Caracterización taxonómica y análisis de la variabilidad del agente causal del cancro del tallo de la soja en Buenos Aires (2005/2007)

Autores
Grijalba, Pablo Enrique; Ridao, Azucena del Carmen; Guillin, Eduardo Alejandro
Año de publicación
2011
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
El complejo Diaporthe/Phomopsis es un importante grupo de hongos patógenos de la soja. Dentro del mismo, Diaporthe phaseolorum var. caulivora es uno de los agentes causales del cancro del tallo. Veintitrés aislamientos de este hongo, provenientes de diferentes zonas geográficas de la provincia de Buenos Aires, fueron caracterizados morfológica y genéticamente. Los criterios morfológicos fueron tipo y color de micelio; formación del teleomorfo y/o del anamorfo. La identificación molecular fue llevada a cabo utilizando una técnica de restricción de fragmentos de amplificación (PCR-RFLP) de la región ITS de ADN ribosomal. Adicionalmente, los productos de amplificación fueron secuenciados y comparados con la información de bancos de datos. Los aislamientos presentaron características morfológicas y patogénicas propias de la variedad, y los patrones de restricción con la enzima Alu I fueron concordantes con la identificación morfológica y con la información de secuencias disponibles. Las reconstrucciones filogenéticas apoyan la idea de que D. meridionalis y D. caulivora son entidades biológicamente aisladas. Los resultados obtenidos confirmaron la utilidad del uso del método de PCR-RFLP para la identificación precisa y rápida de D. caulivora. Por sus características, este método puede ser implementado para análisis de rutina en laboratorios de pequeña y mediana escala.
Diaporthe/Phomopsis is an important group of soybean pathogens. Diaporthe phaseolorum var. caulivora is one of the causal agents of stem canker. Twenty three isolates from different regions from the Province of Buenos Aires were morphologically and genetically characterized and assigned to different taxa within the Diaporthe/Phomopsis complex; diagnostic morphological traits were: mycelium type and color, teleomorph/anamorph occurrence. Molecular characterization was carried out using RFLP analyses of PCR-amplified DNA (PCRRFLP) for the Internal Transcribed Spacer (ITS) of the ribosomal DNA (rDNA) region. PCR products were additionally sequenced and compared with information available. All isolates were morphologically assigned to D. phaseolorum var. caulivora; PCR-RFLP patterns with restriction enzyme Alu I were coincident with morphological identification and sequence information. Phylogenetic reconstructions supported the idea that D. caulivora and D. meridionalis constitute biologically isolated entities. Our results validated the use of a single enzyme PCR-RFLP method for fast and accurate identification of D. caulivora. This technique resulted appropriated for routine analysis in small/medium throughput laboratories.
Instituto de Genética
Fil: Grijalba, Pablo Enrique. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía; Argentina
Fil: Ridao, Azucena del Carmen. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
Fil: Guillin, Eduardo Alejandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética; Argentina
Fuente
RIA 37 (3) : 290-297 (diciembre 2011)
Materia
Soja
Enfermedades de las Plantas
Diaporthe phaseolorum
Phomopsis
Identificación
PCR
Soybeans
Plant Diseases
Identification
Cancro del Tallo de las Hojas
Buenos Aires, Argentina
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
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Diaporthe/Phomopsis is an important group of soybean pathogens. Diaporthe phaseolorum var. caulivora is one of the causal agents of stem canker. Twenty three isolates from different regions from the Province of Buenos Aires were morphologically and genetically characterized and assigned to different taxa within the Diaporthe/Phomopsis complex; diagnostic morphological traits were: mycelium type and color, teleomorph/anamorph occurrence. Molecular characterization was carried out using RFLP analyses of PCR-amplified DNA (PCRRFLP) for the Internal Transcribed Spacer (ITS) of the ribosomal DNA (rDNA) region. PCR products were additionally sequenced and compared with information available. All isolates were morphologically assigned to D. phaseolorum var. caulivora; PCR-RFLP patterns with restriction enzyme Alu I were coincident with morphological identification and sequence information. Phylogenetic reconstructions supported the idea that D. caulivora and D. meridionalis constitute biologically isolated entities. Our results validated the use of a single enzyme PCR-RFLP method for fast and accurate identification of D. caulivora. This technique resulted appropriated for routine analysis in small/medium throughput laboratories.
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