Population structure in Argentina
- Autores
- Muzzio, Marina; Motti, Josefina María Brenda; Paz Sepúlveda, Paula Beatriz; Yee, Muh Ching; Cooke, Thomas; Santos, María Rita; Ramallo, Virginia; Alfaro Gómez, Emma Laura; Dipierri, Jose Edgardo; Bailliet, Graciela; Bravi, Claudio Marcelo; Bustamante, Carlos D.; Kenny, Eimear
- Año de publicación
- 2018
- Idioma
- inglés
- Tipo de recurso
- artículo
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- We analyzed 391 samples from 12 Argentinian populations from the Center-West, East and North-West regions with the Illumina Human Exome Beadchip v1.0 (HumanExome-12v1-A). We did Principal Components analysis to infer patterns of populational divergence and migrations. We identified proportions and patterns of European, African and Native American ancestry and found a correlation between distance to Buenos Aires and proportion of Native American ancestry, where the highest proportion corresponds to the Northernmost populations, which is also the furthest from the Argentinian capital. Most of the European sources are from a South European origin, matching historical records, and we see two different Native American components, one that spreads all over Argentina and another specifically Andean. The highest percentages of African ancestry were in the Center West of Argentina, where the old trade routes took the slaves from Buenos Aires to Chile and Peru. Subcontinentaly, sources of this African component are represented by both West Africa and groups influenced by the Bantu expansion, the second slightly higher than the first, unlike North America and the Caribbean, where the main source is West Africa. This is reasonable, considering that a large proportion of the ships arriving at the Southern Hemisphere came from Mozambique, Loango and Angola.
Fil: Muzzio, Marina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
Fil: Motti, Josefina María Brenda. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Sociales. Departamento de Arqueología. Laboratorio de Ecología Evolutiva Humana (Sede Quequén); Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
Fil: Paz Sepúlveda, Paula Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
Fil: Yee, Muh Ching. University of Stanford; Estados Unidos
Fil: Cooke, Thomas. University of Stanford; Estados Unidos
Fil: Santos, María Rita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
Fil: Ramallo, Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico; Argentina
Fil: Alfaro Gómez, Emma Laura. Universidad Nacional de Jujuy. Instituto de Ecorregiones Andinas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Ecorregiones Andinas; Argentina
Fil: Dipierri, Jose Edgardo. Universidad Nacional de Jujuy. Instituto de Ecorregiones Andinas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Ecorregiones Andinas; Argentina
Fil: Bailliet, Graciela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
Fil: Bravi, Claudio Marcelo. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
Fil: Bustamante, Carlos D.. University of Stanford; Estados Unidos
Fil: Kenny, Eimear. Icahn School of Medicine; Estados Unidos - Materia
-
ARGENTINA
ADMIXTURE
POPULATION STRUCTURE
NATIVE AMERICAN
AFRICAN
EUROPEAN - Nivel de accesibilidad
- acceso abierto
- Condiciones de uso
- https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
- Repositorio
- Institución
- Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
- OAI Identificador
- oai:ri.conicet.gov.ar:11336/95429
Ver los metadatos del registro completo
id |
CONICETDig_63fb6108723bbc2b0aa3c909486af16c |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/95429 |
network_acronym_str |
CONICETDig |
repository_id_str |
3498 |
network_name_str |
CONICET Digital (CONICET) |
spelling |
Population structure in ArgentinaMuzzio, MarinaMotti, Josefina María BrendaPaz Sepúlveda, Paula BeatrizYee, Muh ChingCooke, ThomasSantos, María RitaRamallo, VirginiaAlfaro Gómez, Emma LauraDipierri, Jose EdgardoBailliet, GracielaBravi, Claudio MarceloBustamante, Carlos D.Kenny, EimearARGENTINAADMIXTUREPOPULATION STRUCTURENATIVE AMERICANAFRICANEUROPEANhttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1https://purl.org/becyt/ford/6.5https://purl.org/becyt/ford/6We analyzed 391 samples from 12 Argentinian populations from the Center-West, East and North-West regions with the Illumina Human Exome Beadchip v1.0 (HumanExome-12v1-A). We did Principal Components analysis to infer patterns of populational divergence and migrations. We identified proportions and patterns of European, African and Native American ancestry and found a correlation between distance to Buenos Aires and proportion of Native American ancestry, where the highest proportion corresponds to the Northernmost populations, which is also the furthest from the Argentinian capital. Most of the European sources are from a South European origin, matching historical records, and we see two different Native American components, one that spreads all over Argentina and another specifically Andean. The highest percentages of African ancestry were in the Center West of Argentina, where the old trade routes took the slaves from Buenos Aires to Chile and Peru. Subcontinentaly, sources of this African component are represented by both West Africa and groups influenced by the Bantu expansion, the second slightly higher than the first, unlike North America and the Caribbean, where the main source is West Africa. This is reasonable, considering that a large proportion of the ships arriving at the Southern Hemisphere came from Mozambique, Loango and Angola.Fil: Muzzio, Marina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; ArgentinaFil: Motti, Josefina María Brenda. