El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de Stylommatophora

Autores
Guzmán, Leila Belén; Martí, Emiliano; Beltramino, Ariel Anibal; Vogler, Roberto Eugenio
Año de publicación
2021
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Los genomas mitocondriales completos se han vuelto un recurso cada vez más frecuente en las reconstrucciones filogenéticas a diferentes niveles taxonómicos de diversos grupos animales. No obstante, a pesar de que el phylum Mollusca es el segundo grupo animal con mayor número de especies, poco más de 1.400 tienen su mitogenoma caracterizado. En este sentido, las últimas filogenias con base en mitogenomas realizadas en el orden Stylommatophora cuentan con la mayor representatividad en el suborden Helicina (clado no achatinoideo), mientras que Achatinina (clado achatinoideo) solo cuenta con un mitogenoma y Scolodontina con ninguno. Con el objetivo de incrementar la representatividad del suborden Achatinina se caracterizó por primera vez en este trabajo el genoma mitocondrial completo del caracol gigante africano Lissachatina immaculata (Lamarck, 1822). El ensamblaje del genoma mitocondrial se realizó por medio del software NOVOPlasty. Para ello se descargaron del NCBI datos crudos obtenidos de la secuenciación del genoma completo ya publicado (BioProject PRJNA561271). La anotación del genoma se llevó a cabo mediante el uso de los programas y herramientas MITOS2, ORFinder, ARWEN, así como por la comparación con Lissachatina fulica (Bowdich, 1822), el único representante de Achatinoidea que tiene su mitogenoma secuenciado. Para los análisis filogenéticos (Inferencia Bayesiana y Máxima Verosimilitud) se utilizaron secuencias de aminoácidos concatenadas de los 13 genes codificantes para proteínas de 40 especies de Stylommatophora. Tres especies de Systellommatophora, Hygrophila y Ellobiida fueron utilizadas como grupo externo. El mitogenoma de L. immaculata se constituyó de 15.077 pb con un alto contenido de A+T (66,3 %) y se identificaron los 37 genes típicos de Metazoa. Se encontraron 22 regiones intergénicas, mientras que ocho pares de genes presentaron codificación superpuesta. Al igual que L. fulica se caracterizó una extensa región no codificante rica en A+T (66,8 %) entre los genes cox1 y ARNt-Val de 589 pb, asignada a una posible región control. El arreglo de genes de L. immaculata estuvo conservado en relación con el informado para L. fulica. Los modelos de estructura secundaria de los genes de ARN de transferencia presentaron la forma estándar a excepción de ARNt-Ser1 que presentó el brazo D truncado. Como resultado de las reconstrucciones filogenéticas se recuperó a Stylommatophora como un grupo monofilético. Por su parte, L. immaculata se agrupó junto a L. fulica posicionándose como basales dentro de Stylommatophora. Los nuevos datos generados permitirán fortalecer las reconstrucciones filogenéticas futuras, así como también evaluar posibles diferencias en las características genómicas entre las especies de Lissachatina, así como del suborden Achatinina.
