The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic Transfer

Autores
Montaña, Sabrina Daiana; Schramm, Sareda T. J.; Traglia, German Matias; Chiem, Kevin; Parmeciano Di Noto, Gisela Paula; Almuzara, Marisa; Barberis, Claudia; Vay, Carlos Alberto; Quiroga, Cecilia; Tolmasky, Marcelo E.; Iriarte, Andrés; Ramirez, Maria Soledad
Año de publicación
2016
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Acinetobacter johnsonii rarely causes human infections. While most A. johnsonii isolates are susceptible to virtually all antibiotics, strains harboring a variety of β-lactamases have recently been described. An A. johnsonii Aj2199 clinical strain recovered from a hospital in Buenos Aires produces PER-2 and OXA-58. We decided to delve into its genome by obtaining the whole genome sequence of the Aj2199 strain. Genome comparison studies on Aj2199 revealed 240 unique genes and a close relation to strain WJ10621, isolated from the urine of a patient in China. Genomic analysis showed evidence of horizontal genetic transfer (HGT) events. Forty-five insertion sequences and two intact prophages were found in addition to several resistance determinants such as blaPER-2, blaOXA-58, blaTEM-1, strA, strB, ereA, sul1, aacC2 and a new variant of blaOXA-211, called blaOXA-498. In particular, blaPER-2 and blaTEM-1 are present within the typical contexts previously described in the Enterobacteriaceae family. These results suggest that A. johnsonii actively acquires exogenous DNA from other bacterial species and concomitantly becomes a reservoir of resistance genes.
Fil: Montaña, Sabrina Daiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Schramm, Sareda T. J.. California State University; Estados Unidos
Fil: Traglia, German Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Chiem, Kevin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina. California State University; Estados Unidos
Fil: Parmeciano Di Noto, Gisela Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Almuzara, Marisa. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentina
Fil: Barberis, Claudia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina
Fil: Vay, Carlos Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina
Fil: Quiroga, Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Tolmasky, Marcelo E.. California State University; Estados Unidos
Fil: Iriarte, Andrés. Universidad de la República; Uruguay
Fil: Ramirez, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina. California State University; Estados Unidos
Materia
Acinetobacter Johnsonii
Horizontal Genetic Transfer
Per-2
Antibiotic Resistance
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/47547

id CONICETDig_79a50cb0abfc7c43aee96c2fb87e3958
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/47547
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic TransferMontaña, Sabrina DaianaSchramm, Sareda T. J.Traglia, German MatiasChiem, KevinParmeciano Di Noto, Gisela PaulaAlmuzara, MarisaBarberis, ClaudiaVay, Carlos AlbertoQuiroga, CeciliaTolmasky, Marcelo E.Iriarte, AndrésRamirez, Maria SoledadAcinetobacter JohnsoniiHorizontal Genetic TransferPer-2Antibiotic Resistancehttps://purl.org/becyt/ford/3.3https://purl.org/becyt/ford/3Acinetobacter johnsonii rarely causes human infections. While most A. johnsonii isolates are susceptible to virtually all antibiotics, strains harboring a variety of β-lactamases have recently been described. An A. johnsonii Aj2199 clinical strain recovered from a hospital in Buenos Aires produces PER-2 and OXA-58. We decided to delve into its genome by obtaining the whole genome sequence of the Aj2199 strain. Genome comparison studies on Aj2199 revealed 240 unique genes and a close relation to strain WJ10621, isolated from the urine of a patient in China. Genomic analysis showed evidence of horizontal genetic transfer (HGT) events. Forty-five insertion sequences and two intact prophages were found in addition to several resistance determinants such as blaPER-2, blaOXA-58, blaTEM-1, strA, strB, ereA, sul1, aacC2 and a new variant of blaOXA-211, called blaOXA-498. In particular, blaPER-2 and blaTEM-1 are present within the typical contexts previously described in the Enterobacteriaceae family. These results suggest that A. johnsonii actively acquires exogenous DNA from other bacterial species and concomitantly becomes a reservoir of resistance genes.Fil: Montaña, Sabrina Daiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Schramm, Sareda T. J.. California State University; Estados UnidosFil: Traglia, German Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Chiem, Kevin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina. California State University; Estados UnidosFil: Parmeciano Di Noto, Gisela Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Almuzara, Marisa. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Barberis, Claudia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; ArgentinaFil: Vay, Carlos Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; ArgentinaFil: Quiroga, Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Tolmasky, Marcelo E.. California State University; Estados UnidosFil: Iriarte, Andrés. Universidad de la República; UruguayFil: Ramirez, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina. California State University; Estados UnidosPublic Library of Science2016-08info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/47547Montaña, Sabrina Daiana; Schramm, Sareda T. J.; Traglia, German Matias; Chiem, Kevin; Parmeciano Di Noto, Gisela Paula; et al.; The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic Transfer; Public Library of Science; Plos One; 11; 8; 8-2016; 1-20; e01615281932-6203CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0161528info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1371/journal.pone.0161528info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-29T10:27:59Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/47547instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-29 10:27:59.365CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic Transfer
title The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic Transfer
spellingShingle The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic Transfer
Montaña, Sabrina Daiana
Acinetobacter Johnsonii
Horizontal Genetic Transfer
Per-2
Antibiotic Resistance
title_short The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic Transfer
title_full The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic Transfer
title_fullStr The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic Transfer
title_full_unstemmed The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic Transfer
title_sort The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic Transfer
dc.creator.none.fl_str_mv Montaña, Sabrina Daiana
Schramm, Sareda T. J.
