Identificación, aislamiento y caracterización del virus de artritis y encefalitis caprina en la provincia de Salta

Autores
Dodero, Ana Mariela
Año de publicación
2023
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis doctoral
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Peralta, Andrea Veronica (Directora)
Reina Arias, Ramsés (Co-director)
Descripción
Tesis presentada para optar al título de Doctora de la Universidad de Buenos Aires, en junio de 2023
Los Lentivirus de Pequeños Rumiantes (SRLVs) están presentes en todo el mundo y se ha descrito su presencia en la provincia de Buenos Aires en 2017, sin embargo, se desconoce la extensión de la infección y su importancia en la provincia de Salta. El objetivo del trabajo fue identificar, aislar y caracterizar molecularmente los SRLVs presentes en la provincia de Salta para detectar las estirpes circulantes y desarrollar métodos diagnósticos con los que diseñar planes de control. Se muestrearon 927 animales adultos de 32 hatos distribuidos en tres ecorregiones, Chaco Salteño (CS), Valles y Quebradas Áridas (QA) y Valles Templados (VT), acompañados por una encuesta socioeconómica y productiva de cada lugar. Uno de los establecimientos se utilizó como rebaño experimental para la toma de muestras biológicas, práctica de medidas de manejo y seguimiento clínico de un caso testigo. Se cribaron los hatos con ELISAs indirectos comerciales y se realizaron pruebas de concordancia entre ellos. La seroprevalencia general fue de 8,26% y por ecorregiones fue de 9,17% en CS, 6,48% en QA y 11,35% en VT. Se obtuvieron secuencias de la región gag que permitieron la caracterización molecular de las cepas como subtipo B1, el desarrollo de PCRs diagnósticas específicas y la expresión y purificación de la proteína recombinante vírica p25, seguida de la realización de los primeros pasos en la evaluación de su uso potencial en un ELISA indirecto. Se produjeron y caracterizaron cultivos primarios de origen ovino y caprino y se desafiaron con inóculos virales obteniéndose efectos citopáticos, sin éxito a la hora de aislar estirpes virales infectivas. A partir de los datos de la encuesta, se realizó un análisis de factores de riesgo para la presencia de la infección, hallando un riesgo mayor si el hato no realiza desparasitaciones o emplea ordeñe mecánico y crianza en guachera colectiva. Finalmente, se propuso un protocolo de manejo para el control de los SRLVs basado en la identificación temprana de los animales infectados y elección de los indemnes para la reposición. Los resultados reflejan la presencia de SRLV en la provincia de Salta probablemente derivada de la importación de animales; la importancia de la actividad ganadera en la zona estudiada; y la necesidad de elaborar planes de vigilancia específicos para su control, evitando así la diseminación de la infección.
Small Ruminant Lentiviruses (SRLV) are present worldwide and recently described in Buenos Aires province in 2017, however extension and infection importance in the Salta province is unknown. The aim of the study was to identify, isolate and molecularly characterize the SRLVs present in the Salta province in order to detect the circulating strains and develop diagnostic methods to be applied in control programs. About 927 adult animals were sampled from 32 herds distributed in three ecoregions, Chaco Salteño (CS), Valles y Quebradas áridas (VA) and Valles Templados (VT), together with a socio-economic and productive survey at each site. One of the farms was used as an experimental herd for biological sampling, practice of management measures and clinical follow-up of a control case. Herds were screened with commercial indirect ELISAs and concordance tests were performed. The overall seroprevalence was 8.26% and by ecoregion: 9.17% in CS, 6.48% in VA and 11.35% in VT. Sequences were obtained from the gag region, which allowed the molecular characterization of the strains as a B1 subtype, the development of specific diagnostic PCRs, and the expression and purification of the viral recombinant protein p25, followed by the first steps in the evaluation of its potential use in an indirect ELISA. Primary sheep and goat cultures were produced, characterised and challenged with viral inocula obtaining clear cytopathic effects, but unsuccessful in isolating infective strains. Based on the survey data, risk factor analyses for the presence of the infection were carried out, being more risky if the herd is not dewormed, mechanically milked or collectively bred. Finally, a management protocol was proposed for the control of SRLVs based on the early identification of infected animals and the selection ofuninfected animals for restocking. The results reflect the presence of SRLVs in the Salta province, probably derived from animal importations; the importance of livestock activity in the area studied; and the need to develop specific surveillance plans for SRLV control, thus avoiding the spread of the infection.
