Scope and limitations of a multiplex conventional PCR for the diagnosis of S. stercoralis and hookworms

Autores
Fleitas, Pedro Emanuel; Vargas Flores, Paola Andrea; Caro, Reynaldo Nicolás; Almazán, María Cristina; Echazú, Adriana; Juarez, Marisa del Valle; Cajal, Silvana Pamela; Krolewiecki, Alejandro Javier; Nasser, Julio Rubén; Cimino, Rubén Oscar
Año de publicación
2021
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Objectives: Describe the diagnostic characteristics of a conventional multiplex PCR for the diagnosis of S. stercoralis, N. americanus and Ancylostomas spp. Methods: Fecal samples were collected from a cross-sectional study in Oran department, Salta province, Argentina. The stool samples were analyzed using concentration-sedimentation, Harada Mori, McMaster, and Baermann techniques. DNA was extracted from 50 mg fecal sample using the FastPrep Spin Kit for Soil. Three pairs of primers were used for the amplification of three products of 101, 330, and 577 base pairs (bp) for S. stercoralis, N. americanus and Ancylostoma spp, respectively. The sensitivity and analytical specificity of multiplex PCR were evaluated, as well as the sensitivity and diagnostic specificity, using a composite standard and Bayesian approach. Results and Conclusions: Multiplex PCR did not present cross-reaction with other intestinal parasites, and the detection limit for multiplex PCR was between 2 and 20 pg of genomic DNA. In addition it presented a diagnostic sensitivity of 97.4% for S. stercoralis and 90.3% for hookworms with a specificity of 100% and 87.6%, respectively. PCR identified a higher proportion (p <0.01) of coinfections (15.3%) than microscopic techniques (3.5%). Also, multiplex PCR showed that there was a positive association between S. stercoralis and hookworms (odds ratio = 2.12). However, this association was due to N. americanus (odds ratio= 3.22), since no association was observed between S. stercoralis and Ancylostoma spp. Neither was an association observed between the two species of hookworms.
Fil: Fleitas, Pedro Emanuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina
Fil: Vargas Flores, Paola Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina
Fil: Caro, Reynaldo Nicolás. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina
Fil: Almazán, María Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina
Fil: Echazú, Adriana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud; Argentina
Fil: Juarez, Marisa del Valle. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina
Fil: Cajal, Silvana Pamela. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina
Fil: Krolewiecki, Alejandro Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina
Fil: Nasser, Julio Rubén. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina
Fil: Cimino, Rubén Oscar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina
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STRONGYLOIDES STERCORALIS
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Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Institución
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