Global DNA Methylation levels analysis in a serie of Hematological, Breast and Colorectal cancer samples from Argentina
- Autores
- Cerliani, María Belén; Mayordomo, Andrea Constanza; Sanchez Dova, Anaclara; Piñero, Tamara Alejandra; Cajal, Andrea; Jauk Vitali, Federico; Garcia Rivello, Hernan Jorge; Vaccaro, Carlos Alberto; Richard, Silvina Mariel; Bravi, Claudio Marcelo; Pavicic, Walter Hernan
- Año de publicación
- 2019
- Idioma
- inglés
- Tipo de recurso
- documento de conferencia
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- Unlike their normal counterparts, tumor cells exhibited highly variable CpG methylation levels in a large proportion of the genome, which can lead to malignant cell transformation through multiple pathways. This prompted us to assess the extent of LINE1 methylation, a surrogate marker of global DNA methylation, of samples derived from controls and cancer patients from Argentina. Preliminary DNA methylation results from selected samples were replicated in a large serie of 146 controls (blood) and various cancer types: 112 oncohematological cancer (HemCa), 70 colorectal cancer (CRC) and 68 breast cancer (BrCa) samples. Further, we evaluated correlation with biological, clinical and demographic features. Blood samples were available in all cases, and for solid tumors paired tumoral/non-tumoral adjacent tissues (T/N) were available too. LINE1 methylation level was analyzed by MS-MLPA method. HemCa cases showed statistically significant higher LINE1 methylation level (p>0.001) compared to controls (mean 0.93 and 0.84, respectively). This variation could be a consequence of chemotherapy. Methylation status in blood (0.86) and N tissue (0.87) from BrCa cases did not differ from controls, while levels in T tissue (0.88) were significantly higher than controls (p<0.05). No differences between N and T tissues were found. CRC cases showed hypomethylation for LINE1 when comparing T (0.81) to blood (0.87) or N tissues (0.88), reaching statistical significance of p<0.05 and p<0.001, respectively. This is in line with reported results. We found a negative correlation between individual age and methylation level in controls (-0.17, p=0.04), and BrCa T tissue (-0.33, p=0.03). Finally, no relevant associations between global methylation and mitochondrial genome variation (copy number and ancestry) were found for controls and HemCa sample sets. LINE1 methylation analysis in samples from lung, ovarian, pancreatic and skin cancers are ongoing.
Fil: Cerliani, María Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
Fil: Mayordomo, Andrea Constanza. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
Fil: Sanchez Dova, Anaclara. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
Fil: Piñero, Tamara Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Houssay. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Hospital Italiano. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Instituto Universitario Hospital Italiano de Buenos Aires. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica.; Argentina
Fil: Cajal, Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Houssay. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Hospital Italiano. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Instituto Universitario Hospital Italiano de Buenos Aires. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica.; Argentina
Fil: Jauk Vitali, Federico. Hospital Italiano; Argentina
Fil: Garcia Rivello, Hernan Jorge. Hospital Italiano; Argentina
Fil: Vaccaro, Carlos Alberto. Hospital Italiano; Argentina
Fil: Richard, Silvina Mariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
Fil: Bravi, Claudio Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
Fil: Pavicic, Walter Hernan. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Houssay. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Hospital Italiano. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Instituto Universitario Hospital Italiano de Buenos Aires. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica.; Argentina
LXIV Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Clínica; LI Reunión Anual de la Asociación Argentina de Farmacología Experimenta; XXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biología; XXXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Protozoología; IX Reunión Anual de la Asociación Argentina de Nanomedicinas y VI Reunión Científica Regional de la Asociación Argentina de Ciencia y Tecnología de Animales de Laboratorio
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Preliminary DNA methylation results from selected samples were replicated in a large serie of 146 controls (blood) and various cancer types: 112 oncohematological cancer (HemCa), 70 colorectal cancer (CRC) and 68 breast cancer (BrCa) samples. Further, we evaluated correlation with biological, clinical and demographic features. Blood samples were available in all cases, and for solid tumors paired tumoral/non-tumoral adjacent tissues (T/N) were available too. LINE1 methylation level was analyzed by MS-MLPA method. HemCa cases showed statistically significant higher LINE1 methylation level (p>0.001) compared to controls (mean 0.93 and 0.84, respectively). This variation could be a consequence of chemotherapy. Methylation status in blood (0.86) and N tissue (0.87) from BrCa cases did not differ from controls, while levels in T tissue (0.88) were significantly higher than controls (p<0.05). No differences between N and T tissues were found. 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Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; ArgentinaFil: Mayordomo, Andrea Constanza. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; ArgentinaFil: Sanchez Dova, Anaclara. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; ArgentinaFil: Piñero, Tamara Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Houssay. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Hospital Italiano. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Instituto Universitario Hospital Italiano de Buenos Aires. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica.; ArgentinaFil: Cajal, Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Houssay. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Hospital Italiano. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Instituto Universitario Hospital Italiano de Buenos Aires. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica.; ArgentinaFil: Jauk Vitali, Federico. Hospital Italiano; ArgentinaFil: Garcia Rivello, Hernan Jorge. Hospital Italiano; ArgentinaFil: Vaccaro, Carlos Alberto. Hospital Italiano; ArgentinaFil: Richard, Silvina Mariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; ArgentinaFil: Bravi, Claudio Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; ArgentinaFil: Pavicic, Walter Hernan. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Houssay. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Hospital Italiano. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Instituto Universitario Hospital Italiano de Buenos Aires. 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Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina Fil: Piñero, Tamara Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Houssay. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Hospital Italiano. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Instituto Universitario Hospital Italiano de Buenos Aires. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica.; Argentina Fil: Cajal, Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Houssay. 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Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina Fil: Pavicic, Walter Hernan. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Houssay. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Hospital Italiano. Instituto de Medicina Traslacional E Ingenieria Biomedica. - Instituto Universitario Hospital Italiano de Buenos Aires. 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Unlike their normal counterparts, tumor cells exhibited highly variable CpG methylation levels in a large proportion of the genome, which can lead to malignant cell transformation through multiple pathways. This prompted us to assess the extent of LINE1 methylation, a surrogate marker of global DNA methylation, of samples derived from controls and cancer patients from Argentina. Preliminary DNA methylation results from selected samples were replicated in a large serie of 146 controls (blood) and various cancer types: 112 oncohematological cancer (HemCa), 70 colorectal cancer (CRC) and 68 breast cancer (BrCa) samples. Further, we evaluated correlation with biological, clinical and demographic features. Blood samples were available in all cases, and for solid tumors paired tumoral/non-tumoral adjacent tissues (T/N) were available too. LINE1 methylation level was analyzed by MS-MLPA method. HemCa cases showed statistically significant higher LINE1 methylation level (p>0.001) compared to controls (mean 0.93 and 0.84, respectively). This variation could be a consequence of chemotherapy. Methylation status in blood (0.86) and N tissue (0.87) from BrCa cases did not differ from controls, while levels in T tissue (0.88) were significantly higher than controls (p<0.05). No differences between N and T tissues were found. CRC cases showed hypomethylation for LINE1 when comparing T (0.81) to blood (0.87) or N tissues (0.88), reaching statistical significance of p<0.05 and p<0.001, respectively. This is in line with reported results. We found a negative correlation between individual age and methylation level in controls (-0.17, p=0.04), and BrCa T tissue (-0.33, p=0.03). Finally, no relevant associations between global methylation and mitochondrial genome variation (copy number and ancestry) were found for controls and HemCa sample sets. LINE1 methylation analysis in samples from lung, ovarian, pancreatic and skin cancers are ongoing. |
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