Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake
- Autores
- Fernandez Zenoff, Maria Veronica; Estévez, Maria Cristina; Farias, Maria Eugenia
- Año de publicación
- 2014
- Idioma
- inglés
- Tipo de recurso
- artículo
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- La Laguna Azul es un ambiente oligotrófico localizado a 4560 m de altura y sometido a elevados niveles de radiación solar. La composición de su comunidad bacterioplanctónica fue analizada empleando la técnica de electroforesis en gradiente desnaturalizante y se investigó el impacto de la radiación ultravioleta cuantificando los dímeros de pirimidina (CPD). Además, se expusieron simultáneamente cultivos puros de Acinetobacter johnsonii A2 y Rhodococcus sp. A5 para estudiar la acumulación de CPD. El análisis de los geles mostró siete secuencias pertenecientes a Alpha-proteobacteria (1 banda), Beta-proteobacteria (1 banda), Bacteroidetes (2 bandas), Actinobacteria (1 banda) y Firmicutes (1 banda). A lo largo del día se observaron cambios mínimos en la composición de la comunidad y no se detectaron CPD. A. johnsonii A2 presentó un daño bajo mientras que Rhodococcus sp. A5 no presentó daño en su ADN, sugiriendo que la comunidad bacteriana está muy bien adaptada a este ambiente altamente irradiado.
Laguna Azul is an oligotrophic lake situated at 4,560 m above sea level and subject to a high level of solar radiation. Bacterioplankton community composition (BCC) was analysed by denaturing gradient gel electrophoresis and the impact of solar ultraviolet radiation was assessed by measuring cyclobutane pyrimidine dimers (CPD). Furthermore, pure cultures of Acinetobacter johnsonii A2 and Rhodococcus sp. A5 were exposed simultaneously and CPD accumulation was studied. Gel analyses generated a total of 7 sequences belonging to Alpha-proteobacteria (1 band), Beta-proteobacteria (1 band), Bacteroidetes (2 bands), Actinobacteria (1 band), and Firmicutes (1 band). DGGE profi les showed minimal changes in BCC and no CPD was detected even though a high level of damage was found in biodosimeters. A. johnsonii A2 showed low level of DNA damage while Rhodococcus sp. A5 exhibited high resistance since no CPD were detected under natural UV-B exposure, suggesting that the bacterial community is well adapted to this highly solar irradiated environment.
Fil: Fernandez Zenoff, Maria Veronica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Microbiología; Argentina
Fil: Estévez, Maria Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; Argentina
Fil: Farias, Maria Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; Argentina - Materia
-
CPD
Electroforesis en gradiente desnaturalizante
Lagunas andinas
Radiación ultravioleta - Nivel de accesibilidad
- acceso abierto
- Condiciones de uso
- https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
- Repositorio
- Institución
- Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
- OAI Identificador
- oai:ri.conicet.gov.ar:11336/102126
Ver los metadatos del registro completo
id |
CONICETDig_c68f1866eda2e25c7338b730ad352673 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/102126 |
network_acronym_str |
CONICETDig |
repository_id_str |
3498 |
network_name_str |
CONICET Digital (CONICET) |
spelling |
Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lakeVariación diurna de la composición bacterioplanctónica y daño en el ADN de la comunidad microbiana de una laguna oligotrófica de los AndesFernandez Zenoff, Maria VeronicaEstévez, Maria CristinaFarias, Maria EugeniaCPDElectroforesis en gradiente desnaturalizanteLagunas andinasRadiación ultravioletahttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1La Laguna Azul es un ambiente oligotrófico localizado a 4560 m de altura y sometido a elevados niveles de radiación solar. La composición de su comunidad bacterioplanctónica fue analizada empleando la técnica de electroforesis en gradiente desnaturalizante y se investigó el impacto de la radiación ultravioleta cuantificando los dímeros de pirimidina (CPD). Además, se expusieron simultáneamente cultivos puros de Acinetobacter johnsonii A2 y Rhodococcus sp. A5 para estudiar la acumulación de CPD. El análisis de los geles mostró siete secuencias pertenecientes a Alpha-proteobacteria (1 banda), Beta-proteobacteria (1 banda), Bacteroidetes (2 bandas), Actinobacteria (1 banda) y Firmicutes (1 banda). A lo largo del día se observaron cambios mínimos en la composición de la comunidad y no se detectaron CPD. A. johnsonii A2 presentó un daño bajo mientras que Rhodococcus sp. A5 no