QTL mapping of spike fertility index in bread wheat

Autores
Alonso, María Pía; Vanzetti, Leonardo Sebastián; Crescente, Juan Manuel; Mirabella, Nadia Estefania; Panelo, Juan Sebastián; Pontaroli, Ana
Año de publicación
2021
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Spike fertility index (SF) is a trait easily measured at maturity andstrongly associated with the number of grains per unit area. In order to identifygenomic regions involved in SF control, a biparental (Baguette 10 × Klein Chajá)population of 80 recombinant inbred lines (RIL) was used. Seven field trailswere conducted to determine the SF BLUP value per RIL. RILs were genotypedusing a commercial chip (Axiom® 35K SNP Wheat Breeder?s Array, Affimetrix).A linkage map was constructed with 857 SNP markers, and SF QTL mappingwas performed. The narrow-sense heritability of SF was 0.89. Three genomicregions (QTL) associated with SF were found on chromosomes 2D, 4A, and 7A.The proportion of genetic variation explained by these three QTL was 32%, withno significant epistatic interaction between QTL.
Fil: Alonso, María Pía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Agencia de Extensión Rural Balcarce; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
Fil: Vanzetti, Leonardo Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación Para la Producción Agropecuaria y El Desarrollo Sostenible. - Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estacion Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación Para la Producción Agropecuaria y El Desarrollo Sostenible.; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina
Fil: Crescente, Juan Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina
Fil: Mirabella, Nadia Estefania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina
Fil: Panelo, Juan Sebastián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
Fil: Pontaroli, Ana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
Materia
SPIKE FERTILITY INDEX
QTL MAPPING
ADDITIVE EFFECTS
BLUP
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/164751

id CONICETDig_4520ec290e0b8731e5c33dafbf19db76
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/164751
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling QTL mapping of spike fertility index in bread wheatAlonso, María PíaVanzetti, Leonardo SebastiánCrescente, Juan ManuelMirabella, Nadia EstefaniaPanelo, Juan SebastiánPontaroli, AnaSPIKE FERTILITY INDEXQTL MAPPINGADDITIVE EFFECTSBLUPhttps://purl.org/becyt/ford/4.1https://purl.org/becyt/ford/4Spike fertility index (SF) is a trait easily measured at maturity andstrongly associated with the number of grains per unit area. In order to identifygenomic regions involved in SF control, a biparental (Baguette 10 × Klein Chajá)population of 80 recombinant inbred lines (RIL) was used. Seven field trailswere conducted to determine the SF BLUP value per RIL. RILs were genotypedusing a commercial chip (Axiom® 35K SNP Wheat Breeder?s Array, Affimetrix).A linkage map was constructed with 857 SNP markers, and SF QTL mappingwas performed. The narrow-sense heritability of SF was 0.89. Three genomicregions (QTL) associated with SF were found on chromosomes 2D, 4A, and 7A.The proportion of genetic variation explained by these three QTL was 32%, withno significant epistatic interaction between QTL.Fil: Alonso, María Pía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Agencia de Extensión Rural Balcarce; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Vanzetti, Leonardo Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación Para la Producción Agropecuaria y El Desarrollo Sostenible. - Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estacion Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación Para la Producción Agropecuaria y El Desarrollo Sostenible.; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Crescente, Juan Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Mirabella, Nadia Estefania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Panelo, Juan Sebastián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Pontaroli, Ana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaBrazilian Soc Plant Breeding2021-01info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/164751Alonso, María Pía; Vanzetti, Leonardo Sebastián; Crescente, Juan Manuel; Mirabella, Nadia Estefania; Panelo, Juan Sebastián; et al.; QTL mapping of spike fertility index in bread wheat; Brazilian Soc Plant Breeding; Crop Breeding And Applied Biotechnology; 21; 1; 1-2021; 1-111518-78531984-7033CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1984-70332021000100202&tlng=eninfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1590/1984-70332021v21n1a3info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-29T10:44:04Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/164751instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-29 10:44:05.187CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv QTL mapping of spike fertility index in bread wheat