Fil: Guzmán, Leila Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
Fil: Martí, Emiliano. Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho; Brasil
Fil: Beltramino, Ariel Anibal. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
Fil: Vogler, Roberto Eugenio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
XXVII Encontro Brasileiro de Malacologia; V Simpósio Latino Americano de Jovens Taxonomistas
Edición virtual
Brasil
Sociedade Brasileira de Malacologia
Materia
ADNmt
ARNt
FILOGENÓMICA
MITOGENÓMICA
MOLLUSCA
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/282434
Acceder
id CONICETDig_f6feb4d9c590b70b3fb6e1d90d454af6
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/282434
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de StylommatophoraGuzmán, Leila BelénMartí, EmilianoBeltramino, Ariel AnibalVogler, Roberto EugenioADNmtARNtFILOGENÓMICAMITOGENÓMICAMOLLUSCAhttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1https://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1Los genomas mitocondriales completos se han vuelto un recurso cada vez más frecuente en las reconstrucciones filogenéticas a diferentes niveles taxonómicos de diversos grupos animales. No obstante, a pesar de que el phylum Mollusca es el segundo grupo animal con mayor número de especies, poco más de 1.400 tienen su mitogenoma caracterizado. En este sentido, las últimas filogenias con base en mitogenomas realizadas en el orden Stylommatophora cuentan con la mayor representatividad en el suborden Helicina (clado no achatinoideo), mientras que Achatinina (clado achatinoideo) solo cuenta con un mitogenoma y Scolodontina con ninguno. Con el objetivo de incrementar la representatividad del suborden Achatinina se caracterizó por primera vez en este trabajo el genoma mitocondrial completo del caracol gigante africano Lissachatina immaculata (Lamarck, 1822). El ensamblaje del genoma mitocondrial se realizó por medio del software NOVOPlasty. Para ello se descargaron del NCBI datos crudos obtenidos de la secuenciación del genoma completo ya publicado (BioProject PRJNA561271). La anotación del genoma se llevó a cabo mediante el uso de los programas y herramientas MITOS2, ORFinder, ARWEN, así como por la comparación con Lissachatina fulica (Bowdich, 1822), el único representante de Achatinoidea que tiene su mitogenoma secuenciado. Para los análisis filogenéticos (Inferencia Bayesiana y Máxima Verosimilitud) se utilizaron secuencias de aminoácidos concatenadas de los 13 genes codificantes para proteínas de 40 especies de Stylommatophora. Tres especies de Systellommatophora, Hygrophila y Ellobiida fueron utilizadas como grupo externo. El mitogenoma de L. immaculata se constituyó de 15.077 pb con un alto contenido de A+T (66,3 %) y se identificaron los 37 genes típicos de Metazoa. Se encontraron 22 regiones intergénicas, mientras que ocho pares de genes presentaron codificación superpuesta. Al igual que L. fulica se caracterizó una extensa región no codificante rica en A+T (66,8 %) entre los genes cox1 y ARNt-Val de 589 pb, asignada a una posible región control. El arreglo de genes de L. immaculata estuvo conservado en relación con el informado para L. fulica. Los modelos de estructura secundaria de los genes de ARN de transferencia presentaron la forma estándar a excepción de ARNt-Ser1 que presentó el brazo D truncado. Como resultado de las reconstrucciones filogenéticas se recuperó a Stylommatophora como un grupo monofilético. Por su parte, L. immaculata se agrupó junto a L. fulica posicionándose como basales dentro de Stylommatophora. Los nuevos datos generados permitirán fortalecer las reconstrucciones filogenéticas futuras, así como también evaluar posibles diferencias en las características genómicas entre las especies de Lissachatina, así como del suborden Achatinina.Fil: Guzmán, Leila Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; ArgentinaFil: Martí, Emiliano. Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho; BrasilFil: Beltramino, Ariel Anibal. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; ArgentinaFil: Vogler, Roberto Eugenio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; ArgentinaXXVII Encontro Brasileiro de Malacologia; V Simpósio Latino Americano de Jovens TaxonomistasEdición virtualBrasilSociedade Brasileira de MalacologiaSociedade Brasileira de Malacologia2021info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/conferenceObjectEncuentroBookhttp://purl.org/coar/resource_type/c_5794info:ar-repo/semantics/documentoDeConferenciaapplication/pdfapplication/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.documentapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/282434El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de Stylommatophora; XXVII Encontro Brasileiro de Malacologia; V Simpósio Latino Americano de Jovens Taxonomistas; Edición virtual; Brasil; 2021; 231978-65-87912-01-1CONICET DigitalCONICETspainfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.even3.com.br/xxviiebram2021/Nacionalinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2026-03-11T12:57:48Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/282434instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982026-03-11 12:57:48.671CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de Stylommatophora
