Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina

Autores
Gramundi, Ivan; Albornoz, Ezequiel Pablo; Boutureira, Manuel Fabián; Rapoport, Melina; Gómez, Sonia Alejandra; Corso, Alejandra; Castro, Gabriel; Faccone, Diego Francisco
Año de publicación
2022
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Escherichia coli is one of the main human pathogens causing different hospital- and community-acquired infections. During the period from January 2013 to March 2015, 1.96% (32/1632) of E. coli isolates recovered at the Hospital Regional de Ushuaia, Tierra del Fuego province, were resistant to third-generation cephalosporins (TGCs). These isolates were resistant to cefotaxime (91%) and/or ceftazidime (28%). No resistance to carbapenems was detected. Twenty-six isolates were positive for blaCTX-M gene, grouped as CTX-M-1/15 (54%); CTX-M-9/14 (25%); CTX-M-2 (17%); and CTX-M-1/15 plus CTX-M-9/14 (4%). Five TGC-resistant strains were positive for blaCMY gene, while one strain harbored TEM-19 ESBL. Twelve isolates were identified as ST131 E. coli hyperepidemic clone, and one as ST69. Genome sequence analysis of seven blaCTX-M-15 E. coli selected isolates confirm the circulation of ST131, ST617 and ST405 international high-risk clones in the city of Ushuaia.
Escherichia coli es uno de los principales patógenos humanos causantes de diferentes infecciones de inicio hospitalario y comunitario. Se determinó que el 1,96% (32/1.632) de los aislamientos de E. coli recuperados entre enero de 2013 y marzo de 2015 en el Hospital Regional de Ushuaia, provincia de Tierra del Fuego, fueron resistentes a cefalosporinas de tercera generación (CTG). Estos aislamientos fueron resistentes a cefotaxima (91%) y/o a ceftazidima (28%). No se detectó resistencia a los carbapenemes. Veintiséis aislamientos fueron positivos para el gen blaCTX-M, agrupados como CTX-M-1/15 (54%), CTX-M-9/14 (25%), CTX-M2 (17%) y CTX-M-1/15 más CTX-M-9/14 (4%). Cinco cepas resistentes a CTG dieron positivo para el gen blaCMY, mientras que un aislamiento presentó la BLEE TEM-19. Doce aislamientos se identificaron como clon hiperepidémico E. coli ST131 y uno como ST69. El análisis de las secuencias del genoma de siete aislamientos seleccionados de E. coli blaCTX-M-15 confirmó la circulación de los clones internacionales de alto riesgo ST131, ST617 y ST405 en la ciudad de Ushuaia.
Fil: Gramundi, Ivan. Hospital Regional Ushuaia; Argentina
Fil: Albornoz, Ezequiel Pablo. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Boutureira, Manuel Fabián. Hospital Regional Ushuaia; Argentina
Fil: Rapoport, Melina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; Argentina
Fil: Gómez, Sonia Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; Argentina
Fil: Corso, Alejandra. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; Argentina
Fil: Castro, Gabriel. Hospital Regional Ushuaia; Argentina
Fil: Faccone, Diego Francisco. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Materia
ESCHERICHIA COLI
EXTENDED-SPECTRUM BETA-LACTAMASE
ST131
THIRD-GENERATION CEPHALOSPORIN
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/200923

id CONICETDig_f43d40e791bdf22b71d9aeadcfd34c6f
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/200923
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, ArgentinaCaracterización de aislamientos clínicos de Escherichia coli resistente a cefalosporinas de tercera generación de Ushuaia, ArgentinaGramundi, IvanAlbornoz, Ezequiel PabloBoutureira, Manuel FabiánRapoport, MelinaGómez, Sonia AlejandraCorso, AlejandraCastro, GabrielFaccone, Diego FranciscoESCHERICHIA COLIEXTENDED-SPECTRUM BETA-LACTAMASEST131THIRD-GENERATION CEPHALOSPORINhttps://purl.org/becyt/ford/3.3https://purl.org/becyt/ford/3Escherichia coli is one of the main human pathogens causing different hospital- and community-acquired infections. During the period from January 2013 to March 2015, 1.96% (32/1632) of E. coli isolates recovered at the Hospital Regional de Ushuaia, Tierra del Fuego province, were resistant to third-generation cephalosporins (TGCs). These isolates were resistant to cefotaxime (91%) and/or ceftazidime (28%). No resistance to carbapenems was detected. Twenty-six isolates were positive for blaCTX-M gene, grouped as CTX-M-1/15 (54%); CTX-M-9/14 (25%); CTX-M-2 (17%); and CTX-M-1/15 plus CTX-M-9/14 (4%). Five TGC-resistant strains were positive for blaCMY gene, while one strain harbored TEM-19 ESBL. Twelve isolates were identified as ST131 E. coli hyperepidemic clone, and one as ST69. Genome sequence analysis of seven blaCTX-M-15 E. coli selected isolates confirm the circulation of ST131, ST617 and ST405 international high-risk clones in the city of Ushuaia.Escherichia coli es uno de los principales patógenos humanos causantes de diferentes infecciones de inicio hospitalario y comunitario. Se determinó que el 1,96% (32/1.632) de los aislamientos de E. coli recuperados