Traglia, German Matias
Chiem, Kevin
Parmeciano Di Noto, Gisela Paula
Almuzara, Marisa
Barberis, Claudia
Vay, Carlos Alberto
Quiroga, Cecilia
Tolmasky, Marcelo E.
Iriarte, Andrés
Ramirez, Maria Soledad
author Montaña, Sabrina Daiana
author_facet Montaña, Sabrina Daiana
Schramm, Sareda T. J.
Traglia, German Matias
Chiem, Kevin
Parmeciano Di Noto, Gisela Paula
Almuzara, Marisa
Barberis, Claudia
Vay, Carlos Alberto
Quiroga, Cecilia
Tolmasky, Marcelo E.
Iriarte, Andrés
Ramirez, Maria Soledad
author_role author
author2 Schramm, Sareda T. J.
Traglia, German Matias
Chiem, Kevin
Parmeciano Di Noto, Gisela Paula
Almuzara, Marisa
Barberis, Claudia
Vay, Carlos Alberto
Quiroga, Cecilia
Tolmasky, Marcelo E.
Iriarte, Andrés
Ramirez, Maria Soledad
author2_role author
author
author
author
author
author
author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Acinetobacter Johnsonii
Horizontal Genetic Transfer
Per-2
Antibiotic Resistance
topic Acinetobacter Johnsonii
Horizontal Genetic Transfer
Per-2
Antibiotic Resistance
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/3.3
https://purl.org/becyt/ford/3
dc.description.none.fl_txt_mv Acinetobacter johnsonii rarely causes human infections. While most A. johnsonii isolates are susceptible to virtually all antibiotics, strains harboring a variety of β-lactamases have recently been described. An A. johnsonii Aj2199 clinical strain recovered from a hospital in Buenos Aires produces PER-2 and OXA-58. We decided to delve into its genome by obtaining the whole genome sequence of the Aj2199 strain. Genome comparison studies on Aj2199 revealed 240 unique genes and a close relation to strain WJ10621, isolated from the urine of a patient in China. Genomic analysis showed evidence of horizontal genetic transfer (HGT) events. Forty-five insertion sequences and two intact prophages were found in addition to several resistance determinants such as blaPER-2, blaOXA-58, blaTEM-1, strA, strB, ereA, sul1, aacC2 and a new variant of blaOXA-211, called blaOXA-498. In particular, blaPER-2 and blaTEM-1 are present within the typical contexts previously described in the Enterobacteriaceae family. These results suggest that A. johnsonii actively acquires exogenous DNA from other bacterial species and concomitantly becomes a reservoir of resistance genes.
Fil: Montaña, Sabrina Daiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Schramm, Sareda T. J.. California State University; Estados Unidos
Fil: Traglia, German Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Chiem, Kevin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina. California State University; Estados Unidos
Fil: Parmeciano Di Noto, Gisela Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Almuzara, Marisa. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentina
Fil: Barberis, Claudia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina
Fil: Vay, Carlos Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina
Fil: Quiroga, Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Tolmasky, Marcelo E.. California State University; Estados Unidos
Fil: Iriarte, Andrés. Universidad de la República; Uruguay
Fil: Ramirez, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina. California State University; Estados Unidos
description Acinetobacter johnsonii rarely causes human infections. While most A. johnsonii isolates are susceptible to virtually all antibiotics, strains harboring a variety of β-lactamases have recently been described. An A. johnsonii Aj2199 clinical strain recovered from a hospital in Buenos Aires produces PER-2 and OXA-58. We decided to delve into its genome by obtaining the whole genome sequence of the Aj2199 strain. Genome comparison studies on Aj2199 revealed 240 unique genes and a close relation to strain WJ10621, isolated from the urine of a patient in China. Genomic analysis showed evidence of horizontal genetic transfer (HGT) events. Forty-five insertion sequences and two intact prophages were found in addition to several resistance determinants such as blaPER-2, blaOXA-58, blaTEM-1, strA, strB, ereA, sul1, aacC2 and a new variant of blaOXA-211, called blaOXA-498. In particular, blaPER-2 and blaTEM-1 are present within the typical contexts previously described in the Enterobacteriaceae family. These results suggest that A. johnsonii actively acquires exogenous DNA from other bacterial species and concomitantly becomes a reservoir of resistance genes.
publishDate 2016
dc.date.none.fl_str_mv 2016-08
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/47547
Montaña, Sabrina Daiana; Schramm, Sareda T. J.; Traglia, German Matias; Chiem, Kevin; Parmeciano Di Noto, Gisela Paula; et al.; The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic Transfer; Public Library of Science; Plos One; 11; 8; 8-2016; 1-20; e0161528
1932-6203
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/47547
identifier_str_mv Montaña, Sabrina Daiana; Schramm, Sareda T. J.; Traglia, German Matias; Chiem, Kevin; Parmeciano Di Noto, Gisela Paula; et al.; The Genetic Analysis of an Acinetobacter johnsonii Clinical Strain Evidenced the Presence of Horizontal Genetic Transfer; Public Library of Science; Plos One; 11; 8; 8-2016; 1-20; e0161528
1932-6203
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0161528
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1371/journal.pone.0161528
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Public Library of Science
publisher.none.fl_str_mv Public Library of Science
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1844614282685186048
score 13.070432