Characteristics of endemic human coronavirus infections during times of COVID-19 pandemic

• Autores: Crocci, Eric E.; Schreiner, Delfina; Garcia, Emilia Aurora; Nannini, Esteban; Cobos, Manuela; Doubik, Paula; Balbuena, Juan P.; Romandetta, Agustin; Cooke, Bettina; Alzogaray, María Fernanda; Baumeister, Elsa; Mykietiuk, Analía
• Año de publicación: 2024
• Idioma: inglés
• Tipo de recurso: artículo
• Materia: BETACORONAVIRUS; ALFACORONAVIRUS; HUMAN CORONAVIRUSES; RESPIRATORY TRACT INFECTIONS
• Institución: Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas

Introduction: After the implementation of mitigation strategies during the COVID-19 pandemic, the incidence of respiratory viruses, including human coronaviruses (HCoV), experienced a significant decrease. The aim of this study is to characterize the epidemiology and clinical aspects of HCoV infections in ambulatory adults during COVID-19 pandemic times. Methods: descriptive, prospective, longitudinal study performed in a private hospital in La Plata, Buenos Aires, Argentina between November 2020 and October 2022; 458 outpatient adults with upper respiratory tract infections (URTI) were studied undergoing clinical and microbiological follow-up. Results: 44 (9.6%) subjects were positive by multiplex PCR for HCoV. 14 of them for 229E (31.8%), 13 for OC43 (29.5%), 11 for HKU-1 (25.1%) and 6 for NL63 (13.6%). A repeated PCR was positive for the same HCoV in 19 (57%) of 33 patients on day 3-5. No hospitalizations or deaths were reported. Discussion: Endemic HCoV caused a significant proportion of URTI among outpatient adults during COVID19-related restrictions times. An alternating pattern of circulation between alfa-HCoV and beta-HCoV was observed.
Introducción: Tras la implementación de estrategias de mitigación durante la pandemia de COVID-19, la incidencia de virus respiratorios, incluyendo los coronavirus humanos (HCoV), disminuyó significativamente. El objetivo de este estudio es caracterizar la epidemiología y los aspectos clínicos de las infecciones por HCoV en adultos ambulatorios durante la pandemia de COVID-19. Métodos: estudio descriptivo, prospectivo, longitudinal, realizado en un hospital privado de La Plata, Buenos Aires, Argentina, entre noviembre de 2020 y octubre de 2022. Se estudiaron 458 pacientes adultos ambulatorios con infecciones del tracto respiratorio superior (ITRS) bajo seguimiento clínico y microbiológico. Resultados: 44 (9.6%) sujetos fueron positivos por PCR multiplex para HCoV. Se detectaron 14 229E (31.8%), 13 OC43 (29.5%), 11 HKU-1 (25.1%) y 6 NL63 (13.6%). Una segunda PCR fue positiva para el mismo HCoV en 19 (57 %) de 33 pacientes en los días 3-5. No se reportaron hospitalizaciones ni muertes. Discusión: los HCoV endémicos causaron una proporción significativa de ITRS entre pacientes adultos ambulatorios durante los tiempos de restricciones relacionados con COVID-19. Se observó un patrón alternante de circulación entre alfa-HCoV y beta-HCoV.
Fil: Crocci, Eric E.. Instituto Medico Platense.; Argentina
Fil: Schreiner, Delfina. Instituto Medico Platense.; Argentina
Fil: Garcia, Emilia Aurora. Instituto Medico Platense.; Argentina
Fil: Nannini, Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Inmunología Clinica y Experimental de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Inmunología Clinica y Experimental de Rosario; Argentina
Fil: Cobos, Manuela. Instituto Medico Platense.; Argentina
Fil: Doubik, Paula. Instituto Medico Platense.; Argentina
Fil: Balbuena, Juan P.. Instituto Medico Platense.; Argentina
Fil: Romandetta, Agustin. Instituto Medico Platense.; Argentina
Fil: Cooke, Bettina. Instituto Medico Platense.; Argentina
Fil: Alzogaray, María Fernanda. Instituto Medico Platense.; Argentina
Fil: Baumeister, Elsa. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Adm.nacional de Laboratorio E Instituto de Salud "dr.c.g.malbran". Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virologia; Argentina
Fil: Mykietiuk, Analía. Instituto Medico Platense.; Argentina