presentó daño en su ADN, sugiriendo que la comunidad bacteriana está muy bien adaptada a este ambiente altamente irradiado.Laguna Azul is an oligotrophic lake situated at 4,560 m above sea level and subject to a high level of solar radiation. Bacterioplankton community composition (BCC) was analysed by denaturing gradient gel electrophoresis and the impact of solar ultraviolet radiation was assessed by measuring cyclobutane pyrimidine dimers (CPD). Furthermore, pure cultures of Acinetobacter johnsonii A2 and Rhodococcus sp. A5 were exposed simultaneously and CPD accumulation was studied. Gel analyses generated a total of 7 sequences belonging to Alpha-proteobacteria (1 band), Beta-proteobacteria (1 band), Bacteroidetes (2 bands), Actinobacteria (1 band), and Firmicutes (1 band). DGGE profi les showed minimal changes in BCC and no CPD was detected even though a high level of damage was found in biodosimeters. A. johnsonii A2 showed low level of DNA damage while Rhodococcus sp. A5 exhibited high resistance since no CPD were detected under natural UV-B exposure, suggesting that the bacterial community is well adapted to this highly solar irradiated environment.Fil: Fernandez Zenoff, Maria Veronica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Microbiología; ArgentinaFil: Estévez, Maria Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; ArgentinaFil: Farias, Maria Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; ArgentinaAsociación Argentina de Microbiología2014-11info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/102126Fernandez Zenoff, Maria Veronica; Estévez, Maria Cristina; Farias, Maria Eugenia; Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake; Asociación Argentina de Microbiología; Revista Argentina de Microbiología; 46; 11-2014; 358-3620325-75411851-7617CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1016/S0325-7541(14)70095-1info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0325754114700951info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-29T10:15:21Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/102126instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-29 10:15:22.124CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake Variación diurna de la composición bacterioplanctónica y daño en el ADN de la comunidad microbiana de una laguna oligotrófica de los Andes |
title |
Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake |
spellingShingle |
Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake Fernandez Zenoff, Maria Veronica CPD Electroforesis en gradiente desnaturalizante Lagunas andinas Radiación ultravioleta |
title_short |
Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake |
title_full |
Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake |
title_fullStr |
Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake |
title_full_unstemmed |
Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake |
title_sort |
Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake |
dc.creator.none.fl_str_mv |
Fernandez Zenoff, Maria Veronica Estévez, Maria Cristina Farias, Maria Eugenia |
author |
Fernandez Zenoff, Maria Veronica |
author_facet |
Fernandez Zenoff, Maria Veronica Estévez, Maria Cristina Farias, Maria Eugenia |
author_role |
author |
author2 |
Estévez, Maria Cristina Farias, Maria Eugenia |
author2_role |
author author |
dc.subject.none.fl_str_mv |
CPD Electroforesis en gradiente desnaturalizante Lagunas andinas Radiación ultravioleta |
topic |
CPD Electroforesis en gradiente desnaturalizante Lagunas andinas Radiación ultravioleta |
purl_subject.fl_str_mv |
https://purl.org/becyt/ford/1.6 https://purl.org/becyt/ford/1 |
dc.description.none.fl_txt_mv |
La Laguna Azul es un ambiente oligotrófico localizado a 4560 m de altura y sometido a elevados niveles de radiación solar. La composición de su comunidad bacterioplanctónica fue analizada empleando la técnica de electroforesis en gradiente desnaturalizante y se investigó el impacto de la radiación ultravioleta cuantificando los dímeros de pirimidina (CPD). Además, se expusieron simultáneamente cultivos puros de Acinetobacter johnsonii A2 y Rhodococcus sp. A5 para estudiar la acumulación de CPD. El análisis de los geles mostró siete secuencias pertenecientes a Alpha-proteobacteria (1 banda), Beta-proteobacteria (1 banda), Bacteroidetes (2 bandas), Actinobacteria (1 banda) y Firmicutes (1 banda). A lo largo del día se observaron cambios mínimos en la composición de la comunidad y no se detectaron CPD. A. johnsonii A2 presentó un daño bajo mientras