Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake

Autores
Fernandez Zenoff, Maria Veronica; Estévez, Maria Cristina; Farias, Maria Eugenia
Año de publicación
2014
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
La Laguna Azul es un ambiente oligotrófico localizado a 4560 m de altura y sometido a elevados niveles de radiación solar. La composición de su comunidad bacterioplanctónica fue analizada empleando la técnica de electroforesis en gradiente desnaturalizante y se investigó el impacto de la radiación ultravioleta cuantificando los dímeros de pirimidina (CPD). Además, se expusieron simultáneamente cultivos puros de Acinetobacter johnsonii A2 y Rhodococcus sp. A5 para estudiar la acumulación de CPD. El análisis de los geles mostró siete secuencias pertenecientes a Alpha-proteobacteria (1 banda), Beta-proteobacteria (1 banda), Bacteroidetes (2 bandas), Actinobacteria (1 banda) y Firmicutes (1 banda). A lo largo del día se observaron cambios mínimos en la composición de la comunidad y no se detectaron CPD. A. johnsonii A2 presentó un daño bajo mientras que Rhodococcus sp. A5 no presentó daño en su ADN, sugiriendo que la comunidad bacteriana está muy bien adaptada a este ambiente altamente irradiado.
Laguna Azul is an oligotrophic lake situated at 4,560 m above sea level and subject to a high level of solar radiation. Bacterioplankton community composition (BCC) was analysed by denaturing gradient gel electrophoresis and the impact of solar ultraviolet radiation was assessed by measuring cyclobutane pyrimidine dimers (CPD). Furthermore, pure cultures of Acinetobacter johnsonii A2 and Rhodococcus sp. A5 were exposed simultaneously and CPD accumulation was studied. Gel analyses generated a total of 7 sequences belonging to Alpha-proteobacteria (1 band), Beta-proteobacteria (1 band), Bacteroidetes (2 bands), Actinobacteria (1 band), and Firmicutes (1 band). DGGE profi les showed minimal changes in BCC and no CPD was detected even though a high level of damage was found in biodosimeters. A. johnsonii A2 showed low level of DNA damage while Rhodococcus sp. A5 exhibited high resistance since no CPD were detected under natural UV-B exposure, suggesting that the bacterial community is well adapted to this highly solar irradiated environment.
Fil: Fernandez Zenoff, Maria Veronica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Microbiología; Argentina
Fil: Estévez, Maria Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; Argentina
Fil: Farias, Maria Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; Argentina
Materia
CPD
Electroforesis en gradiente desnaturalizante
Lagunas andinas
Radiación ultravioleta
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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Laguna Azul is an oligotrophic lake situated at 4,560 m above sea level and subject to a high level of solar radiation. Bacterioplankton community composition (BCC) was analysed by denaturing gradient gel electrophoresis and the impact of solar ultraviolet radiation was assessed by measuring cyclobutane pyrimidine dimers (CPD). Furthermore, pure cultures of Acinetobacter johnsonii A2 and Rhodococcus sp. A5 were exposed simultaneously and CPD accumulation was studied. Gel analyses generated a total of 7 sequences belonging to Alpha-proteobacteria (1 band), Beta-proteobacteria (1 band), Bacteroidetes (2 bands), Actinobacteria (1 band), and Firmicutes (1 band). DGGE profi les showed minimal changes in BCC and no CPD was detected even though a high level of damage was found in biodosimeters. A. johnsonii A2 showed low level of DNA damage while Rhodococcus sp. A5 exhibited high resistance since no CPD were detected under natural UV-B exposure, suggesting that the bacterial community is well adapted to this highly solar irradiated environment.
Fil: Fernandez Zenoff, Maria Veronica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Microbiología; Argentina
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