Avances en la selección de un aptámero para deltametrina

Autores
Ponce, María Belén; Ramírez, Silvana Andrea María; Montserrat, Javier Marcelo
Año de publicación
2014
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
La deltametrina, miembro de la familia de los piretroides sintéticos,  es el componente principal en los insecticidas más utilizados no sólo en la agricultura sino también en el control de insectos domésticos, afectando de este modo, las matrices ambientales, en particular, suelo, agua y biota, como también la salud del aplicador y los consumidores. En este contexto resulta relevante disponer de sistemas de detección altamente selectivos que además no requieran una etapa separativa previa.  Los aptámeros son secuencias de ADN sintéticas que adquieren conformaciones únicas y por lo tanto tienen capacidad de reconocimiento molecular que les permiten unirse específicamente a sus blancos (1). Esta capacidad permite utilizarlos como capa de biorreconocimiento en el desarrollo de dispositivos accesibles, sensibles y con alta selectividad, siendo una alternativa prometedora frente a los métodos existentes para la detección y cuantificación de estos analitos (2). Como ventajas frente a los métodos existentes se puede mencionar la estabilidad de los mismos frente a la biodegradación,y que pueden ser modificados químicamente para introducir puntos de anclaje a una superficie o marcadores ópticos o electroquímicos, sin perder funcionalidad.  Los aptámeros se obtienen por técnicas de selección molecular in-vitro, mediante un proceso de selección combinatoria conocido como SELEX (Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment) (3). El mismo consta de tres etapas (Figura 1): 1. Inmovilización de la molécula blanco a un soporte sólido. 2. Selección de secuencias con afinidad por la molécula blanco a partir de una biblioteca combinatoria de ADN. 3. Amplificación de las secuencias con alta afinidad mediante PCR (Polimerase Chain Reaction). Figura 1. Esquema de obtención de los aptámeros mediante SELEX. En este trabajo se presentan los avances metodológicos en el desarrollo de un aptámero para la deltametrina. El primer paso para la obtención de un aptámero contra deltametrina consistió en el aislamiento a partir del formulado comercial y la modificación química de la misma (CPCA-NH2) con el fin de inmovilizarla sobre un soporte sólido (Figura 1a).  A continuación se trabajó en la puesta a punto de dicha inmovilización sobre una resina magnética. Esto exigió el desarrollo de una metodología analítica de base cromatográfica (Figura 1b), tanto para determinar la disminución de la concentración de CPCA-NH2 en solución, como para verificar una vez terminada la inmovilización el contenido de esta molécula sobre la resina. Figura 1. (a) Esquema de modificación química de la deltametrina; (b) Esquema de inmovilización y cuantificación del CPCA-NH2. Paralelamente, se pusieron a punto las condiciones para la etapa de amplificación mediante PCR, así como también la deshibridización selectiva de los productos de PCR. Como alternativa a la detección radioquímica frecuentemente empleada en esta etapa, se exploró el uso de secuencias de ADN con marcadores fluorescentes. Los resultados obtenidos hasta el momento son los siguientes: Ø  Se aisló y modificó químicamente el producto activo del pesticida, y se avanzó en la inmovilización del mismo a un soporte sólido (SELEX, etapa 1), corroborando dicha inmovilización por cromatografía gaseosa. Ø  Se pusieron a punto las condiciones para la amplificación de la secuencia consenso (PCR, SELEX etapa 3).