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Sociales. Departamento de Arqueología. Laboratorio de Ecología Evolutiva Humana (Sede Quequén); Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; ArgentinaFil: Paz Sepúlveda, Paula Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; ArgentinaFil: Yee, Muh Ching. University of Stanford; Estados UnidosFil: Cooke, Thomas. University of Stanford; Estados UnidosFil: Santos, María Rita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; ArgentinaFil: Ramallo, Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico; ArgentinaFil: Alfaro Gómez, Emma Laura. Universidad Nacional de Jujuy. Instituto de Ecorregiones Andinas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Ecorregiones Andinas; ArgentinaFil: Dipierri, Jose Edgardo. Universidad Nacional de Jujuy. Instituto de Ecorregiones Andinas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Ecorregiones Andinas; ArgentinaFil: Bailliet, Graciela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; ArgentinaFil: Bravi, Claudio Marcelo. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; ArgentinaFil: Bustamante, Carlos D.. University of Stanford; Estados UnidosFil: Kenny, Eimear. Icahn School of Medicine; Estados UnidosPublic Library of Science2018-05info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/95429Muzzio, Marina; Motti, Josefina María Brenda; Paz Sepúlveda, Paula Beatriz; Yee, Muh Ching; Cooke, Thomas; et al.; Population structure in Argentina; Public Library of Science; Plos One; 13; 5; 5-2018; 1-131932-6203CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0196325info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1371/journal.pone.0196325info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-03T10:01:29Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/95429instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-03 10:01:29.584CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Population structure in Argentina |
title |
Population structure in Argentina |
spellingShingle |
Population structure in Argentina Muzzio, Marina ARGENTINA ADMIXTURE POPULATION STRUCTURE NATIVE AMERICAN AFRICAN EUROPEAN |
title_short |
Population structure in Argentina |
title_full |
Population structure in Argentina |
title_fullStr |
Population structure in Argentina |
title_full_unstemmed |
Population structure in Argentina |
title_sort |
Population structure in Argentina |
dc.creator.none.fl_str_mv |
Muzzio, Marina Motti, Josefina María Brenda Paz Sepúlveda, Paula Beatriz Yee, Muh Ching Cooke, Thomas Santos, María Rita Ramallo, Virginia Alfaro Gómez, Emma Laura Dipierri, Jose Edgardo Bailliet, Graciela Bravi, Claudio Marcelo Bustamante, Carlos D. Kenny, Eimear |
author |
Muzzio, Marina |
author_facet |
Muzzio, Marina Motti, Josefina María Brenda Paz Sepúlveda, Paula Beatriz Yee, Muh Ching Cooke, Thomas Santos, María Rita Ramallo, Virginia Alfaro Gómez, Emma Laura Dipierri, Jose Edgardo Bailliet, Graciela Bravi, Claudio Marcelo Bustamante, Carlos D. Kenny, Eimear |
author_role |
author |
author2 |
Motti, Josefina María Brenda Paz Sepúlveda, Paula Beatriz Yee, Muh Ching Cooke, Thomas Santos, María Rita Ramallo, Virginia Alfaro Gómez, Emma Laura Dipierri, Jose Edgardo Bailliet, Graciela Bravi, Claudio Marcelo Bustamante, Carlos D. Kenny, Eimear |
author2_role |
author author author author author author author author author author author author |
dc.subject.none.fl_str_mv |
ARGENTINA ADMIXTURE POPULATION STRUCTURE NATIVE AMERICAN AFRICAN EUROPEAN |
topic |
ARGENTINA ADMIXTURE POPULATION STRUCTURE NATIVE AMERICAN AFRICAN EUROPEAN |
purl_subject.fl_str_mv |
https://purl.org/becyt/ford/1.6 https://purl.org/becyt/ford/1 https://purl.org/becyt/ford/6.5 https://purl.org/becyt/ford/6 |
dc.description.none.fl_txt_mv |
We analyzed 391 samples from 12 Argentinian populations from the Center-West, East and North-West regions with the Illumina Human Exome Beadchip v1.0 (HumanExome-12v1-A). We did Principal Components analysis to infer patterns of populational divergence and migrations. We identified proportions and patterns of European, African and Native American ancestry and found a correlation between distance to Buenos Aires and proportion of Native American ancestry, where the highest proportion corresponds to the Northernmost populations, which is also the furthest from the Argentinian capital. Most of the European sources are from a South European origin, matching historical records, and we see two different Native American components, one that spreads all over Argentina and another specifically Andean. The highest percentages of African ancestry were in the Center West of Argentina, where the old trade routes took the slaves from Buenos Aires to Chile and Peru. Subcontinentaly, sources of this African component are represented by both West Africa and groups influenced by the Bantu expansion, the second slightly higher than the first, unlike North America and the Caribbean, where the main source is West Africa. This is reasonable, considering that a large proportion of the ships arriving at the Southern Hemisphere came from Mozambique, Loango and Angola. Fil: Muzzio, Marina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina Fil: Motti, Josefina María Brenda. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Sociales. Departamento de Arqueología. Laboratorio de Ecología Evolutiva Humana (Sede Quequén); Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina Fil: Paz Sepúlveda, Paula Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina Fil: Yee, Muh Ching. University of Stanford; Estados Unidos Fil: Cooke, Thomas. University of Stanford; Estados Unidos Fil: Santos, María Rita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina Fil: Ramallo, Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico; Argentina Fil: Alfaro Gómez, Emma Laura. Universidad Nacional de Jujuy. Instituto de Ecorregiones Andinas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Ecorregiones Andinas; Argentina Fil: Dipierri, Jose Edgardo. Universidad Nacional de Jujuy. Instituto de Ecorregiones Andinas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Ecorregiones Andinas; Argentina Fil: Bailliet, Graciela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina Fil: Bravi, Claudio Marcelo. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina Fil: Bustamante, Carlos D.. University of Stanford; Estados Unidos Fil: Kenny, Eimear. Icahn School of Medicine; Estados Unidos |
description |
We analyzed 391 samples from 12 Argentinian populations from the Center-West, East and North-West regions with the Illumina Human Exome Beadchip v1.0 (HumanExome-12v1-A). We did Principal Components analysis to infer patterns of populational divergence and migrations. We identified proportions and patterns of European, African and Native American ancestry and found a correlation between distance to Buenos Aires and proportion of Native American ancestry, where the highest proportion corresponds to the Northernmost populations, which is also the furthest from the Argentinian capital. Most of the European sources are from a South European origin, matching historical records, and we see two different Native American components, one that spreads all over Argentina and another specifically Andean. The highest percentages of African ancestry were in the Center West of Argentina, where the old trade routes took the slaves from Buenos Aires to Chile and Peru. Subcontinentaly, sources of this African component are represented by both West Africa and groups influenced by the Bantu expansion, the second slightly higher than the first, unlike North America and the Caribbean, where the main source is West Africa. This is reasonable, considering that a large proportion of the ships arriving at the Southern Hemisphere came from Mozambique, Loango and Angola. |
publishDate |
2018 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2018-05 |
dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 info:ar-repo/semantics/articulo |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/11336/95429 Muzzio, Marina; Motti, Josefina María Brenda; Paz Sepúlveda, Paula Beatriz; Yee, Muh Ching; Cooke, Thomas; et al.; Population structure in Argentina; Public Library of Science; Plos One; 13; 5; 5-2018; 1-13 1932-6203 CONICET Digital CONICET |
url |
http://hdl.handle.net/11336/95429 |
identifier_str_mv |
Muzzio, Marina; Motti, Josefina María Brenda; Paz Sepúlveda, Paula Beatriz; Yee, Muh Ching; Cooke, Thomas; et al.; Population structure in Argentina; Public Library of Science; Plos One; 13; 5; 5-2018; 1-13 1932-6203 CONICET Digital CONICET |
dc.language.none.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.relation.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0196325 info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1371/journal.pone.0196325 |
dc.rights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/ |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
rights_invalid_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/ |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf application/pdf application/pdf application/pdf application/pdf application/pdf application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Public Library of Science |
publisher.none.fl_str_mv |
Public Library of Science |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:CONICET Digital (CONICET) instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
reponame_str |
CONICET Digital (CONICET) |
collection |
CONICET Digital (CONICET) |
instname_str |
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
repository.name.fl_str_mv |
CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
repository.mail.fl_str_mv |
dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar |
_version_ |
1842269698505310208 |
score |
13.13397 |