Monitoring of SARS-CoV-2 RNA in wastewater as an epidemiological surveillance tool in Mendoza, Argentina

Autores
Giraud Billoud, Maximiliano German; Cuervo, María Paula; Altamirano, Jorgelina Cecilia; Pizarro, Marcela; Aranibar, Julieta Nelida; Catapano, Adolfo; Cuello, Héctor; Masachessi, Gisela; Vega, Israel Aníbal
Año de publicación
2021
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Wastewater-based epidemiology (WBE) is an emerging tool that gives temporal and spatial information on a population's health status. Here, we report the epidemiological dynamics of a population of ~1.2 million residents in the metropolitan region of Mendoza province, Argentina, within the period July 2020 to January 2021. We combined the use of WBE of two wastewater treatment plants with epidemiological surveillance of the corresponding populations. We applied two viral concentration methods (polyethylene glycol precipitation and aluminum-based adsorption-flocculation) and RNA isolation methods in each wastewater sample to increase the possibility of detection and quantification of nucleocapsid markers (N1 and N2) of SARS-CoV-2 by RT-qPCR. Overall, our results allowed us to trace the rise, exponential growth, plateau, and fall of SARS-CoV-2 infections for 26 weeks. Individual analysis for each wastewater treatment plant showed a positive correlation between the viral load of SARS-CoV-2 genetic markers and COVID-19 cases that were diagnosed per week. Our findings indicate that WBE is a useful epidemiological indicator to anticipate the increase in COVID-19 cases and monitor the advance of the pandemic and different waves of infections.
Fil: Giraud Billoud, Maximiliano German. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina
Fil: Cuervo, María Paula. Universidad Nacional de Cuyo; Argentina
Fil: Altamirano, Jorgelina Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales. Provincia de Mendoza. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales. Universidad Nacional de Cuyo. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales; Argentina
Fil: Pizarro, Marcela. Universidad Nacional de Cuyo; Argentina
Fil: Aranibar, Julieta Nelida. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales. Provincia de Mendoza. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales. Universidad Nacional de Cuyo. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales; Argentina
Fil: Catapano, Adolfo. Agua y Saneamientos de Mendoza; Argentina
Fil: Cuello, Héctor. Gobierno de la Provincia de Mendoza. Hospital Central de Mendoza.; Argentina
Fil: Masachessi, Gisela. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Medicina. Instituto de Virología Dr. J. M. Vanella; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Vega, Israel Aníbal. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina
Materia
COVID-19
EPIDEMIOLOGIC SURVEILLANCE
PANDEMIC
SARS-COV-2
WASTEWATER-BASED EPIDEMIOLOGY
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
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Institución
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We applied two viral concentration methods (polyethylene glycol precipitation and aluminum-based adsorption-flocculation) and RNA isolation methods in each wastewater sample to increase the possibility of detection and quantification of nucleocapsid markers (N1 and N2) of SARS-CoV-2 by RT-qPCR. Overall, our results allowed us to trace the rise, exponential growth, plateau, and fall of SARS-CoV-2 infections for 26 weeks. Individual analysis for each wastewater treatment plant showed a positive correlation between the viral load of SARS-CoV-2 genetic markers and COVID-19 cases that were diagnosed per week. Our findings indicate that WBE is a useful epidemiological indicator to anticipate the increase in COVID-19 cases and monitor the advance of the pandemic and different waves of infections.Fil: Giraud Billoud, Maximiliano German. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; ArgentinaFil: Cuervo, María Paula. Universidad Nacional de Cuyo; ArgentinaFil: Altamirano, Jorgelina Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales. Provincia de Mendoza. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales. Universidad Nacional de Cuyo. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales; ArgentinaFil: Pizarro, Marcela. Universidad Nacional de Cuyo; ArgentinaFil: Aranibar, Julieta Nelida. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales. Provincia de Mendoza. 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