Instituto de Investigación Animal del Chaco Semiárido
Fil: Dodero, Ana Mariela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Investigación Animal del Chaco Semiárido; Argentina
Materia
Caprine Arthritis Encephalitis Virus
Lentivirus
Molecular Characterization
Diagnosis
Virus Artritis Encefalitis Caprina
Caracterización Molecular
Diagnóstico
Salta
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
OAI Identificador
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Se muestrearon 927 animales adultos de 32 hatos distribuidos en tres ecorregiones, Chaco Salteño (CS), Valles y Quebradas Áridas (QA) y Valles Templados (VT), acompañados por una encuesta socioeconómica y productiva de cada lugar. Uno de los establecimientos se utilizó como rebaño experimental para la toma de muestras biológicas, práctica de medidas de manejo y seguimiento clínico de un caso testigo. Se cribaron los hatos con ELISAs indirectos comerciales y se realizaron pruebas de concordancia entre ellos. La seroprevalencia general fue de 8,26% y por ecorregiones fue de 9,17% en CS, 6,48% en QA y 11,35% en VT. Se obtuvieron secuencias de la región gag que permitieron la caracterización molecular de las cepas como subtipo B1, el desarrollo de PCRs diagnósticas específicas y la expresión y purificación de la proteína recombinante vírica p25, seguida de la realización de los primeros pasos en la evaluación de su uso potencial en un ELISA indirecto. Se produjeron y caracterizaron cultivos primarios de origen ovino y caprino y se desafiaron con inóculos virales obteniéndose efectos citopáticos, sin éxito a la hora de aislar estirpes virales infectivas. A partir de los datos de la encuesta, se realizó un análisis de factores de riesgo para la presencia de la infección, hallando un riesgo mayor si el hato no realiza desparasitaciones o emplea ordeñe mecánico y crianza en guachera colectiva. Finalmente, se propuso un protocolo de manejo para el control de los SRLVs basado en la identificación temprana de los animales infectados y elección de los indemnes para la reposición. Los resultados reflejan la presencia de SRLV en la provincia de Salta probablemente derivada de la importación de animales; la importancia de la actividad ganadera en la zona estudiada; y la necesidad de elaborar planes de vigilancia específicos para su control, evitando así la diseminación de la infección.Small Ruminant Lentiviruses (SRLV) are present worldwide and recently described in Buenos Aires province in 2017, however extension and infection importance in the Salta province is unknown. The aim of the study was to identify, isolate and molecularly characterize the SRLVs present in the Salta province in order to detect the circulating strains and develop diagnostic methods to be applied in control programs. About 927 adult animals were sampled from 32 herds distributed in three ecoregions, Chaco Salteño (CS), Valles y Quebradas áridas (VA) and Valles Templados (VT), together with a socio-economic and productive survey at each site. One of the farms was used as an experimental herd for biological sampling, practice of management measures and clinical follow-up of a control case. Herds were screened with commercial indirect ELISAs and concordance tests were performed. The overall seroprevalence was 8.26% and by ecoregion: 9.17% in CS, 6.48% in VA and 11.35% in VT. Sequences were obtained from the gag region, which allowed the molecular characterization of the strains as a B1 subtype, the development of specific diagnostic PCRs, and the expression and purification of the viral recombinant protein p25, followed by the first steps in the evaluation of its potential use in an indirect ELISA. Primary sheep and goat cultures were produced, characterised and challenged with viral inocula obtaining clear cytopathic effects, but unsuccessful in isolating infective strains. Based on the survey data, risk factor analyses for the presence of the infection were carried out, being more risky if the herd is not dewormed, mechanically milked or collectively bred. Finally, a management protocol was proposed for the control of SRLVs based on the early identification of infected animals and the selection ofuninfected animals for restocking. The results reflect the presence of SRLVs in the Salta province, probably derived from animal importations; the importance of livestock activity in the area studied; and the need to develop specific surveillance plans for SRLV control, thus avoiding the spread of the infection.Instituto de Investigación Animal del Chaco SemiáridoFil: Dodero, Ana Mariela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Investigación Animal del Chaco Semiárido; ArgentinaFacultad de Ciencias Veterinarias, Universidad de Buenos AiresPeralta, Andrea Veronica (Directora)Reina Arias, Ramsés (Co-director)2024-05-14T18:13:03Z2024-05-14T18:13:03Z2023-06info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:ar-repo/semantics/tesisDoctoralapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/17731spainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)reponame:INTA Digital (INTA)instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria2025-09-29T13:46:31Zoai:localhost:20.500.12123/17731instacron:INTAInstitucionalhttp://repositorio.inta.gob.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://repositorio.inta.gob.ar/oai/requesttripaldi.nicolas@inta.gob.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:l2025-09-29 13:46:32.3INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariafalse
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Small Ruminant Lentiviruses (SRLV) are present worldwide and recently described in Buenos Aires province in 2017, however extension and infection importance in the Salta province is unknown. The aim of the study was to identify, isolate and molecularly characterize the SRLVs present in the Salta province in order to detect the circulating strains and develop diagnostic methods to be applied in control programs. About 927 adult animals were sampled from 32 herds distributed in three ecoregions, Chaco Salteño (CS), Valles y Quebradas áridas (VA) and Valles Templados (VT), together with a socio-economic and productive survey at each site. One of the farms was used as an experimental herd for biological sampling, practice of management measures and clinical follow-up of a control case. Herds were screened with commercial indirect ELISAs and concordance tests were performed. The overall seroprevalence was 8.26% and by ecoregion: 9.17% in CS, 6.48% in VA and 11.35% in VT. Sequences were obtained from the gag region, which allowed the molecular characterization of the strains as a B1 subtype, the development of specific diagnostic PCRs, and the expression and purification of the viral recombinant protein p25, followed by the first steps in the evaluation of its potential use in an indirect ELISA. Primary sheep and goat cultures were produced, characterised and challenged with viral inocula obtaining clear cytopathic effects, but unsuccessful in isolating infective strains. Based on the survey data, risk factor analyses for the presence of the infection were carried out, being more risky if the herd is not dewormed, mechanically milked or collectively bred. Finally, a management protocol was proposed for the control of SRLVs based on the early identification of infected animals and the selection ofuninfected animals for restocking. The results reflect the presence of SRLVs in the Salta province, probably derived from animal importations; the importance of livestock activity in the area studied; and the need to develop specific surveillance plans for SRLV control, thus avoiding the spread of the infection.
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