Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasas

Autores
Carena, Santiago; Alonso, Guillermo Daniel; Ocampo, Josefina
Año de publicación
2022
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Trypanosoma cruzi, causante de la enfermedad de Chagas, posee un ciclo de vida en el que alterna entre el insecto hematófago Triatoma infestans y el mamífero hospedero, exponiéndose a cambios abruptos en su entorno. Para adaptarse, requiere de cambios en la expresión génica, regulando mayormente a nivel post transcripcional. No obstante, parte de la regulación está dada a nivel epigenético, mediante modificaciones post traduccionales (MPTs) de histonas. Dentro de los modificadores se encuentran las metiltransferasas SET -caracterizadas por poseer un dominio conservado formando un pseudoknot- que en T. cruzi aún no han sido estudiadas. En este trabajo realizamos una búsqueda de posibles factores que interactúan con la cromatina de T. cruzi e iniciamos la caracterización de proteínas con dominio SET. Identificamos 8 TcSets putativas (TcSET10, TcSET16, TcSET17, TcSET20, TcSET23, TcSET25, TcSET26 y TcSET27) de probable localización nuclear y confirmamos la conservación parcial del dominio SET prototipo. Sin embrago, 4 de estas (TcSET16, TcSET25, TcSET26 y TcSET27) carecen de residuos claves para la catálisis. Analizando sus estructuras predichas por Alphafold, observamos que el pseudoknot está conservado en todas. Comparándolas con las ortólogas en T. brucei detectamos: una alta similitud de secuencia para la mayoría de las proteínas, y mediante alineamientos estructurales una semejanza estructural alta, siendo TcSET26 la excepción en ambos casos. Comparando con la estructura de la metiltransferasa humana SET7/9, encontramos que el sitio catalítico está espacialmente bien conservado en TcSET23 y TcSET20. Por otro lado, analizando datos de transcriptómica, observamos variación en los niveles de ARN mensajero de algunas TcSets en distintos estadios, sugiriendo un posible rol diferencial en su ciclo de vida.
Fil: Carena, Santiago. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
Fil: Alonso, Guillermo Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
Fil: Ocampo, Josefina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
XI Congreso de la Sociedad Argentina de Protozoología
Mendoza
Argentina
Sociedad Argentina de Protozoología
Materia
ENFERMEDAD DE CHAGAS
EPIGENÉTICA
HISTONA
METILACION
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/218318
Acceder
id CONICETDig_79713fc048a2436902f5b9549a8ecbbc
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/218318
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasasCarena, SantiagoAlonso, Guillermo DanielOcampo, JosefinaENFERMEDAD DE CHAGASEPIGENÉTICAHISTONAMETILACIONhttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1Trypanosoma cruzi, causante de la enfermedad de Chagas, posee un ciclo de vida en el que alterna entre el insecto hematófago Triatoma infestans y el mamífero hospedero, exponiéndose a cambios abruptos en su entorno. Para adaptarse, requiere de cambios en la expresión génica, regulando mayormente a nivel post transcripcional. No obstante, parte de la regulación está dada a nivel epigenético, mediante modificaciones post traduccionales (MPTs) de histonas. Dentro de los modificadores se encuentran las metiltransferasas SET -caracterizadas por poseer un dominio conservado formando un pseudoknot- que en T. cruzi aún no han sido estudiadas. En este trabajo realizamos una búsqueda de posibles factores que interactúan con la cromatina de T. cruzi e iniciamos la caracterización de proteínas con dominio SET. Identificamos 8 TcSets putativas (TcSET10, TcSET16, TcSET17, TcSET20, TcSET23, TcSET25, TcSET26 y TcSET27) de probable localización nuclear y confirmamos la conservación parcial del dominio SET prototipo. Sin embrago, 4 de estas (TcSET16, TcSET25, TcSET26 y TcSET27) carecen de residuos claves para la catálisis. Analizando sus estructuras predichas por Alphafold, observamos que el pseudoknot está conservado en todas. Comparándolas con las ortólogas en T. brucei detectamos: una alta similitud de secuencia para la mayoría de las proteínas, y mediante alineamientos estructurales una semejanza estructural alta, siendo TcSET26 la excepción en ambos casos. Comparando con la estructura de la metiltransferasa humana SET7/9, encontramos que el sitio catalítico está espacialmente bien conservado en TcSET23 y TcSET20. Por otro lado, analizando datos de transcriptómica, observamos variación en los niveles de ARN mensajero de algunas TcSets en distintos estadios, sugiriendo un posible rol diferencial en su ciclo de vida.Fil: Carena, Santiago. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; ArgentinaFil: Alonso, Guillermo Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; ArgentinaFil: Ocampo, Josefina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; ArgentinaXI Congreso de la Sociedad Argentina de ProtozoologíaMendozaArgentinaSociedad Argentina de ProtozoologíaUniversidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas2022info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/conferenceObjectCongresoJournalhttp://purl.org/coar/resource_type/c_5794info:ar-repo/semantics/documentoDeConferenciaapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/218318Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasas; XI Congreso de la Sociedad Argentina de Protozoología; Mendoza; Argentina; 2022; 118-1181669-8991CONICET DigitalCONICETspainfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://bdigital.uncu.edu.ar/objetos_digitales/17095/resumenes-congreso-sap.pdfinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://protozoologia.org.ar/congresos-y-reuniones-sap/congreso-sap-2022/Internacionalinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-03T09:44:32Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/218318instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-03 09:44:33.084CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasas
title Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasas
spellingShingle Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasas
Carena, Santiago
