Development of novel ssr molecular markers using a next-generation sequencing approach (Ddradseq) in stetsonia coryne (cactaceae)

Autores
Gutiérrez, Angela Verónica; Filippi, Carla Valeria; Aguirre, Natalia Cristina; Puebla, Andrea Fabiana; Acuña, Cintia Vanesa; Taboada, Gisel María; Ortega Baes, Francisco Pablo
Año de publicación
2021
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
The Cactaceae family is native to the American continent with several centers of diversity. In South America, one of these centers is the Central Andes and many species are considered to be threatened or vulnerable according to the International Union for Conservation of Nature (IUCN). Stetsonia Coryne is an emblematic giant columnar of the Chaco phytogeographic province. It has an extensive geographical distribution in many countries of the continent. However, to date there are no specific molecular markers for this species, neither reports of population genetic variability studies, such as for many cactus species. The lack of information is fundamentally due to the lack of molecular markers that allow these studies. In this work, by applying a Genotyping by Sequencing (GBS) technique, we developed polymorphic SSR markers for the Stetsonia coryne and evaluated their transferability to phylogenetically close species, in order to account for a robust panel of molecular markers for multispecies-studies within Cactaceae.
Fil: Gutiérrez, Angela Verónica. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Agronomía. Laboratorio de Investigaciones Botánicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Gerencia de Gestion Estrategica de Procesos Complementarios.; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Filippi, Carla Valeria. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Gerencia de Gestion Estrategica de Procesos Complementarios.; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Aguirre, Natalia Cristina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Gerencia de Gestion Estrategica de Procesos Complementarios.; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Puebla, Andrea Fabiana. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Gerencia de Gestion Estrategica de Procesos Complementarios.; Argentina
Fil: Acuña, Cintia Vanesa. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Gerencia de Gestion Estrategica de Procesos Complementarios.; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Taboada, Gisel María. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Agronomía. Laboratorio de Investigaciones Botánicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina
Fil: Ortega Baes, Francisco Pablo. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Agronomía. Laboratorio de Investigaciones Botánicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina
Materia
CACTACEAE
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Nivel de accesibilidad
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Condiciones de uso
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Repositorio
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Institución
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However, to date there are no specific molecular markers for this species, neither reports of population genetic variability studies, such as for many cactus species. The lack of information is fundamentally due to the lack of molecular markers that allow these studies. In this work, by applying a Genotyping by Sequencing (GBS) technique, we developed polymorphic SSR markers for the Stetsonia coryne and evaluated their transferability to phylogenetically close species, in order to account for a robust panel of molecular markers for multispecies-studies within Cactaceae.Fil: Gutiérrez, Angela Verónica. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Agronomía. Laboratorio de Investigaciones Botánicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Gerencia de Gestion Estrategica de Procesos Complementarios.; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. 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