Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz

Autores
Rossi, Ezequiel Alejandro; Ruiz, Marcos; Bonamico, Natalia Cecilia; Balzarini, Monica Graciela
Año de publicación
2020
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Mal de Río Cuarto (MRC) is one of the most important viral diseases of maize in Argentina.The disease severity index (DSI) allows to combine the incidence and severity of a disease ina single metric. The genotypic reaction to MRC has been extensively studied in biparentalpopulations. However, this complex trait has not been analyzed by genome-wide associationstudies (GWAS). The aim of this work is to identify new resistance alleles associated withDSI of MRC in an exotic germplasm from the International Maize and Wheat ImprovementCenter (CIMMYT). A population of maize lines from CIMMYT was phenotypicallyevaluated in environments in the area where the disease is endemic. The predictors ofgenetic effects (BLUP, best linear unbiased predictor) and 78,376 SNP markers (SingleNucleotide Polymorphism) were used to perform the GWAS in 186 maize lines. The valuesof variance components and mean-basis heritability suggest a wide genotypic variabilityin the population. The GWAS allowed to identify 11 putative QTL of resistance to MRC. Theincorporation of exotic germplasm into local maize breeding programs could contributefavorably to the creation of hybrids with a higher level of resistance to MRC. The predictiveability of associated markers with MRC resistance indicates that marker-assisted selectionis an advisable tool for selecting MRC resistant genotypes.
Fil: Rossi, Ezequiel Alejandro. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; Argentina
Fil: Ruiz, Marcos. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; Argentina
Fil: Bonamico, Natalia Cecilia. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; Argentina
Fil: Balzarini, Monica Graciela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; Argentina
Materia
QTL
SNP
ISE
Mapeo por asociación
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/141961
Acceder
id CONICETDig_1ca083c7c8ea076d1fda521787e046f2
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/141961
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maízAlleles associated to disease severity index of mal de Río Cuarto disease in maize exotic germplasmRossi, Ezequiel AlejandroRuiz, MarcosBonamico, Natalia CeciliaBalzarini, Monica GracielaQTLSNPISEMapeo por asociaciónhttps://purl.org/becyt/ford/4.4https://purl.org/becyt/ford/4Mal de Río Cuarto (MRC) is one of the most important viral diseases of maize in Argentina.The disease severity index (DSI) allows to combine the incidence and severity of a disease ina single metric. The genotypic reaction to MRC has been extensively studied in biparentalpopulations. However, this complex trait has not been analyzed by genome-wide associationstudies (GWAS). The aim of this work is to identify new resistance alleles associated withDSI of MRC in an exotic germplasm from the International Maize and Wheat ImprovementCenter (CIMMYT). A population of maize lines from CIMMYT was phenotypicallyevaluated in environments in the area where the disease is endemic. The predictors ofgenetic effects (BLUP, best linear unbiased predictor) and 78,376 SNP markers (SingleNucleotide Polymorphism) were used to perform the GWAS in 186 maize lines. The valuesof variance components and mean-basis heritability suggest a wide genotypic variabilityin the population. The GWAS allowed to identify 11 putative QTL of resistance to MRC. Theincorporation of exotic germplasm into local maize breeding programs could contributefavorably to the creation of hybrids with a higher level of resistance to MRC. The predictiveability of associated markers with MRC resistance indicates that marker-assisted selectionis an advisable tool for selecting MRC resistant genotypes.Fil: Rossi, Ezequiel Alejandro. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; ArgentinaFil: Ruiz, Marcos. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; ArgentinaFil: Bonamico, Natalia Cecilia. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; ArgentinaFil: Balzarini, Monica Graciela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; ArgentinaSociedad Argentina de Genética2020-12info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/141961Rossi, Ezequiel Alejandro; Ruiz, Marcos; Bonamico, Natalia Cecilia; Balzarini, Monica Graciela; Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz; Sociedad Argentina de Genética; Journal of Basic and Applied Genetics; 31; 2; 12-2020; 45-531666-03901852-6233CONICET DigitalCONICETspainfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.35407/bag.2020.31.02.05info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://sag.org.ar/jbag/project/vol-xxxi-issue-2/info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-29T10:20:32Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/141961instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-29 10:20:33.204CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz
Alleles associated to disease severity index of mal de Río Cuarto disease in maize exotic germplasm
title Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz
spellingShingle Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz
Rossi, Ezequiel Alejandro
QTL
SNP
ISE
Mapeo por asociación
title_short Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz
title_full Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz
title_fullStr Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz
title_full_unstemmed Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz
title_sort Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz
dc.creator.none.fl_str_mv Rossi, Ezequiel Alejandro
Ruiz, Marcos
Bonamico, Natalia Cecilia
Balzarini, Monica Graciela
author Rossi, Ezequiel Alejandro
author_facet Rossi, Ezequiel Alejandro
Ruiz, Marcos
Bonamico, Natalia Cecilia
Balzarini, Monica Graciela
author_role author
author2 Ruiz, Marcos
Bonamico, Natalia Cecilia
Balzarini, Monica Graciela
author2_role author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv QTL
SNP
ISE
Mapeo por asociación
topic QTL
SNP
ISE
Mapeo por asociación
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/4.4
https://purl.org/becyt/ford/4
dc.description.none.fl_txt_mv Mal de Río Cuarto (MRC) is one of the most important viral diseases of maize in Argentina.The disease severity index (DSI) allows to combine the incidence and severity of a disease ina single metric. The genotypic reaction to MRC has been extensively studied in biparentalpopulations. However, this complex trait has not been analyzed by genome-wide associationstudies (GWAS). The aim of this work is to identify new resistance alleles associated withDSI of MRC in an exotic germplasm from the International Maize and Wheat ImprovementCenter (CIMMYT). A population of maize lines from CIMMYT was phenotypicallyevaluated in environments in the area where the disease is endemic. The predictors ofgenetic effects (BLUP, best linear unbiased predictor) and 78,376 SNP markers (SingleNucleotide Polymorphism) were used to perform the GWAS in 186 maize lines. The valuesof variance components and mean-basis heritability suggest a wide genotypic variabilityin the population. The GWAS allowed to identify 11 putative QTL of resistance to MRC. Theincorporation of exotic germplasm into local maize breeding programs could contributefavorably to the creation of hybrids with a higher level of resistance to MRC. The predictiveability of associated markers with MRC resistance indicates that marker-assisted selectionis an advisable tool for selecting MRC resistant genotypes.
Fil: Rossi, Ezequiel Alejandro. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; Argentina
Fil: Ruiz, Marcos. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; Argentina
Fil: Bonamico, Natalia Cecilia. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; Argentina
Fil: Balzarini, Monica Graciela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; Argentina
description Mal de Río Cuarto (MRC) is one of the most important viral diseases of maize in Argentina.The disease severity index (DSI) allows to combine the incidence and severity of a disease ina single metric. The genotypic reaction to MRC has been extensively studied in biparentalpopulations. However, this complex trait has not been analyzed by genome-wide associationstudies (GWAS). The aim of this work is to identify new resistance alleles associated withDSI of MRC in an exotic germplasm from the International Maize and Wheat ImprovementCenter (CIMMYT). A population of maize lines from CIMMYT was phenotypicallyevaluated in environments in the area where the disease is endemic. The predictors ofgenetic effects (BLUP, best linear unbiased predictor) and 78,376 SNP markers (SingleNucleotide Polymorphism) were used to perform the GWAS in 186 maize lines. The valuesof variance components and mean-basis heritability suggest a wide genotypic variabilityin the population. The GWAS allowed to identify 11 putative QTL of resistance to MRC. Theincorporation of exotic germplasm into local maize breeding programs could contributefavorably to the creation of hybrids with a higher level of resistance to MRC. The predictiveability of associated markers with MRC resistance indicates that marker-assisted selectionis an advisable tool for selecting MRC resistant genotypes.
publishDate 2020
dc.date.none.fl_str_mv 2020-12
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/141961
Rossi, Ezequiel Alejandro; Ruiz, Marcos; Bonamico, Natalia Cecilia; Balzarini, Monica Graciela; Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz; Sociedad Argentina de Genética; Journal of Basic and Applied Genetics; 31; 2; 12-2020; 45-53
1666-0390
1852-6233
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/141961
identifier_str_mv Rossi, Ezequiel Alejandro; Ruiz, Marcos; Bonamico, Natalia Cecilia; Balzarini, Monica Graciela; Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz; Sociedad Argentina de Genética; Journal of Basic and Applied Genetics; 31; 2; 12-2020; 45-53
1666-0390
1852-6233
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.35407/bag.2020.31.02.05
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://sag.org.ar/jbag/project/vol-xxxi-issue-2/
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Sociedad Argentina de Genética
publisher.none.fl_str_mv Sociedad Argentina de Genética
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1844614186495115264
score 13.070432

Publicaciones similares