Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosis

Autores
Mazzanti, Chiara; Carcione, María Micaela; Luce, Leonela Natalia; Giliberto, Florencia
Año de publicación
2019
Idioma
inglés
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Muscular dystrophies (MD) are a group of rare inherited diseases that cause weakness and progressive degeneration of skeletal muscle. They are caused by mutations in genes encoding structural skeletal muscle proteins or proteins necessary for the stability and proper functioning of muscle fibers. However, the clinical symptoms of these pathologies overlap, hindering differential diagnosis, which is of paramount importance to establish the standard of care. Therefore, it is important to carry out molecular studies to be able to differentiate between each type of MD. Here, we focus on the case of Limb-Girdle MD, which are frequently misdiagnosed as Dystrophinopathies, the most frequent type of MD and caused by mutations in the DMD gene. The present work aims to detect molecular alterations in MD genes in patients with a presumptive dystrophinopathy clinical diagnosis but no DMD mutation identified. A cohort of 106 Dystrophinopathy suspected males, with no alteration detected in DMD by MLPA, was referred to our laboratory for WES analysis. In a subset of 21, no small mutation in the DMD gene was detected. Therefore, we deepened the screening to all the MD genes included in the Gene Table of Neuromuscular Disorders. For recessive MD disorders, when only one mutation was identified, MLPA (SGCA, SGCB, SGCD, SGCG and FKRP) was implemented for deletion/duplication screening. Dystrophinopathy mutations were detected in the DMD gene in 81.1 % of patients. Further analysis of the WES results of the remaining individuals, allowed us to identify possibly pathogenic molecular alterations, in other MD associated genes, in 11 of them (10.4 %). Thus, reaching a WES detection rate of 91.5 %. We found 2 large deletions in SGCA and SGCD by MLPA. Finally, our work highlights the importance of extending the mutation screening to all the MD associated genes in patients without alterations in DMD, given that a misdiagnosis could lead to an error in the selection of the standard of care.
Fil: Mazzanti, Chiara. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo; Argentina
Fil: Carcione, María Micaela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo; Argentina
Fil: Luce, Leonela Natalia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo; Argentina
Fil: Giliberto, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; Argentina
LXIV Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Clínica; LI Reunión Anual de la Asociación Argentina de Farmacología Experimental; XXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biología; XXXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Protozoología; IX Reunión Anual de la Asociación Argentina de Nanomedicinas y VI Reunión Científica Regional de la Asociación Argentina de Ciencia y Tecnología de Animales de Laboratorio
Mar del Plata
Argentina
Sociedad Argentina de Investigación Clínica
Asociación Argentina de Farmacología Experimental
Sociedad Argentina de Biología
Sociedad Argentina de Protozoología
Asociación Argentina de Ciencia y Tecnología de Animales de Laboratorio
Asociación Argentina de Nanomedicinas
Materia
NGS
MUSCULAR DYSTROPHIES
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/247605
Acceder
id CONICETDig_c1da8857d82f4e526c536e68abff655e
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/247605
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosisMazzanti, ChiaraCarcione, María MicaelaLuce, Leonela NataliaGiliberto, FlorenciaNGSMUSCULAR DYSTROPHIEShttps://purl.org/becyt/ford/3.1https://purl.org/becyt/ford/3Muscular dystrophies (MD) are a group of rare inherited diseases that cause weakness and progressive degeneration of skeletal muscle. They are caused by mutations in genes encoding structural skeletal muscle proteins or proteins necessary for the stability and proper functioning of muscle fibers. However, the clinical symptoms of these pathologies overlap, hindering differential diagnosis, which is of paramount importance to establish the standard of care. Therefore, it is important to carry out molecular studies to be able to differentiate between each type of MD. Here, we focus on the case of Limb-Girdle MD, which are frequently misdiagnosed as Dystrophinopathies, the most frequent type of MD and caused by mutations in the DMD gene. The present work aims to detect molecular alterations in MD genes in patients with a presumptive dystrophinopathy clinical diagnosis but no DMD mutation identified. A cohort of 106 Dystrophinopathy suspected males, with no alteration detected in DMD by MLPA, was referred to our laboratory for WES analysis. In a subset of 21, no small mutation in the DMD gene was detected. Therefore, we deepened the screening to all the MD genes included in the Gene Table of Neuromuscular Disorders. For recessive MD disorders, when only one mutation was identified, MLPA (SGCA, SGCB, SGCD, SGCG and FKRP) was implemented for deletion/duplication screening. Dystrophinopathy mutations were detected in the DMD gene in 81.1 % of patients. Further analysis of the WES results of the remaining individuals, allowed us to identify possibly pathogenic molecular alterations, in other MD associated genes, in 11 of them (10.4 %). Thus, reaching a WES detection rate of 91.5 %. We found 2 large deletions in SGCA and SGCD by MLPA. Finally, our work highlights the importance of extending the mutation screening to all the MD associated genes in patients without alterations in DMD, given that a misdiagnosis could lead to an error in the selection of the standard of care.Fil: Mazzanti, Chiara. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo; ArgentinaFil: Carcione, María Micaela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo; ArgentinaFil: Luce, Leonela Natalia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo; ArgentinaFil: Giliberto, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; ArgentinaLXIV Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Clínica; LI Reunión Anual de la Asociación Argentina de Farmacología Experimental; XXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biología; XXXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Protozoología; IX Reunión Anual de la Asociación Argentina de Nanomedicinas y VI Reunión Científica Regional de la Asociación Argentina de Ciencia y Tecnología de Animales de LaboratorioMar del PlataArgentinaSociedad Argentina de Investigación ClínicaAsociación Argentina de Farmacología ExperimentalSociedad Argentina de BiologíaSociedad Argentina de ProtozoologíaAsociación Argentina de Ciencia y Tecnología de Animales de LaboratorioAsociación Argentina de NanomedicinasFundación Revista Medicina2019info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/conferenceObjectReuniónJournalhttp://purl.org/coar/resource_type/c_5794info:ar-repo/semantics/documentoDeConferenciaapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/247605Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosis; LXIV Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Clínica; LI Reunión Anual de la Asociación Argentina de Farmacología Experimental; XXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biología; XXXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Protozoología; IX Reunión Anual de la Asociación Argentina de Nanomedicinas y VI Reunión Científica Regional de la Asociación Argentina de Ciencia y Tecnología de Animales de Laboratorio; Mar del Plata; Argentina; 2019; 1-40076-60461669-8983CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.saic.org.ar/revista-medicinaNacionalinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-29T10:01:32Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/247605instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-29 10:01:33.24CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosis
title Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosis
spellingShingle Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosis
Mazzanti, Chiara
NGS
MUSCULAR DYSTROPHIES
title_short Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosis
title_full Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosis
title_fullStr Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosis
title_full_unstemmed Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosis
title_sort Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosis
dc.creator.none.fl_str_mv Mazzanti, Chiara
Carcione, María Micaela
Luce, Leonela Natalia
Giliberto, Florencia
author Mazzanti, Chiara
author_facet Mazzanti, Chiara
Carcione, María Micaela
Luce, Leonela Natalia
Giliberto, Florencia
author_role author
author2 Carcione, María Micaela
Luce, Leonela Natalia
Giliberto, Florencia
author2_role author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv NGS
MUSCULAR DYSTROPHIES
topic NGS
MUSCULAR DYSTROPHIES
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/3.1
https://purl.org/becyt/ford/3
dc.description.none.fl_txt_mv Muscular dystrophies (MD) are a group of rare inherited diseases that cause weakness and progressive degeneration of skeletal muscle. They are caused by mutations in genes encoding structural skeletal muscle proteins or proteins necessary for the stability and proper functioning of muscle fibers. However, the clinical symptoms of these pathologies overlap, hindering differential diagnosis, which is of paramount importance to establish the standard of care. Therefore, it is important to carry out molecular studies to be able to differentiate between each type of MD. Here, we focus on the case of Limb-Girdle MD, which are frequently misdiagnosed as Dystrophinopathies, the most frequent type of MD and caused by mutations in the DMD gene. The present work aims to detect molecular alterations in MD genes in patients with a presumptive dystrophinopathy clinical diagnosis but no DMD mutation identified. A cohort of 106 Dystrophinopathy suspected males, with no alteration detected in DMD by MLPA, was referred to our laboratory for WES analysis. In a subset of 21, no small mutation in the DMD gene was detected. Therefore, we deepened the screening to all the MD genes included in the Gene Table of Neuromuscular Disorders. For recessive MD disorders, when only one mutation was identified, MLPA (SGCA, SGCB, SGCD, SGCG and FKRP) was implemented for deletion/duplication screening. Dystrophinopathy mutations were detected in the DMD gene in 81.1 % of patients. Further analysis of the WES results of the remaining individuals, allowed us to identify possibly pathogenic molecular alterations, in other MD associated genes, in 11 of them (10.4 %). Thus, reaching a WES detection rate of 91.5 %. We found 2 large deletions in SGCA and SGCD by MLPA. Finally, our work highlights the importance of extending the mutation screening to all the MD associated genes in patients without alterations in DMD, given that a misdiagnosis could lead to an error in the selection of the standard of care.