entre enero de 2013 y marzo de 2015 en el Hospital Regional de Ushuaia, provincia de Tierra del Fuego, fueron resistentes a cefalosporinas de tercera generación (CTG). Estos aislamientos fueron resistentes a cefotaxima (91%) y/o a ceftazidima (28%). No se detectó resistencia a los carbapenemes. Veintiséis aislamientos fueron positivos para el gen blaCTX-M, agrupados como CTX-M-1/15 (54%), CTX-M-9/14 (25%), CTX-M2 (17%) y CTX-M-1/15 más CTX-M-9/14 (4%). Cinco cepas resistentes a CTG dieron positivo para el gen blaCMY, mientras que un aislamiento presentó la BLEE TEM-19. Doce aislamientos se identificaron como clon hiperepidémico E. coli ST131 y uno como ST69. El análisis de las secuencias del genoma de siete aislamientos seleccionados de E. coli blaCTX-M-15 confirmó la circulación de los clones internacionales de alto riesgo ST131, ST617 y ST405 en la ciudad de Ushuaia.Fil: Gramundi, Ivan. Hospital Regional Ushuaia; ArgentinaFil: Albornoz, Ezequiel Pablo. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Boutureira, Manuel Fabián. Hospital Regional Ushuaia; ArgentinaFil: Rapoport, Melina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; ArgentinaFil: Gómez, Sonia Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; ArgentinaFil: Corso, Alejandra. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; ArgentinaFil: Castro, Gabriel. Hospital Regional Ushuaia; ArgentinaFil: Faccone, Diego Francisco. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaAsociación Argentina de Microbiología2022-09info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/200923Gramundi, Ivan; Albornoz, Ezequiel Pablo; Boutureira, Manuel Fabián; Rapoport, Melina; Gómez, Sonia Alejandra; et al.; Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina; Asociación Argentina de Microbiología; Revista Argentina de Microbiología; 55; 1; 9-2022; 43-480325-75411851-7617CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0325754122000591info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1016/j.ram.2022.06.002info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-10-15T15:41:38Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/200923instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-10-15 15:41:38.984CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina
Caracterización de aislamientos clínicos de Escherichia coli resistente a cefalosporinas de tercera generación de Ushuaia, Argentina
title Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina
spellingShingle Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina
Gramundi, Ivan
ESCHERICHIA COLI
EXTENDED-SPECTRUM BETA-LACTAMASE
ST131
THIRD-GENERATION CEPHALOSPORIN
title_short Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina
title_full Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina
title_fullStr Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina
title_full_unstemmed Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina
title_sort Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina
dc.creator.none.fl_str_mv Gramundi, Ivan
Albornoz, Ezequiel Pablo
Boutureira, Manuel Fabián
Rapoport, Melina
Gómez, Sonia Alejandra
Corso, Alejandra
Castro, Gabriel
Faccone, Diego Francisco
author Gramundi, Ivan
author_facet Gramundi, Ivan
Albornoz, Ezequiel Pablo
Boutureira, Manuel Fabián
Rapoport, Melina
Gómez, Sonia Alejandra
Corso, Alejandra
Castro, Gabriel
Faccone, Diego Francisco
author_role author
author2 Albornoz, Ezequiel Pablo
Boutureira, Manuel Fabián
Rapoport, Melina
Gómez, Sonia Alejandra
Corso, Alejandra
Castro, Gabriel
Faccone, Diego Francisco
author2_role author
author
author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv ESCHERICHIA COLI
EXTENDED-SPECTRUM BETA-LACTAMASE
ST131
THIRD-GENERATION CEPHALOSPORIN
topic ESCHERICHIA COLI
EXTENDED-SPECTRUM BETA-LACTAMASE
ST131
THIRD-GENERATION CEPHALOSPORIN
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/3.3
https://purl.org/becyt/ford/3
dc.description.none.fl_txt_mv Escherichia coli is one of the main human pathogens causing different hospital- and community-acquired infections. During the period from January 2013 to March 2015, 1.96% (32/1632) of E. coli isolates recovered at the Hospital Regional de Ushuaia, Tierra del Fuego province, were resistant to third-generation cephalosporins (TGCs). These isolates were resistant to cefotaxime (91%) and/or ceftazidime (28%). No resistance to carbapenems was detected. Twenty-six isolates were positive for blaCTX-M gene, grouped as CTX-M-1/15 (54%); CTX-M-9/14 (25%); CTX-M-2 (17%); and CTX-M-1/15 plus CTX-M-9/14 (4%). Five TGC-resistant strains were positive for blaCMY gene, while one strain harbored TEM-19 ESBL. Twelve isolates were identified as ST131 E. coli hyperepidemic clone, and one as ST69. Genome sequence analysis of seven blaCTX-M-15 E. coli selected isolates confirm the circulation of ST131, ST617 and ST405 international high-risk clones in the city of Ushuaia.
