Cross-species transfer of SSR markers in Setaria sphacelata and Trichloris crinita sp. = Transferencia cruzada de marcadores SSR en Setaria sphacelata y Trichloris crinita sp.

Autores
Randazzo, Cecilia; Ferri, Andrea Matilde; Carabajal Paladino, Leonela Zusel; Andres, Adriana Noemi; Ingala, Lorena Romina
Año de publicación
2019
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Setaria sphacelata and Trichloris crinita are subtropical forage species that are important for livestock breeding in Argentina. Genomic information is scarce for these species, and there are no molecular markers designed for them; this limits the development of genetic improvement programs. We performed a cross-species transfer of SSR markers from several Poaceae species. In S. sphacelata, 8 SSR markers were transferred from Setaria italica (40% transfer rate), exhibiting 83% polymorphism. Kazungula, Splenda and Narok cultivars were genetically differentiated and the experimental material “Selección INTA” was separated from Narok, from which it was derived. For T. crinita, 19 microsatellites were transferred from 5 Poaceae species (7.3% transfer rate), with 69% polymorphism. The results obtained in this study show the potential of the transferred SSR markers for assessing genetic variation and for expanding the genetic resources available for these species.
Setaria sphacelata y Trichloris crinita son especies forrajeras subtropicales, estratégicas para el desarrollo de la actividad ganadera argentina. Para estas especies, la información genómica es escasa y no existen marcadores moleculares desarrollados en las mismas, por lo cual el desarrollo de programas de mejoramiento genético se ve limitado. En este contexto, realizamos una transferencia de marcadores SSR de varias especies de poáceas. En S. sphacelata, se transfirieron 8 marcadores desarrollados en Setaria italica (tasa de transferencia del 40%), mostrando un 83% de polimorfismo. Los cultivares Kazungula, Splenda y Narok se diferenciaron genéticamente y el material experimental “Selección INTA” se separó de Narok, del cual se deriva. Para T. crinita, se transfirieron 19 microsatélites de 5 especies poáceas (tasa de transferencia del 7.3%), con 69% de polimorfismo. Todos los individuos se pudieron difrenciar genéticamente. Los resultados obtenidos en este trabajo muestran la capacidad de los marcadores SSR transferidos para evaluar la variabilidad genética, expandiendo los recursos genéticos disponibles para estas especies.
Instituto de Genética
Fil: Randazzo, Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética; Argentina
Fil: Ferri, Andrea Matilde. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética; Argentina
Fil: Carabajal Paladino, Leonela Zusel. The Pirbright Institute; Reino Unido
Fil: Andres, Adriana Noemi. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino. Sección Forrajeras; Argentina
Fil: Ingala, Lorena Romina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética; Argentina
Fuente
Agronomía Colombiana 37 (2) : 112-119 (2019)
Materia
Polymorphism
Genetic Variation
Plant Genetic Resources
Feed Crops
Genetic Markers
Polimorfismo
Variación Genética
Recursos Genéticos Vegetales
Plantas Forrajeras
Setaria sphacelata
Marcadores Genéticos
Trichloris crinita
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
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Setaria sphacelata y Trichloris crinita son especies forrajeras subtropicales, estratégicas para el desarrollo de la actividad ganadera argentina. Para estas especies, la información genómica es escasa y no existen marcadores moleculares desarrollados en las mismas, por lo cual el desarrollo de programas de mejoramiento genético se ve limitado. En este contexto, realizamos una transferencia de marcadores SSR de varias especies de poáceas. En S. sphacelata, se transfirieron 8 marcadores desarrollados en Setaria italica (tasa de transferencia del 40%), mostrando un 83% de polimorfismo. Los cultivares Kazungula, Splenda y Narok se diferenciaron genéticamente y el material experimental “Selección INTA” se separó de Narok, del cual se deriva. Para T. crinita, se transfirieron 19 microsatélites de 5 especies poáceas (tasa de transferencia del 7.3%), con 69% de polimorfismo. Todos los individuos se pudieron difrenciar genéticamente. Los resultados obtenidos en este trabajo muestran la capacidad de los marcadores SSR transferidos para evaluar la variabilidad genética, expandiendo los recursos genéticos disponibles para estas especies.
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