Reconstructing Neutral-Lipids Metabolic Pathways of a Metagenomic Dataset from Ushuaia Bay Sediments

Autores
Pascutti, Federico; Sandoval, Natalia Elisa; Galvan, Virginia; Lanfranconi, Mariana Patricia; Arabolaza, Ana Lorena; Alvarez, Hector Manuel; Gramajo, Hugo Cesar; Dionisi, Hebe Monica
Año de publicación
2020
Idioma
inglés
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Bacterial production of neutral lipids such as triacylglycerides, wax-esters and polyhydroxyalcanoates (TAG, WE and PHA-B, respectively) has been reported in Gammaproteobacteria and Actinobacteria. Within them, there is a short list of microorganisms with an in-depth study of the metabolic route involved in the synthesis of these compounds. To increase our knowledge of the potential of sediment bacteria in relation to this process, we analyzed homolog sequences of the key enzyme involved in TAG biosynthesis, the wax synthase/diacylglycerol acyltransferase (WS/DGAT), from a metagenomic dataset of a chronically-polluted Subantartic coastal environment, and their genomic context. Almost half of putative WS/DGAT sequences were related to those identified in genomes from members of the Actinobacteria phylum, mainly from the Acidimicrobiia, Actinobacteria and Nitriliruptoria classes, while 34% of the sequences shared higher identity values with WS/DGAT homologs from Proteobacteria (Gammaproteobacteria, followed by Alpha-, Beta- and Deltaproteobacteria).
Fil: Pascutti, Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Sandoval, Natalia Elisa. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Instituto de Biociencias de la Patagonia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto de Biociencias de la Patagonia; Argentina
Fil: Galvan, Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Lanfranconi, Mariana Patricia. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Instituto de Biociencias de la Patagonia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto de Biociencias de la Patagonia; Argentina
Fil: Arabolaza, Ana Lorena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Alvarez, Hector Manuel. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Instituto de Biociencias de la Patagonia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto de Biociencias de la Patagonia; Argentina
Fil: Gramajo, Hugo Cesar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Fil: Dionisi, Hebe Monica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina
LVI SAIB Meeting; XV SAMIGE Meeting
Ciudad Autónoma de Buenos Aires
Argentina
Sociedad Argentina de Investigación Bioquímica
Sociedad Argentina de Microbiología General
Materia
METAGENOMICS
ENVIRONMENTAL POTENTIAL
NEUTRAL LIPIDS
MARINE SEDIMENTS
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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To increase our knowledge of the potential of sediment bacteria in relation to this process, we analyzed homolog sequences of the key enzyme involved in TAG biosynthesis, the wax synthase/diacylglycerol acyltransferase (WS/DGAT), from a metagenomic dataset of a chronically-polluted Subantartic coastal environment, and their genomic context. Almost half of putative WS/DGAT sequences were related to those identified in genomes from members of the Actinobacteria phylum, mainly from the Acidimicrobiia, Actinobacteria and Nitriliruptoria classes, while 34% of the sequences shared higher identity values with WS/DGAT homologs from Proteobacteria (Gammaproteobacteria, followed by Alpha-, Beta- and Deltaproteobacteria).Fil: Pascutti, Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. 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Fil: Pascutti, Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
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