Design of stable large-scale metabolic networks

Autores
Di Maggio, Jimena Andrea; Blanco, Anibal Manuel; Bandoni, Jose Alberto; Díaz, María Soledad
Año de publicación
2009
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
In this work we propose an eigenvalue optimization approach to ensure steady state stability of the Embden-Meyerhof-Parnas pathway, the pentose-phosphate pathway and the phosphotransferase system of Escherichia coli. The model consists of eighteen differential equations that represent dynamic mass balances for extracellular glucose and intracellular metabolites and thirty kinetic rate expressions. The nonlinear optimization problem including stability constraints has been solved with reduced space Successive Quadratic Programming techniques within program IPOPT (Waechter and Biegler et al., 2006). Numerical results provide useful insights on the stability properties of the studied kinetic model. © 2009 Elsevier B.V. All rights reserved.
Fil: Di Maggio, Jimena Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Planta Piloto de Ingeniería Química. Universidad Nacional del Sur. Planta Piloto de Ingeniería Química; Argentina
Fil: Blanco, Anibal Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Planta Piloto de Ingeniería Química. Universidad Nacional del Sur. Planta Piloto de Ingeniería Química; Argentina
Fil: Bandoni, Jose Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Planta Piloto de Ingeniería Química. Universidad Nacional del Sur. Planta Piloto de Ingeniería Química; Argentina
Fil: Díaz, María Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Planta Piloto de Ingeniería Química. Universidad Nacional del Sur. Planta Piloto de Ingeniería Química; Argentina
Materia
Eigenvalue Optimization
Metabolic Networks
Stability
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
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Acceder
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