title QTL mapping of spike fertility index in bread wheat
spellingShingle QTL mapping of spike fertility index in bread wheat
Alonso, María Pía
SPIKE FERTILITY INDEX
QTL MAPPING
ADDITIVE EFFECTS
BLUP
title_short QTL mapping of spike fertility index in bread wheat
title_full QTL mapping of spike fertility index in bread wheat
title_fullStr QTL mapping of spike fertility index in bread wheat
title_full_unstemmed QTL mapping of spike fertility index in bread wheat
title_sort QTL mapping of spike fertility index in bread wheat
dc.creator.none.fl_str_mv Alonso, María Pía
Vanzetti, Leonardo Sebastián
Crescente, Juan Manuel
Mirabella, Nadia Estefania
Panelo, Juan Sebastián
Pontaroli, Ana
author Alonso, María Pía
author_facet Alonso, María Pía
Vanzetti, Leonardo Sebastián
Crescente, Juan Manuel
Mirabella, Nadia Estefania
Panelo, Juan Sebastián
Pontaroli, Ana
author_role author
author2 Vanzetti, Leonardo Sebastián
Crescente, Juan Manuel
Mirabella, Nadia Estefania
Panelo, Juan Sebastián
Pontaroli, Ana
author2_role author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv SPIKE FERTILITY INDEX
QTL MAPPING
ADDITIVE EFFECTS
BLUP
topic SPIKE FERTILITY INDEX
QTL MAPPING
ADDITIVE EFFECTS
BLUP
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/4.1
https://purl.org/becyt/ford/4
dc.description.none.fl_txt_mv Spike fertility index (SF) is a trait easily measured at maturity andstrongly associated with the number of grains per unit area. In order to identifygenomic regions involved in SF control, a biparental (Baguette 10 × Klein Chajá)population of 80 recombinant inbred lines (RIL) was used. Seven field trailswere conducted to determine the SF BLUP value per RIL. RILs were genotypedusing a commercial chip (Axiom® 35K SNP Wheat Breeder?s Array, Affimetrix).A linkage map was constructed with 857 SNP markers, and SF QTL mappingwas performed. The narrow-sense heritability of SF was 0.89. Three genomicregions (QTL) associated with SF were found on chromosomes 2D, 4A, and 7A.The proportion of genetic variation explained by these three QTL was 32%, withno significant epistatic interaction between QTL.
Fil: Alonso, María Pía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Agencia de Extensión Rural Balcarce; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
Fil: Vanzetti, Leonardo Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación Para la Producción Agropecuaria y El Desarrollo Sostenible. - Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estacion Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación Para la Producción Agropecuaria y El Desarrollo Sostenible.; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina
Fil: Crescente, Juan Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina
Fil: Mirabella, Nadia Estefania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina
Fil: Panelo, Juan Sebastián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
Fil: Pontaroli, Ana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
description Spike fertility index (SF) is a trait easily measured at maturity andstrongly associated with the number of grains per unit area. In order to identifygenomic regions involved in SF control, a biparental (Baguette 10 × Klein Chajá)population of 80 recombinant inbred lines (RIL) was used. Seven field trailswere conducted to determine the SF BLUP value per RIL. RILs were genotypedusing a commercial chip (Axiom® 35K SNP Wheat Breeder?s Array, Affimetrix).A linkage map was constructed with 857 SNP markers, and SF QTL mappingwas performed. The narrow-sense heritability of SF was 0.89. Three genomicregions (QTL) associated with SF were found on chromosomes 2D, 4A, and 7A.The proportion of genetic variation explained by these three QTL was 32%, withno significant epistatic interaction between QTL.
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021-01
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/164751
Alonso, María Pía; Vanzetti, Leonardo Sebastián; Crescente, Juan Manuel; Mirabella, Nadia Estefania; Panelo, Juan Sebastián; et al.; QTL mapping of spike fertility index in bread wheat; Brazilian Soc Plant Breeding; Crop Breeding And Applied Biotechnology; 21; 1; 1-2021; 1-11
1518-7853
1984-7033
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/164751
identifier_str_mv Alonso, María Pía; Vanzetti, Leonardo Sebastián; Crescente, Juan Manuel; Mirabella, Nadia Estefania; Panelo, Juan Sebastián; et al.; QTL mapping of spike fertility index in bread wheat; Brazilian Soc Plant Breeding; Crop Breeding And Applied Biotechnology; 21; 1; 1-2021; 1-11
1518-7853
1984-7033
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1984-70332021000100202&tlng=en
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1590/1984-70332021v21n1a3
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Brazilian Soc Plant Breeding
publisher.none.fl_str_mv Brazilian Soc Plant Breeding
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1844614477355417600
score 13.070432