Dinámica molecular de glicina zwitteriónica en solución acuosa

• Autores: Campo, Mario Guillermo; Grigera, José Raúl
• Año de publicación: 2004
• Idioma: español castellano
• Tipo de recurso: artículo
• Fuente: An. (Asoc. Fís. Argent., En línea) 2004;01(16):249-256
• Institución: Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

Se realiza una simulación computacional utilizando dinámica molecular de glicina zwitteriónica en solución a dos concentraciones diferentes: 0,17 M y 1,6 M. Se calculan las funciones de distribución radial de átomos del solvente alrededor de los átomos de la glicina. Se estudia la estructura de hidratación mediante el análisis de los puentes de hidrógeno y las modificaciones en la densidad del solvente en el entorno de esta última molécula. El modelo de glicina analizado posee un comportamiento hidrofílico, y su estructura interna más estable es aquella en la cual los átomos O1, C1, C2 y al menos un hidrógeno del grupo NH₃ se encuentran en un plano. En el entorno de la glicina disminuye la estructuración del solvente en comparación con lo que ocurre en regiones alejadas de esta molécula, dado que aumenta el porcentaje de moléculas de agua que establecen sólo un puente de hidrógeno, y disminuye el porcentaje correspondiente a aquellas que establecen dos o tres entre sí. Además, con aumento de la concentración de glicina se observa una disminución del número de puentes de hidrógeno entre moléculas de agua en el entorno de dicha molécula
Molecular dynamics of a solution of zwitterionic glycine for two different concentrations: 0.17 M and 1.6 M was carried out. The radial distribution functions of solvent atoms around of glycine atoms are calculated. The hydration structure by means of the analysis of the hydrogen bonds, and the modifications in the solvent density in the environment of the glycine, were studied. The results agree with those of the bibliography as for that the glycine possesses a hydrophilic behavior, and that its more stable internal structure is that in the one which the atoms O1, C1, C2 and at least a hydrogen of the NH₃ group are in a plane. In comparison with what happens in the bulk of the solvent, the solvent structuring in the glycine environment diminishes, increasing the proportion of water molecules that establish only one or two hydrogen bonds, and diminishing those that establish two or three hydrogen bonds to each other. On the other hand, it is observed that when the glycine concentration increases, the number of hydrogen bonds between water molecules in the environment of that molecule decreases
Fil: Campo, Mario Guillermo. Universidad Nacional de La Pampa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UNLPam-FCEyN). La Pampa. Argentina
Fil: Grigera, José Raúl. Universidad Nacional de La Pampa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UNLPam-FCEyN). La Pampa. Argentina