Segmentation and 3D reconstruction of microbial biofilms

Autores
Bouchet, Agustina; Pastore, Juan Ignacio; Di Meglio, Leonardo Gabriel; Robuschi, Luciana; Ballarin, Virginia Laura
Año de publicación
2013
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Capability of microbial biofilms to form biofilms is really important in biotechnology industries, environmental applications and medical applications. Therefore, the study of the structure and development of these organisms is essential. In this paper we develop and implement an algorithm, based on Mathematical Morphology, to analyze the structure and growing of microbial biofilms. This algorithm allows segmentation of a stack of images acquired from in vivo observation of microorganisms, using an inverted phase contrast microscope. Finally, a 3D reconstruction for an efficient visualization of the structure and topography of biofilms is done.
Fil: Bouchet, Agustina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Laboratorio de Procesos y Medición de Señales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Pastore, Juan Ignacio. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Laboratorio de Procesos y Medición de Señales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Di Meglio, Leonardo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Biológicas. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas; Argentina
Fil: Robuschi, Luciana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Ciencia y Tecnología de Materiales. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Instituto de Investigaciones en Ciencia y Tecnología de Materiales; Argentina
Fil: Ballarin, Virginia Laura. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ingeniería. Laboratorio de Procesos y Medición de Señales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Materia
3d Reconstruction
Biofilms
Mathematical Morphology
Segmentation
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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