“Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”

Autores
García Allende, Natalia; Alvarez, Verónica Elizabeth; Gonzales Machuca, Adrián Gustavo; Piekar, María; Carpio Diaz, Eduardo Jose; Molina, María Carolina; Campos, Josefina; Fox, Bárbara; Mendiondo, Nicolas; Aguilar, Andrea Pamela; Fernández Canigia, Liliana; Quiroga, María Paula; Centron, Daniela
Año de publicación
2024
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
We recently identified colonization and infection by KPCproducing Klebsiella pneumoniae strains in two patients from our Transplant Unit. Whole Genome Sequencing (WGS) performed with Illumina MiSeq revealed that strains from each patient were the same and belonged to ST11. Our findings emphasize the value of supporting effective antibiotic stewardship programs based on surveillance cultures for detecting colonised patients. In addition, WGS helped to demonstrate the nosocomial plasticity of K. pneumoniae ST11, with observed loss and acquisition of antibiotic resistance genes during hospitalisation, contributing to the understanding of the dynamics of antimicrobial resistance strains within the hospital...
Fil: García Allende, Natalia. Hospital Alemán; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Alvarez, Verónica Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Gonzales Machuca, Adrián Gustavo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Piekar, María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Carpio Diaz, Eduardo Jose. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Molina, María Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Campos, Josefina. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina
Fil: Fox, Bárbara. Hospital Alemán; Argentina
Fil: Mendiondo, Nicolas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Aguilar, Andrea Pamela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Fernández Canigia, Liliana. Hospital Alemán; Argentina
Fil: Quiroga, María Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Materia
WHOLE GENOME SEQUENCING
SURVEILLANCE PROGRAMS
CARBAPENEMASE-PRODUCING ENTEROBACTERIACEAE (CPE)
ANTIMICROBIAL RESISTANCE
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/262739
Acceder
id CONICETDig_5bc7b396e24424e176064ea2e4f8ceaf
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/262739
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling “Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”García Allende, NataliaAlvarez, Verónica ElizabethGonzales Machuca, Adrián GustavoPiekar, MaríaCarpio Diaz, Eduardo JoseMolina, María CarolinaCampos, JosefinaFox, BárbaraMendiondo, NicolasAguilar, Andrea PamelaFernández Canigia, LilianaQuiroga, María PaulaCentron, DanielaWHOLE GENOME SEQUENCINGSURVEILLANCE PROGRAMSCARBAPENEMASE-PRODUCING ENTEROBACTERIACEAE (CPE)ANTIMICROBIAL RESISTANCEhttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1We recently identified colonization and infection by KPCproducing Klebsiella pneumoniae strains in two patients from our Transplant Unit. Whole Genome Sequencing (WGS) performed with Illumina MiSeq revealed that strains from each patient were the same and belonged to ST11. Our findings emphasize the value of supporting effective antibiotic stewardship programs based on surveillance cultures for detecting colonised patients. In addition, WGS helped to demonstrate the nosocomial plasticity of K. pneumoniae ST11, with observed loss and acquisition of antibiotic resistance genes during hospitalisation, contributing to the understanding of the dynamics of antimicrobial resistance strains within the hospital...Fil: García Allende, Natalia. Hospital Alemán; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Alvarez, Verónica Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Gonzales Machuca, Adrián Gustavo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Piekar, María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Carpio Diaz, Eduardo Jose. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Molina, María Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Campos, Josefina. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; ArgentinaFil: Fox, Bárbara. Hospital Alemán; ArgentinaFil: Mendiondo, Nicolas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Aguilar, Andrea Pamela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Fernández Canigia, Liliana. Hospital Alemán; ArgentinaFil: Quiroga, María Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaElsevier2024-12info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/262739García Allende, Natalia; Alvarez, Verónica Elizabeth; Gonzales Machuca, Adrián Gustavo; Piekar, María; Carpio Diaz, Eduardo Jose; et al.; “Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”; Elsevier; Infection Prevention in Practice; 6; 4; 12-2024; 1-22590-0889CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2590088924000659info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1016/j.infpip.2024.100401info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-29T10:16:36Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/262739instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-29 10:16:36.583CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv “Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”
title “Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”