title El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de Stylommatophora
spellingShingle El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de Stylommatophora
Guzmán, Leila Belén
ADNmt
ARNt
FILOGENÓMICA
MITOGENÓMICA
MOLLUSCA
title_short El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de Stylommatophora
title_full El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de Stylommatophora
title_fullStr El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de Stylommatophora
title_full_unstemmed El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de Stylommatophora
title_sort El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de Stylommatophora
dc.creator.none.fl_str_mv Guzmán, Leila Belén
Martí, Emiliano
Beltramino, Ariel Anibal
Vogler, Roberto Eugenio
author Guzmán, Leila Belén
author_facet Guzmán, Leila Belén
Martí, Emiliano
Beltramino, Ariel Anibal
Vogler, Roberto Eugenio
author_role author
author2 Martí, Emiliano
Beltramino, Ariel Anibal
Vogler, Roberto Eugenio
author2_role author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv ADNmt
ARNt
FILOGENÓMICA
MITOGENÓMICA
MOLLUSCA
topic ADNmt
ARNt
FILOGENÓMICA
MITOGENÓMICA
MOLLUSCA
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv Los genomas mitocondriales completos se han vuelto un recurso cada vez más frecuente en las reconstrucciones filogenéticas a diferentes niveles taxonómicos de diversos grupos animales. No obstante, a pesar de que el phylum Mollusca es el segundo grupo animal con mayor número de especies, poco más de 1.400 tienen su mitogenoma caracterizado. En este sentido, las últimas filogenias con base en mitogenomas realizadas en el orden Stylommatophora cuentan con la mayor representatividad en el suborden Helicina (clado no achatinoideo), mientras que Achatinina (clado achatinoideo) solo cuenta con un mitogenoma y Scolodontina con ninguno. Con el objetivo de incrementar la representatividad del suborden Achatinina se caracterizó por primera vez en este trabajo el genoma mitocondrial completo del caracol gigante africano Lissachatina immaculata (Lamarck, 1822). El ensamblaje del genoma mitocondrial se realizó por medio del software NOVOPlasty. Para ello se descargaron del NCBI datos crudos obtenidos de la secuenciación del genoma completo ya publicado (BioProject PRJNA561271). La anotación del genoma se llevó a cabo mediante el uso de los programas y herramientas MITOS2, ORFinder, ARWEN, así como por la comparación con Lissachatina fulica (Bowdich, 1822), el único representante de Achatinoidea que tiene su mitogenoma secuenciado. Para los análisis filogenéticos (Inferencia Bayesiana y Máxima Verosimilitud) se utilizaron secuencias de aminoácidos concatenadas de los 13 genes codificantes para proteínas de 40 especies de Stylommatophora. Tres especies de Systellommatophora, Hygrophila y Ellobiida fueron utilizadas como grupo externo. El mitogenoma de L. immaculata se constituyó de 15.077 pb con un alto contenido de A+T (66,3 %) y se identificaron los 37 genes típicos de Metazoa. Se encontraron 22 regiones intergénicas, mientras que ocho pares de genes presentaron codificación superpuesta. Al igual que L. fulica se caracterizó una extensa región no codificante rica en A+T (66,8 %) entre los genes cox1 y ARNt-Val de 589 pb, asignada a una posible región control. El arreglo de genes de L. immaculata estuvo conservado en relación con el informado para L. fulica. Los modelos de estructura secundaria de los genes de ARN de transferencia presentaron la forma estándar a excepción de ARNt-Ser1 que presentó el brazo D truncado. Como resultado de las reconstrucciones filogenéticas se recuperó a Stylommatophora como un grupo monofilético. Por su parte, L. immaculata se agrupó junto a L. fulica posicionándose como basales dentro de Stylommatophora. Los nuevos datos generados permitirán fortalecer las reconstrucciones filogenéticas futuras, así como también evaluar posibles diferencias en las características genómicas entre las especies de Lissachatina, así como del suborden Achatinina.