que Rhodococcus sp. A5 no presentó daño en su ADN, sugiriendo que la comunidad bacteriana está muy bien adaptada a este ambiente altamente irradiado. Laguna Azul is an oligotrophic lake situated at 4,560 m above sea level and subject to a high level of solar radiation. Bacterioplankton community composition (BCC) was analysed by denaturing gradient gel electrophoresis and the impact of solar ultraviolet radiation was assessed by measuring cyclobutane pyrimidine dimers (CPD). Furthermore, pure cultures of Acinetobacter johnsonii A2 and Rhodococcus sp. A5 were exposed simultaneously and CPD accumulation was studied. Gel analyses generated a total of 7 sequences belonging to Alpha-proteobacteria (1 band), Beta-proteobacteria (1 band), Bacteroidetes (2 bands), Actinobacteria (1 band), and Firmicutes (1 band). DGGE profi les showed minimal changes in BCC and no CPD was detected even though a high level of damage was found in biodosimeters. A. johnsonii A2 showed low level of DNA damage while Rhodococcus sp. A5 exhibited high resistance since no CPD were detected under natural UV-B exposure, suggesting that the bacterial community is well adapted to this highly solar irradiated environment. Fil: Fernandez Zenoff, Maria Veronica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia. Instituto de Microbiología; Argentina Fil: Estévez, Maria Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; Argentina Fil: Farias, Maria Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos; Argentina |
description |
La Laguna Azul es un ambiente oligotrófico localizado a 4560 m de altura y sometido a elevados niveles de radiación solar. La composición de su comunidad bacterioplanctónica fue analizada empleando la técnica de electroforesis en gradiente desnaturalizante y se investigó el impacto de la radiación ultravioleta cuantificando los dímeros de pirimidina (CPD). Además, se expusieron simultáneamente cultivos puros de Acinetobacter johnsonii A2 y Rhodococcus sp. A5 para estudiar la acumulación de CPD. El análisis de los geles mostró siete secuencias pertenecientes a Alpha-proteobacteria (1 banda), Beta-proteobacteria (1 banda), Bacteroidetes (2 bandas), Actinobacteria (1 banda) y Firmicutes (1 banda). A lo largo del día se observaron cambios mínimos en la composición de la comunidad y no se detectaron CPD. A. johnsonii A2 presentó un daño bajo mientras que Rhodococcus sp. A5 no presentó daño en su ADN, sugiriendo que la comunidad bacteriana está muy bien adaptada a este ambiente altamente irradiado. |
publishDate |
2014 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2014-11 |
dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 info:ar-repo/semantics/articulo |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/11336/102126 Fernandez Zenoff, Maria Veronica; Estévez, Maria Cristina; Farias, Maria Eugenia; Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake; Asociación Argentina de Microbiología; Revista Argentina de Microbiología; 46; 11-2014; 358-362 0325-7541 1851-7617 CONICET Digital CONICET |
url |
http://hdl.handle.net/11336/102126 |
identifier_str_mv |
Fernandez Zenoff, Maria Veronica; Estévez, Maria Cristina; Farias, Maria Eugenia; Diurnal variation in bacterioplankton composition and DNA damage in the microbial community from an Andean oligotrophic lake; Asociación Argentina de Microbiología; Revista Argentina de Microbiología; 46; 11-2014; 358-362 0325-7541 1851-7617 CONICET Digital CONICET |
dc.language.none.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.relation.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1016/S0325-7541(14)70095-1 info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0325754114700951 |
dc.rights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/ |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
rights_invalid_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/ |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Asociación Argentina de Microbiología |
publisher.none.fl_str_mv |
Asociación Argentina de Microbiología |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:CONICET Digital (CONICET) instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
reponame_str |
CONICET Digital (CONICET) |
collection |
CONICET Digital (CONICET) |
instname_str |
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
repository.name.fl_str_mv |
CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
repository.mail.fl_str_mv |
dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar |
_version_ |
1844614089567895552 |
score |
13.070432 |