ENFERMEDAD DE CHAGAS
EPIGENÉTICA
HISTONA
METILACION
title_short Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasas
title_full Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasas
title_fullStr Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasas
title_full_unstemmed Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasas
title_sort Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasas
dc.creator.none.fl_str_mv Carena, Santiago
Alonso, Guillermo Daniel
Ocampo, Josefina
author Carena, Santiago
author_facet Carena, Santiago
Alonso, Guillermo Daniel
Ocampo, Josefina
author_role author
author2 Alonso, Guillermo Daniel
Ocampo, Josefina
author2_role author
author
dc.subject.none.fl_str_mv ENFERMEDAD DE CHAGAS
EPIGENÉTICA
HISTONA
METILACION
topic ENFERMEDAD DE CHAGAS
EPIGENÉTICA
HISTONA
METILACION
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv Trypanosoma cruzi, causante de la enfermedad de Chagas, posee un ciclo de vida en el que alterna entre el insecto hematófago Triatoma infestans y el mamífero hospedero, exponiéndose a cambios abruptos en su entorno. Para adaptarse, requiere de cambios en la expresión génica, regulando mayormente a nivel post transcripcional. No obstante, parte de la regulación está dada a nivel epigenético, mediante modificaciones post traduccionales (MPTs) de histonas. Dentro de los modificadores se encuentran las metiltransferasas SET -caracterizadas por poseer un dominio conservado formando un pseudoknot- que en T. cruzi aún no han sido estudiadas. En este trabajo realizamos una búsqueda de posibles factores que interactúan con la cromatina de T. cruzi e iniciamos la caracterización de proteínas con dominio SET. Identificamos 8 TcSets putativas (TcSET10, TcSET16, TcSET17, TcSET20, TcSET23, TcSET25, TcSET26 y TcSET27) de probable localización nuclear y confirmamos la conservación parcial del dominio SET prototipo. Sin embrago, 4 de estas (TcSET16, TcSET25, TcSET26 y TcSET27) carecen de residuos claves para la catálisis. Analizando sus estructuras predichas por Alphafold, observamos que el pseudoknot está conservado en todas. Comparándolas con las ortólogas en T. brucei detectamos: una alta similitud de secuencia para la mayoría de las proteínas, y mediante alineamientos estructurales una semejanza estructural alta, siendo TcSET26 la excepción en ambos casos. Comparando con la estructura de la metiltransferasa humana SET7/9, encontramos que el sitio catalítico está espacialmente bien conservado en TcSET23 y TcSET20. Por otro lado, analizando datos de transcriptómica, observamos variación en los niveles de ARN mensajero de algunas TcSets en distintos estadios, sugiriendo un posible rol diferencial en su ciclo de vida.
Fil: Carena, Santiago. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
Fil: Alonso, Guillermo Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
Fil: Ocampo, Josefina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
XI Congreso de la Sociedad Argentina de Protozoología
Mendoza
Argentina
Sociedad Argentina de Protozoología
description Trypanosoma cruzi, causante de la enfermedad de Chagas, posee un ciclo de vida en el que alterna entre el insecto hematófago Triatoma infestans y el mamífero hospedero, exponiéndose a cambios abruptos en su entorno. Para adaptarse, requiere de cambios en la expresión génica, regulando mayormente a nivel post transcripcional. No obstante, parte de la regulación está dada a nivel epigenético, mediante modificaciones post traduccionales (MPTs) de histonas. Dentro de los modificadores se encuentran las metiltransferasas SET -caracterizadas por poseer un dominio conservado formando un pseudoknot- que en T. cruzi aún no han sido estudiadas. En este trabajo realizamos una búsqueda de posibles factores que interactúan con la cromatina de T. cruzi e iniciamos la caracterización de proteínas con dominio SET. Identificamos 8 TcSets putativas (TcSET10, TcSET16, TcSET17, TcSET20, TcSET23, TcSET25, TcSET26 y TcSET27) de probable localización nuclear y confirmamos la conservación parcial del dominio SET prototipo. Sin embrago, 4 de estas (TcSET16, TcSET25, TcSET26 y TcSET27) carecen de residuos claves para la catálisis. Analizando sus estructuras predichas por Alphafold, observamos que el pseudoknot está conservado en todas. Comparándolas con las ortólogas en T. brucei detectamos: una alta similitud de secuencia para la mayoría de las proteínas, y mediante alineamientos estructurales una semejanza estructural alta, siendo TcSET26 la excepción en ambos casos. Comparando con la estructura de la metiltransferasa humana SET7/9, encontramos que el sitio catalítico está espacialmente bien conservado en TcSET23 y TcSET20. Por otro lado, analizando datos de transcriptómica, observamos variación en los niveles de ARN mensajero de algunas TcSets en distintos estadios, sugiriendo un posible rol diferencial en su ciclo de vida.
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
info:eu-repo/semantics/conferenceObject
Congreso
Journal
http://purl.org/coar/resource_type/c_5794
info:ar-repo/semantics/documentoDeConferencia
status_str publishedVersion
format conferenceObject
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/218318
Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasas; XI Congreso de la Sociedad Argentina de Protozoología; Mendoza; Argentina; 2022; 118-118
1669-8991
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/218318
identifier_str_mv Búsqueda de posibles factores que interactúen con la cromatina de Trypanosoma cruzi y análisis de potenciales SET metiltransferasas; XI Congreso de la Sociedad Argentina de Protozoología; Mendoza; Argentina; 2022; 118-118
1669-8991
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://bdigital.uncu.edu.ar/objetos_digitales/17095/resumenes-congreso-sap.pdf
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://protozoologia.org.ar/congresos-y-reuniones-sap/congreso-sap-2022/
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv Internacional
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas
publisher.none.fl_str_mv Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1842268673887174656
score 13.13397

Publicaciones similares