Fil: Ponce, María Belén. Universidad Nacional de General Sarmiento. Instituto de Ciencias; Argentina
Fil: Ramírez, Silvana Andrea María. Universidad Nacional de General Sarmiento. Instituto de Ciencias; Argentina
Fil: Montserrat, Javier Marcelo. Universidad Nacional de General Sarmiento. Instituto de Ciencias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
30º Congreso Argentino de Química
Ciudad Autónoma de Buenos Aires
Argentina
Asociación Química Argentina
Materia
APTÁMEROS
DELTAMETRINA
SENSORES
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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Esta capacidad permite utilizarlos como capa de biorreconocimiento en el desarrollo de dispositivos accesibles, sensibles y con alta selectividad, siendo una alternativa prometedora frente a los métodos existentes para la detección y cuantificación de estos analitos (2). Como ventajas frente a los métodos existentes se puede mencionar la estabilidad de los mismos frente a la biodegradación,y que pueden ser modificados químicamente para introducir puntos de anclaje a una superficie o marcadores ópticos o electroquímicos, sin perder funcionalidad.  Los aptámeros se obtienen por técnicas de selección molecular in-vitro, mediante un proceso de selección combinatoria conocido como SELEX (Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment) (3). El mismo consta de tres etapas (Figura 1): 1. Inmovilización de la molécula blanco a un soporte sólido. 2. Selección de secuencias con afinidad por la molécula blanco a partir de una biblioteca combinatoria de ADN. 3. 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(a) Esquema de modificación química de la deltametrina; (b) Esquema de inmovilización y cuantificación del CPCA-NH2. Paralelamente, se pusieron a punto las condiciones para la etapa de amplificación mediante PCR, así como también la deshibridización selectiva de los productos de PCR. Como alternativa a la detección radioquímica frecuentemente empleada en esta etapa, se exploró el uso de secuencias de ADN con marcadores fluorescentes. Los resultados obtenidos hasta el momento son los siguientes: Ø  Se aisló y modificó químicamente el producto activo del pesticida, y se avanzó en la inmovilización del mismo a un soporte sólido (SELEX, etapa 1), corroborando dicha inmovilización por cromatografía gaseosa. Ø  Se pusieron a punto las condiciones para la amplificación de la secuencia consenso (PCR, SELEX etapa 3).Fil: Ponce, María Belén. Universidad Nacional de General Sarmiento. Instituto de Ciencias; ArgentinaFil: Ramírez, Silvana Andrea María. Universidad Nacional de General Sarmiento. 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Fil: Ponce, María Belén. Universidad Nacional de General Sarmiento. Instituto de Ciencias; Argentina
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Fil: Montserrat, Javier Marcelo. Universidad Nacional de General Sarmiento. Instituto de Ciencias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
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description La deltametrina, miembro de la familia de los piretroides sintéticos,  es el componente principal en los insecticidas más utilizados no sólo en la agricultura sino también en el control de insectos domésticos, afectando de este modo, las matrices ambientales, en particular, suelo, agua y biota, como también la salud del aplicador y los consumidores. En este contexto resulta relevante disponer de sistemas de detección altamente selectivos que además no requieran una etapa separativa previa.  Los aptámeros son secuencias de ADN sintéticas que adquieren conformaciones únicas y por lo tanto tienen capacidad de reconocimiento molecular que les permiten unirse específicamente a sus blancos (1). Esta capacidad permite utilizarlos como capa de biorreconocimiento en el desarrollo de dispositivos accesibles, sensibles y con alta selectividad, siendo una alternativa prometedora frente a los métodos existentes para la detección y cuantificación de estos analitos (2). Como ventajas frente a los métodos existentes se puede mencionar la estabilidad de los mismos frente a la biodegradación,y que pueden ser modificados químicamente para introducir puntos de anclaje a una superficie o marcadores ópticos o electroquímicos, sin perder funcionalidad.  Los aptámeros se obtienen por técnicas de selección molecular in-vitro, mediante un proceso de selección combinatoria conocido como SELEX (Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment) (3). El mismo consta de tres etapas (Figura 1): 1. Inmovilización de la molécula blanco a un soporte sólido. 2. Selección de secuencias con afinidad por la molécula blanco a partir de una biblioteca combinatoria de ADN. 3. Amplificación de las secuencias con alta afinidad mediante PCR (Polimerase Chain Reaction). Figura 1. Esquema de obtención de los aptámeros mediante SELEX. En este trabajo se presentan los avances metodológicos en el desarrollo de un aptámero para la deltametrina. El primer paso para la obtención de un aptámero contra deltametrina consistió en el aislamiento a partir del formulado comercial y la modificación química de la misma (CPCA-NH2) con el fin de inmovilizarla sobre un soporte sólido (Figura 1a).  A continuación se trabajó en la puesta a punto de dicha inmovilización sobre una resina magnética. Esto exigió el desarrollo de una metodología analítica de base cromatográfica (Figura 1b), tanto para determinar la disminución de la concentración de CPCA-NH2 en solución, como para verificar una vez terminada la inmovilización el contenido de esta molécula sobre la resina. Figura 1. (a) Esquema de modificación química de la deltametrina; (b) Esquema de inmovilización y cuantificación del CPCA-NH2. Paralelamente, se pusieron a punto las condiciones para la etapa de amplificación mediante PCR, así como también la deshibridización selectiva de los productos de PCR. Como alternativa a la detección radioquímica frecuentemente empleada en esta etapa, se exploró el uso de secuencias de ADN con marcadores fluorescentes. Los resultados obtenidos hasta el momento son los siguientes: Ø  Se aisló y modificó químicamente el producto activo del pesticida, y se avanzó en la inmovilización del mismo a un soporte sólido (SELEX, etapa 1), corroborando dicha inmovilización por cromatografía gaseosa. Ø  Se pusieron a punto las condiciones para la amplificación de la secuencia consenso (PCR, SELEX etapa 3).
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