Fil: Mazzanti, Chiara. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo; Argentina
Fil: Carcione, María Micaela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo; Argentina
Fil: Luce, Leonela Natalia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo; Argentina
Fil: Giliberto, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Inmunología, Genética y Metabolismo; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Genética y Biología Molecular; Argentina
LXIV Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Clínica; LI Reunión Anual de la Asociación Argentina de Farmacología Experimental; XXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biología; XXXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Protozoología; IX Reunión Anual de la Asociación Argentina de Nanomedicinas y VI Reunión Científica Regional de la Asociación Argentina de Ciencia y Tecnología de Animales de Laboratorio
Mar del Plata
Argentina
Sociedad Argentina de Investigación Clínica
Asociación Argentina de Farmacología Experimental
Sociedad Argentina de Biología
Sociedad Argentina de Protozoología
Asociación Argentina de Ciencia y Tecnología de Animales de Laboratorio
Asociación Argentina de Nanomedicinas
description Muscular dystrophies (MD) are a group of rare inherited diseases that cause weakness and progressive degeneration of skeletal muscle. They are caused by mutations in genes encoding structural skeletal muscle proteins or proteins necessary for the stability and proper functioning of muscle fibers. However, the clinical symptoms of these pathologies overlap, hindering differential diagnosis, which is of paramount importance to establish the standard of care. Therefore, it is important to carry out molecular studies to be able to differentiate between each type of MD. Here, we focus on the case of Limb-Girdle MD, which are frequently misdiagnosed as Dystrophinopathies, the most frequent type of MD and caused by mutations in the DMD gene. The present work aims to detect molecular alterations in MD genes in patients with a presumptive dystrophinopathy clinical diagnosis but no DMD mutation identified. A cohort of 106 Dystrophinopathy suspected males, with no alteration detected in DMD by MLPA, was referred to our laboratory for WES analysis. In a subset of 21, no small mutation in the DMD gene was detected. Therefore, we deepened the screening to all the MD genes included in the Gene Table of Neuromuscular Disorders. For recessive MD disorders, when only one mutation was identified, MLPA (SGCA, SGCB, SGCD, SGCG and FKRP) was implemented for deletion/duplication screening. Dystrophinopathy mutations were detected in the DMD gene in 81.1 % of patients. Further analysis of the WES results of the remaining individuals, allowed us to identify possibly pathogenic molecular alterations, in other MD associated genes, in 11 of them (10.4 %). Thus, reaching a WES detection rate of 91.5 %. We found 2 large deletions in SGCA and SGCD by MLPA. Finally, our work highlights the importance of extending the mutation screening to all the MD associated genes in patients without alterations in DMD, given that a misdiagnosis could lead to an error in the selection of the standard of care.
publishDate 2019
dc.date.none.fl_str_mv 2019
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
info:eu-repo/semantics/conferenceObject
Reunión
Journal
http://purl.org/coar/resource_type/c_5794
info:ar-repo/semantics/documentoDeConferencia
status_str publishedVersion
format conferenceObject
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/247605
Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosis; LXIV Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Clínica; LI Reunión Anual de la Asociación Argentina de Farmacología Experimental; XXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biología; XXXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Protozoología; IX Reunión Anual de la Asociación Argentina de Nanomedicinas y VI Reunión Científica Regional de la Asociación Argentina de Ciencia y Tecnología de Animales de Laboratorio; Mar del Plata; Argentina; 2019; 1-4
0076-6046
1669-8983
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/247605
identifier_str_mv Diving the ocean of variants in pursuit of a muscular dystrophies differential diagnosis; LXIV Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Clínica; LI Reunión Anual de la Asociación Argentina de Farmacología Experimental; XXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biología; XXXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Protozoología; IX Reunión Anual de la Asociación Argentina de Nanomedicinas y VI Reunión Científica Regional de la Asociación Argentina de Ciencia y Tecnología de Animales de Laboratorio; Mar del Plata; Argentina; 2019; 1-4
0076-6046
1669-8983
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.saic.org.ar/revista-medicina
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv Nacional
dc.publisher.none.fl_str_mv Fundación Revista Medicina
publisher.none.fl_str_mv Fundación Revista Medicina
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1844613810089885696
score 13.070432

Publicaciones similares