Beyond genomic selection: The animal model strikes back (one generation)!

Autores
Cantet, Rodolfo Juan Carlos; García Baccino, Carolina Andrea; Rogberg Muñoz, Andres; Forneris, Natalia Soledad; Munilla Leguizamon, Sebastian
Año de publicación
2017
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Genome inheritance is by segments of DNA rather than by independent loci. We introduce the ancestral regression (AR) as a recursive system of simultaneous equations, with grandparental path coefficients as novel parameters. The information given by the pedigree in the AR is complementary with that provided by a dense set of genomic markers, such that the resulting linear function of grandparental BV is uncorrelated to the average of parental BV in the absence of inbreeding. AR is then connected to segmental inheritance by a causal multivariate Gaussian density for BV. The resulting covariance structure (Σ) is Markovian, meaning that conditional on the BV of parents and grandparents, the BV of the animal is independent of everything else. Thus, an algorithm is presented to invert the resulting covariance structure, with a computing effort that is linear in the number of animals as in the case of the inverse additive relationship matrix.
Fil: Cantet, Rodolfo Juan Carlos. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Animal. Cátedra de Mejoramiento Genético Animal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Unidad Ejecutora de Investigaciones en Producción Animal. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Unidad Ejecutora de Investigaciones en Producción Animal; Argentina
Fil: García Baccino, Carolina Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Unidad Ejecutora de Investigaciones en Producción Animal. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Unidad Ejecutora de Investigaciones en Producción Animal; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Animal. Cátedra de Mejoramiento Genético Animal; Argentina
Fil: Rogberg Muñoz, Andres. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Animal. Cátedra de Mejoramiento Genético Animal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - CONICET - La Plata. Instituto de Genética Veterinaria Ing. Fernando Noel Dulout; Argentina
Fil: Forneris, Natalia Soledad. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Animal. Cátedra de Mejoramiento Genético Animal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Munilla Leguizamon, Sebastian. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Animal. Cátedra de Mejoramiento Genético Animal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Materia
Breeding Value
Causal Inference
Gaussian Markov Density
Genomic Data
Segmental Inheritance
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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