spellingShingle “Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”
García Allende, Natalia
WHOLE GENOME SEQUENCING
SURVEILLANCE PROGRAMS
CARBAPENEMASE-PRODUCING ENTEROBACTERIACEAE (CPE)
ANTIMICROBIAL RESISTANCE
title_short “Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”
title_full “Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”
title_fullStr “Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”
title_full_unstemmed “Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”
title_sort “Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”
dc.creator.none.fl_str_mv García Allende, Natalia
Alvarez, Verónica Elizabeth
Gonzales Machuca, Adrián Gustavo
Piekar, María
Carpio Diaz, Eduardo Jose
Molina, María Carolina
Campos, Josefina
Fox, Bárbara
Mendiondo, Nicolas
Aguilar, Andrea Pamela
Fernández Canigia, Liliana
Quiroga, María Paula
Centron, Daniela
author García Allende, Natalia
author_facet García Allende, Natalia
Alvarez, Verónica Elizabeth
Gonzales Machuca, Adrián Gustavo
Piekar, María
Carpio Diaz, Eduardo Jose
Molina, María Carolina
Campos, Josefina
Fox, Bárbara
Mendiondo, Nicolas
Aguilar, Andrea Pamela
Fernández Canigia, Liliana
Quiroga, María Paula
Centron, Daniela
author_role author
author2 Alvarez, Verónica Elizabeth
Gonzales Machuca, Adrián Gustavo
Piekar, María
Carpio Diaz, Eduardo Jose
Molina, María Carolina
Campos, Josefina
Fox, Bárbara
Mendiondo, Nicolas
Aguilar, Andrea Pamela
Fernández Canigia, Liliana
Quiroga, María Paula
Centron, Daniela
author2_role author
author
author
author
author
author
author
author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv WHOLE GENOME SEQUENCING
SURVEILLANCE PROGRAMS
CARBAPENEMASE-PRODUCING ENTEROBACTERIACEAE (CPE)
ANTIMICROBIAL RESISTANCE
topic WHOLE GENOME SEQUENCING
SURVEILLANCE PROGRAMS
CARBAPENEMASE-PRODUCING ENTEROBACTERIACEAE (CPE)
ANTIMICROBIAL RESISTANCE
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv We recently identified colonization and infection by KPCproducing Klebsiella pneumoniae strains in two patients from our Transplant Unit. Whole Genome Sequencing (WGS) performed with Illumina MiSeq revealed that strains from each patient were the same and belonged to ST11. Our findings emphasize the value of supporting effective antibiotic stewardship programs based on surveillance cultures for detecting colonised patients. In addition, WGS helped to demonstrate the nosocomial plasticity of K. pneumoniae ST11, with observed loss and acquisition of antibiotic resistance genes during hospitalisation, contributing to the understanding of the dynamics of antimicrobial resistance strains within the hospital...
Fil: García Allende, Natalia. Hospital Alemán; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Alvarez, Verónica Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Gonzales Machuca, Adrián Gustavo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Piekar, María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Carpio Diaz, Eduardo Jose. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Molina, María Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Campos, Josefina. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina
Fil: Fox, Bárbara. Hospital Alemán; Argentina
Fil: Mendiondo, Nicolas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Aguilar, Andrea Pamela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Fernández Canigia, Liliana. Hospital Alemán; Argentina
Fil: Quiroga, María Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
description We recently identified colonization and infection by KPCproducing Klebsiella pneumoniae strains in two patients from our Transplant Unit. Whole Genome Sequencing (WGS) performed with Illumina MiSeq revealed that strains from each patient were the same and belonged to ST11. Our findings emphasize the value of supporting effective antibiotic stewardship programs based on surveillance cultures for detecting colonised patients. In addition, WGS helped to demonstrate the nosocomial plasticity of K. pneumoniae ST11, with observed loss and acquisition of antibiotic resistance genes during hospitalisation, contributing to the understanding of the dynamics of antimicrobial resistance strains within the hospital...
publishDate 2024
dc.date.none.fl_str_mv 2024-12
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/262739
García Allende, Natalia; Alvarez, Verónica Elizabeth; Gonzales Machuca, Adrián Gustavo; Piekar, María; Carpio Diaz, Eduardo Jose; et al.; “Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”; Elsevier; Infection Prevention in Practice; 6; 4; 12-2024; 1-2
2590-0889
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/262739
identifier_str_mv García Allende, Natalia; Alvarez, Verónica Elizabeth; Gonzales Machuca, Adrián Gustavo; Piekar, María; Carpio Diaz, Eduardo Jose; et al.; “Contribution of the Whole Genome Sequencing to surveillance programs of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) strains”; Elsevier; Infection Prevention in Practice; 6; 4; 12-2024; 1-2
2590-0889
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2590088924000659
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1016/j.infpip.2024.100401
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Elsevier
publisher.none.fl_str_mv Elsevier
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1844614112004276224
score 13.070432

Publicaciones similares