes, induced by the expression of MP and CPT42W in tobacco, were implicated in altering miRNAs and could constitute alternative mechanisms underlying the generation of viral disease symptoms. This work contributes to the understanding of antiviral defense mechanisms and symptoms production, providing potential tools for the design of new biotechnological strategies of viral control in agronomically important crops.
Instituto de Biotecnología
Fil: Conti, Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina.
Materia
Enfermedades de las Plantas
Virus de las Plantas
Relaciones Huésped Patógeno
Expresión Génica
Estrés Oxidativo
ARN
Plant Diseases
Plant Viruses
Host Pathogen Relations
Gene Expression
Oxidative Stress
RNA
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
OAI Identificador
oai:localhost:20.500.12123/6158

id INTADig_68d9cd27e582084026aa2d392aa1993b
oai_identifier_str oai:localhost:20.500.12123/6158
network_acronym_str INTADig
repository_id_str l
network_name_str INTA Digital (INTA)
spelling Bases moleculares de la interacción virus-planta : relación entre genes de defensa, ARNs pequeños y sintomatologíaConti, GabrielaEnfermedades de las PlantasVirus de las PlantasRelaciones Huésped PatógenoExpresión GénicaEstrés OxidativoARNPlant DiseasesPlant VirusesHost Pathogen RelationsGene ExpressionOxidative StressRNATesis para obtener el grado de Doctor en el área de Ciencias Agropecuarias, de la Universidad de Buenos Aires, en 2013Los virus fitopatógenos producen alteraciones en el metabolismo y la fisiología de sus huéspedes provocadas principalmente por alteraciones en la expresión génica durante las infecciones. Numerosos cambios están asociados a respuestas de estrés y defensa y sus efectos secundarios son probablemente causantes de los síntomas. El uso de plantas transgénicas que expresan proteínas virales constituye un sistema útil para estudiar la complejidad de la interacción planta-virus. Con el fin de determinar patrones de expresión génica alterados, se emplearon líneas que expresan proteínas del TMV sin función supresora del silenciamiento: la proteína de cápside mutada (CPT42W), la proteína de movimiento (MP) y una línea co-expresante (MPxCPT42W) que mostró alteraciones morfológicas (semejantes a síntomas) y de acumulación de miARNs. Se realizó un microarreglo para detectar cambios transcripcionales asociados a la coexpresión de CPT42W y MP, utilizando como control una línea isogénica con ambos transgenes silenciados y fenotipo normal (mpxcpT42W*). Se estudiaron procesos biológicos cuyos genes mostraron alteraciones por la co-expresión de CPT42W y MP, focalizando en vías relacionadas a estrés oxidativo, inmunidad innata y vías degradación de ARN. Se demostró que CPT42W y MP modularon la defensa innata de un modo complejo: MP parecería actuar como inductor de defensa, alterando los niveles de ERO y SA mientras que CP jugaría un rol antagónico, inhibiendo la expresión de PR-1 y RDR1. Por otro lado, estudios funcionales en vías de degradación de ARN, demostraron que genes componentes del ARN exosoma, inducidos por la expresión de MP y CPT42W, estarían implicados en la alteración de miARNs y constituirían mecanismos alternativos subyacentes a la generación de síntomas en infecciones virales. Este trabajo constituye un importante aporte al entendimiento de los mecanismos de defensa antiviral y de producción de síntomas, proporcionando herramientas para diseñar nuevas estrategias biotecnológicas de control de virosis en cultivos de interés agronómico.Phytopathogenic viruses produce alterations in the metabolism and physiology of their hosts, caused largely by changes in gene expression during infection. Most changes are associated to stress and defense responses and side effects probably end up causing disease symptoms. The use of transgenic plants expressing TMV proteins is a useful system for studying the complex plant-virus interaction. In this study we used transgenic tobaccos with the aim of studying alterations in gene expression and defense mechanisms. Lines that express viral proteins without silencing suppressor function were used: a mutated capsid protein (CPT42W), a movement protein (MP) and a coexpressing line (MPxCPT42W); the latter showed morphological alterations (similar to some viral symptoms) and changes in the accumulation of miRNAs. We performed microarray analysis in MPxCPT42W in order to study the differential gene expression patterns resulting from the co-expression of CPT42W and MP. As a control we used an isogenic line with silenced transgenes and a normal phenotype (mpxcpT42W*). The biological