Fil: Guzmán, Leila Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
Fil: Martí, Emiliano. Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho; Brasil
Fil: Beltramino, Ariel Anibal. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
Fil: Vogler, Roberto Eugenio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
XXVII Encontro Brasileiro de Malacologia; V Simpósio Latino Americano de Jovens Taxonomistas
Edición virtual
Brasil
Sociedade Brasileira de Malacologia
description Los genomas mitocondriales completos se han vuelto un recurso cada vez más frecuente en las reconstrucciones filogenéticas a diferentes niveles taxonómicos de diversos grupos animales. No obstante, a pesar de que el phylum Mollusca es el segundo grupo animal con mayor número de especies, poco más de 1.400 tienen su mitogenoma caracterizado. En este sentido, las últimas filogenias con base en mitogenomas realizadas en el orden Stylommatophora cuentan con la mayor representatividad en el suborden Helicina (clado no achatinoideo), mientras que Achatinina (clado achatinoideo) solo cuenta con un mitogenoma y Scolodontina con ninguno. Con el objetivo de incrementar la representatividad del suborden Achatinina se caracterizó por primera vez en este trabajo el genoma mitocondrial completo del caracol gigante africano Lissachatina immaculata (Lamarck, 1822). El ensamblaje del genoma mitocondrial se realizó por medio del software NOVOPlasty. Para ello se descargaron del NCBI datos crudos obtenidos de la secuenciación del genoma completo ya publicado (BioProject PRJNA561271). La anotación del genoma se llevó a cabo mediante el uso de los programas y herramientas MITOS2, ORFinder, ARWEN, así como por la comparación con Lissachatina fulica (Bowdich, 1822), el único representante de Achatinoidea que tiene su mitogenoma secuenciado. Para los análisis filogenéticos (Inferencia Bayesiana y Máxima Verosimilitud) se utilizaron secuencias de aminoácidos concatenadas de los 13 genes codificantes para proteínas de 40 especies de Stylommatophora. Tres especies de Systellommatophora, Hygrophila y Ellobiida fueron utilizadas como grupo externo. El mitogenoma de L. immaculata se constituyó de 15.077 pb con un alto contenido de A+T (66,3 %) y se identificaron los 37 genes típicos de Metazoa. Se encontraron 22 regiones intergénicas, mientras que ocho pares de genes presentaron codificación superpuesta. Al igual que L. fulica se caracterizó una extensa región no codificante rica en A+T (66,8 %) entre los genes cox1 y ARNt-Val de 589 pb, asignada a una posible región control. El arreglo de genes de L. immaculata estuvo conservado en relación con el informado para L. fulica. Los modelos de estructura secundaria de los genes de ARN de transferencia presentaron la forma estándar a excepción de ARNt-Ser1 que presentó el brazo D truncado. Como resultado de las reconstrucciones filogenéticas se recuperó a Stylommatophora como un grupo monofilético. Por su parte, L. immaculata se agrupó junto a L. fulica posicionándose como basales dentro de Stylommatophora. Los nuevos datos generados permitirán fortalecer las reconstrucciones filogenéticas futuras, así como también evaluar posibles diferencias en las características genómicas entre las especies de Lissachatina, así como del suborden Achatinina.
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
info:eu-repo/semantics/conferenceObject
Encuentro
Book
http://purl.org/coar/resource_type/c_5794
info:ar-repo/semantics/documentoDeConferencia
status_str publishedVersion
format conferenceObject
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/282434
El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de Stylommatophora; XXVII Encontro Brasileiro de Malacologia; V Simpósio Latino Americano de Jovens Taxonomistas; Edición virtual; Brasil; 2021; 231
978-65-87912-01-1
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/282434
identifier_str_mv El genoma mitocondrial de Lissachatina immaculata (Gastropoda: Achatinidae): primera caracterización y actualización de la filogenia de Stylommatophora; XXVII Encontro Brasileiro de Malacologia; V Simpósio Latino Americano de Jovens Taxonomistas; Edición virtual; Brasil; 2021; 231
978-65-87912-01-1
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.even3.com.br/xxviiebram2021/
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document
application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv Nacional
dc.publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Malacologia
publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Malacologia
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1859460924725788672
score 12.977003

Publicaciones similares