GPU accelerated Monte Carlo simulation of light propagation in inhomogeneous fluorescent turbid media: Application to whole field CW imaging

Autores
Carbone, Nicolás Abel; Iriarte, Daniela Ines; Pomarico, Juan Antonio
Año de publicación
2017
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
We present an implementation of a Monte Carlo simulation software for fluorescent turbid media, accelerated by aGPU (graphic processing unit). The code is based on previous work by Alerstam et al (2008 J. Biomed. Opt. 13 060504) and Wang et al (1995 Comput. Methods Programs Biomed. 47 131-46), with the addition of a voxelized medium without symmetries and with an inhomogeneous distribution of absorbers and fluorescent markers. Cartesian coordinates are used in place of the cylindrical ones used in previous versions. It is particularly aimed at the simulation ofCWwhole-field reflectance and transmittance images of fluorescence and absorption. Several tests and comparisons with numerical and theoretical techniques were performed in order to validate our approach.
Fil: Carbone, Nicolás Abel. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigaciones en Física e Ingeniería del Centro de la Provincia de Buenos Aires. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigaciones en Física e Ingeniería del Centro de la Provincia de Buenos Aires. - Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones en Física e Ingeniería del Centro de la Provincia de Buenos Aires; Argentina
Fil: Iriarte, Daniela Ines. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigaciones en Física e Ingeniería del Centro de la Provincia de Buenos Aires. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigaciones en Física e Ingeniería del Centro de la Provincia de Buenos Aires. - Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones en Física e Ingeniería del Centro de la Provincia de Buenos Aires; Argentina
Fil: Pomarico, Juan Antonio. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigaciones en Física e Ingeniería del Centro de la Provincia de Buenos Aires. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigaciones en Física e Ingeniería del Centro de la Provincia de Buenos Aires. - Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones en Física e Ingeniería del Centro de la Provincia de Buenos Aires; Argentina
Materia
Fluorescence
Gpgpu
Monte Carlo
Nir
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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Acceder
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