processes linked to those genes whose expression was altered by CPT42W and MP were selected. This study demostrated that MP and CPT42W produced stress phenotypes and modulated innate immune defense responses in a complex manner: MP seemed to act as a defense elicitor by impairing ROS production and inducing SA while CP could play an antagonic role by inhibiting PR-1 and RDR1 expression levels. Furthermore, functional studies of RNA decay pathways showed that RNA exosome genes, induced by the expression of MP and CPT42W in tobacco, were implicated in altering miRNAs and could constitute alternative mechanisms underlying the generation of viral disease symptoms. This work contributes to the understanding of antiviral defense mechanisms and symptoms production, providing potential tools for the design of new biotechnological strategies of viral control in agronomically important crops.Instituto de BiotecnologíaFil: Conti, Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina.Facultad de Agronomía, Universidad de Buenos AiresAsurmendi, Sebastian (director)2019-10-21T14:32:57Z2019-10-21T14:32:57Z2013-03info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:ar-repo/semantics/tesisDoctoralapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/6158http://ri.agro.uba.ar/greenstone3/library/collection/tesis/document/2013contigabrielaspainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)reponame:INTA Digital (INTA)instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria2026-02-05T12:51:55Zoai:localhost:20.500.12123/6158instacron:INTAInstitucionalhttp://repositorio.inta.gob.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://repositorio.inta.gob.ar/oai/requesttripaldi.nicolas@inta.gob.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:l2026-02-05 12:51:56.061INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariafalse
dc.title.none.fl_str_mv Bases moleculares de la interacción virus-planta : relación entre genes de defensa, ARNs pequeños y sintomatología
title Bases moleculares de la interacción virus-planta : relación entre genes de defensa, ARNs pequeños y sintomatología
spellingShingle Bases moleculares de la interacción virus-planta : relación entre genes de defensa, ARNs pequeños y sintomatología
Conti, Gabriela
Enfermedades de las Plantas
Virus de las Plantas
Relaciones Huésped Patógeno
Expresión Génica
Estrés Oxidativo
ARN
Plant Diseases
Plant Viruses
Host Pathogen Relations
Gene Expression
Oxidative Stress
RNA
title_short Bases moleculares de la interacción virus-planta : relación entre genes de defensa, ARNs pequeños y sintomatología
title_full Bases moleculares de la interacción virus-planta : relación entre genes de defensa, ARNs pequeños y sintomatología
title_fullStr Bases moleculares de la interacción virus-planta : relación entre genes de defensa, ARNs pequeños y sintomatología
title_full_unstemmed Bases moleculares de la interacción virus-planta : relación entre genes de defensa, ARNs pequeños y sintomatología
title_sort Bases moleculares de la interacción virus-planta : relación entre genes de defensa, ARNs pequeños y sintomatología
dc.creator.none.fl_str_mv Conti, Gabriela
author Conti, Gabriela
author_facet Conti, Gabriela
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Asurmendi, Sebastian (director)
dc.subject.none.fl_str_mv Enfermedades de las Plantas
Virus de las Plantas
Relaciones Huésped Patógeno
Expresión Génica
Estrés Oxidativo
ARN
Plant Diseases
Plant Viruses
Host Pathogen Relations
Gene Expression
Oxidative Stress
RNA
topic Enfermedades de las Plantas
Virus de las Plantas
Relaciones Huésped Patógeno
Expresión Génica
Estrés Oxidativo
ARN
Plant Diseases
Plant Viruses
Host Pathogen Relations
Gene Expression
Oxidative Stress
RNA
dc.description.none.fl_txt_mv Tesis para obtener el grado de Doctor en el área de Ciencias Agropecuarias, de la Universidad de Buenos Aires, en 2013
Los virus fitopatógenos producen alteraciones en el metabolismo y la fisiología de sus huéspedes provocadas principalmente por alteraciones en la expresión génica durante las infecciones. Numerosos cambios están asociados a respuestas de estrés y defensa y sus efectos secundarios son probablemente causantes de los síntomas. El uso de plantas transgénicas que expresan proteínas virales constituye un sistema útil para estudiar la complejidad de la interacción planta-virus. Con el fin de determinar patrones de expresión génica alterados, se emplearon líneas que expresan proteínas del TMV sin función supresora del silenciamiento: la proteína de cápside mutada (CPT42W), la proteína de movimiento (MP) y una línea co-expresante (MPxCPT42W) que mostró alteraciones morfológicas (semejantes a síntomas) y de acumulación de miARNs. Se realizó un microarreglo para detectar cambios transcripcionales asociados a la coexpresión de CPT42W y MP, utilizando como control una línea isogénica con ambos transgenes silenciados y fenotipo normal (mpxcpT42W*). Se estudiaron procesos biológicos cuyos genes mostraron alteraciones por la co-expresión de CPT42W y MP, focalizando en vías relacionadas a estrés oxidativo, inmunidad innata y vías degradación de ARN. Se demostró que CPT42W y MP modularon la defensa innata de un modo complejo: MP parecería actuar como inductor de defensa, alterando los niveles de ERO y SA mientras que CP jugaría un rol antagónico, inhibiendo la expresión de PR-1 y RDR1. Por otro lado, estudios funcionales en vías de degradación de ARN, demostraron que genes componentes del ARN exosoma, inducidos por la expresión de MP y CPT42W, estarían implicados en la alteración de miARNs y constituirían mecanismos alternativos subyacentes a la generación de síntomas en infecciones virales. Este trabajo constituye un importante aporte al entendimiento de los mecanismos de defensa antiviral y de producción de síntomas, proporcionando herramientas para diseñar nuevas estrategias biotecnológicas de control de virosis en cultivos de interés agronómico.
Phytopathogenic viruses produce alterations in the metabolism and physiology of their hosts, caused largely by changes in gene expression during infection. Most changes are associated to stress and defense responses and side effects probably end up causing disease symptoms. The use of transgenic plants expressing TMV proteins is a useful system for studying the complex plant-virus interaction. In this study we used transgenic tobaccos with the aim of studying alterations in gene expression and defense mechanisms. Lines that express viral proteins without silencing suppressor function were used: a mutated capsid protein (CPT42W), a movement protein (MP) and a coexpressing line (MPxCPT42W); the latter showed morphological alterations (similar to some viral symptoms) and changes in the accumulation of miRNAs. We performed microarray analysis in MPxCPT42W in order to study the differential gene expression patterns resulting from the co-expression of CPT42W and MP. As a control we used an isogenic line with silenced transgenes and a normal phenotype (mpxcpT42W*). The biological processes linked to those genes whose expression was altered by CPT42W and MP were selected. This study demostrated that MP and CPT42W produced stress phenotypes and modulated innate immune defense responses in a complex manner: MP seemed to act as a defense elicitor by impairing ROS production and inducing SA while CP could play an antagonic role by inhibiting PR-1 and RDR1 expression levels. Furthermore, functional studies of RNA decay pathways showed that RNA exosome genes, induced by the expression of MP and CPT42W in tobacco, were implicated in altering miRNAs and could constitute alternative mechanisms underlying the generation of viral disease symptoms. This work contributes to the understanding of antiviral defense mechanisms and symptoms production, providing potential tools for the design of new biotechnological strategies of viral control in agronomically important crops.
Instituto de Biotecnología
Fil: Conti, Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina.
description Tesis para obtener el grado de Doctor en el área de Ciencias Agropecuarias, de la Universidad de Buenos Aires, en 2013
publishDate 2013
dc.date.none.fl_str_mv 2013-03
2019-10-21T14:32:57Z
2019-10-21T14:32:57Z
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
info:ar-repo/semantics/tesisDoctoral
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/20.500.12123/6158
http://ri.agro.uba.ar/greenstone3/library/collection/tesis/document/2013contigabriela
url http://hdl.handle.net/20.500.12123/6158
http://ri.agro.uba.ar/greenstone3/library/collection/tesis/document/2013contigabriela
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Facultad de Agronomía, Universidad de Buenos Aires
publisher.none.fl_str_mv Facultad de Agronomía, Universidad de Buenos Aires
dc.source.none.fl_str_mv reponame:INTA Digital (INTA)
instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
reponame_str INTA Digital (INTA)
collection INTA Digital (INTA)
instname_str Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
repository.name.fl_str_mv INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
repository.mail.fl_str_mv tripaldi.nicolas@inta.gob.ar
_version_ 1856302380648235008
score 13.115731