Escherichia coli es uno de los principales patógenos humanos causantes de diferentes infecciones de inicio hospitalario y comunitario. Se determinó que el 1,96% (32/1.632) de los aislamientos de E. coli recuperados entre enero de 2013 y marzo de 2015 en el Hospital Regional de Ushuaia, provincia de Tierra del Fuego, fueron resistentes a cefalosporinas de tercera generación (CTG). Estos aislamientos fueron resistentes a cefotaxima (91%) y/o a ceftazidima (28%). No se detectó resistencia a los carbapenemes. Veintiséis aislamientos fueron positivos para el gen blaCTX-M, agrupados como CTX-M-1/15 (54%), CTX-M-9/14 (25%), CTX-M2 (17%) y CTX-M-1/15 más CTX-M-9/14 (4%). Cinco cepas resistentes a CTG dieron positivo para el gen blaCMY, mientras que un aislamiento presentó la BLEE TEM-19. Doce aislamientos se identificaron como clon hiperepidémico E. coli ST131 y uno como ST69. El análisis de las secuencias del genoma de siete aislamientos seleccionados de E. coli blaCTX-M-15 confirmó la circulación de los clones internacionales de alto riesgo ST131, ST617 y ST405 en la ciudad de Ushuaia.
Fil: Gramundi, Ivan. Hospital Regional Ushuaia; Argentina
Fil: Albornoz, Ezequiel Pablo. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Boutureira, Manuel Fabián. Hospital Regional Ushuaia; Argentina
Fil: Rapoport, Melina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; Argentina
Fil: Gómez, Sonia Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; Argentina
Fil: Corso, Alejandra. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; Argentina
Fil: Castro, Gabriel. Hospital Regional Ushuaia; Argentina
Fil: Faccone, Diego Francisco. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Área de Antimicrobianos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
description Escherichia coli is one of the main human pathogens causing different hospital- and community-acquired infections. During the period from January 2013 to March 2015, 1.96% (32/1632) of E. coli isolates recovered at the Hospital Regional de Ushuaia, Tierra del Fuego province, were resistant to third-generation cephalosporins (TGCs). These isolates were resistant to cefotaxime (91%) and/or ceftazidime (28%). No resistance to carbapenems was detected. Twenty-six isolates were positive for blaCTX-M gene, grouped as CTX-M-1/15 (54%); CTX-M-9/14 (25%); CTX-M-2 (17%); and CTX-M-1/15 plus CTX-M-9/14 (4%). Five TGC-resistant strains were positive for blaCMY gene, while one strain harbored TEM-19 ESBL. Twelve isolates were identified as ST131 E. coli hyperepidemic clone, and one as ST69. Genome sequence analysis of seven blaCTX-M-15 E. coli selected isolates confirm the circulation of ST131, ST617 and ST405 international high-risk clones in the city of Ushuaia.
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022-09
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/200923
Gramundi, Ivan; Albornoz, Ezequiel Pablo; Boutureira, Manuel Fabián; Rapoport, Melina; Gómez, Sonia Alejandra; et al.; Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina; Asociación Argentina de Microbiología; Revista Argentina de Microbiología; 55; 1; 9-2022; 43-48
0325-7541
1851-7617
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/200923
identifier_str_mv Gramundi, Ivan; Albornoz, Ezequiel Pablo; Boutureira, Manuel Fabián; Rapoport, Melina; Gómez, Sonia Alejandra; et al.; Characterization of third generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates from Ushuaia, Argentina; Asociación Argentina de Microbiología; Revista Argentina de Microbiología; 55; 1; 9-2022; 43-48
0325-7541
1851-7617
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0325754122000591
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1016/j.ram.2022.06.002
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Asociación Argentina de Microbiología
publisher.none.fl_str_mv Asociación Argentina de Microbiología
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1846083526876725248
score 13.221938