Pandemia de COVID-19: Experiencia del Laboratorio de Medicina Genómica en la detección de genes del virus SARS-CoV-2 en muestras respiratorias

Autores
Ferrini, Maria Florencia; Acevedo, Guillermo Armando; Gimenez, Yenhy Anabel; Cassano, Ariel; Zimmermann, Maria Carla
Año de publicación
2021
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
La reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa en tiempo real (Real Time RT-PCR) es el ensayo más sensible y específico para la detección del SARS-CoV-2, los genes ORF1ab, RdRp, E, N y S son los objetivos más utilizados. La sensibilidad y capacidad de detección del SARS-CoV-2 varía dependiendo del gen amplificado. El objetivo de este estudio es comparar la capacidad de detección de 3 de los genes diana más utilizados en el diagnóstico de COVID-19. Para ello, se estudiaron 1043 muestras de hisopados nasofaríngeos, de las cuales se extrajo el material genético, por medio de columnas comerciales. A partir del ARN extraído se realizó una RT-qPCR para el gen E, para la detección del SARS-CoV-2 y RNAsa P como control interno. Del total de muestras positivas se seleccionaron de manera aleatoria 20 muestras para realizar una RT-qPCR multiplex, para gen N y Orf 1ab para su estudio comparativo. Del total de muestras testeadas, 54 muestras (5.7%) fueron positivas para el gen E. De la subpoblación analizada, el 65% fueron positivas simultáneamente para los 3 genes evaluados, el 75% para los genes E y N, el 65 % para los genes E y Orf 1ab y en un 25% únicamente se detectó el gen E. Entre las muestras con amplificación de los 3 genes diana, encontramos que los valores de CT para el gen E eran significativamente más bajos que los valores de CT para los genes Orf 1ab y N. Con este trabajo se pudo evaluar la capacidad de detección de 3 genes dianas en el diagnóstico de COVID-19 por RTqPCR. En particular, nuestro estudio se realizó utilizando solo un pequeño número de muestras clínicas y, por lo tanto, para un mejor análisis estadístico, sería necesario aumentar el número de las mismas.
Fil: Ferrini, Maria Florencia. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Medicina. Cátedra de Farmacología; Argentina
Fil: Acevedo, Guillermo Armando. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Medicina. Cátedra de Farmacología; Argentina
Fil: Gimenez, Yenhy Anabel. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Medicina. Cátedra de Farmacología; Argentina
Fil: Cassano, Ariel. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Medicina. Cátedra de Farmacología; Argentina
Fil: Zimmermann, Maria Carla. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Química Básica y Aplicada del Nordeste Argentino. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas Naturales y Agrimensura. Instituto de Química Básica y Aplicada del Nordeste Argentino; Argentina
XI Jornadas de Comunicaciones Científicas en Ciencias de la Salud
Corrientes
Argentina
Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Medicina
Materia
PANDEMIA
SARS-COV-2
CORONAVIRUS
SINDROME AGUDO RESPIRATORIO
COVID-19
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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Fil: Zimmermann, Maria Carla. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Química Básica y Aplicada del Nordeste Argentino. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas Naturales y Agrimensura. Instituto de Química Básica y Aplicada del Nordeste Argentino; Argentina
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