Regulación post-transcripcional en Trypanosoma cruzi : regiones intergénicas y elementos repetidos

Autores
Ben-Dov, Claudia Paola
Año de publicación
2002
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis doctoral
Estado
versión publicada
Colaborador/a o director/a de tesis
Levin, Mariano Jorge
Vázquez, Martín Pablo
Descripción
Trypanosoma cruzí es un parásito protozoario causante de Ia enfermedad de Chagas, cuya regulación de la expresión génica se da casi exclusivamente a nivel post-transcripcional. Los objetivos de la presente tesis fueron estudiar las regiones intergénicas y la influencia del elemento repetido SIRE en las mismas. Se determinó la presencia del elemento SIRE en regiones no codificantes del genoma del parásito . Se estableció que SIRE se asocia a una amplia variedad de genes implicados en distintos procesos metabólicos. Másaún, se determinó la relevancia que esta asociación tiene en la regulación de la expresión génica del parásito, dado que SIRE pude disminuir la estabilidad y la traductibilidad del ARNm al estar en regiones 3’ UTR, o bien aumentar la traductibilidad del ARNm al incluirse los últimos nucleótidos de SIRE en regiones 5' UTR. A su vez se estudió en profundidad las secuencias requeridas en el transsplicing y se definió la existencia de elementos reguladores del mencionado proceso y al mismo tiempo de la traductibilidad del ARNm correspondiente. Por último los resultados determinan la falta de consensos estrictos para las señales reconocidas en los primeros pasos del trans-splicing.
Trypanosoma cruzi is a parasitic protozoan that causes Chagas disease. The regulation of gene expression occurs mainly at a post-transcriptional level. The aims of this thesis were to study the role of intergenic regions and the influence of the repetitive element SIRE. The results demonstrate that SIRE is present in non-coding regions of the genome. Moreover, the results reveal that SIRE is associated to a wide variety of genes involved in different metabolic processes. Also, the results determine the relevance of this association to the regulation of gene expression given that SIRE, when present in 3’ UTR regions, down regulates the stability of the mRNA as well as its translation. In addition, the last nucleotides of SIRE can stimulate translation when present in the 5' UTR region. Furthermore, we study which are the most important sequences for the trans-splicing reaction. We defined new elements that are able to up regulate not only trans-splicing but also the translation of the corresponding mRNA. Finally, the results determine that there is no need of consensus sequences to achieve the early steps of the trans-splicing process.
Fil: Ben-Dov, Claudia Paola. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar
Repositorio
Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
Institución
Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
OAI Identificador
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Trypanosoma cruzi is a parasitic protozoan that causes Chagas disease. The regulation of gene expression occurs mainly at a post-transcriptional level. The aims of this thesis were to study the role of intergenic regions and the influence of the repetitive element SIRE. The results demonstrate that SIRE is present in non-coding regions of the genome. Moreover, the results reveal that SIRE is associated to a wide variety of genes involved in different metabolic processes. Also, the results determine the relevance of this association to the regulation of gene expression given that SIRE, when present in 3’ UTR regions, down regulates the stability of the mRNA as well as its translation. In addition, the last nucleotides of SIRE can stimulate translation when present in the 5' UTR region. Furthermore, we study which are the most important sequences for the trans-splicing reaction. We defined new elements that are able to up regulate not only trans-splicing but also the translation of the corresponding mRNA. Finally, the results determine that there is no need of consensus sequences to achieve the early steps of the trans-splicing process.
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description Trypanosoma cruzí es un parásito protozoario causante de Ia enfermedad de Chagas, cuya regulación de la expresión génica se da casi exclusivamente a nivel post-transcripcional. Los objetivos de la presente tesis fueron estudiar las regiones intergénicas y la influencia del elemento repetido SIRE en las mismas. Se determinó la presencia del elemento SIRE en regiones no codificantes del genoma del parásito . Se estableció que SIRE se asocia a una amplia variedad de genes implicados en distintos procesos metabólicos. Másaún, se determinó la relevancia que esta asociación tiene en la regulación de la expresión génica del parásito, dado que SIRE pude disminuir la estabilidad y la traductibilidad del ARNm al estar en regiones 3’ UTR, o bien aumentar la traductibilidad del ARNm al incluirse los últimos nucleótidos de SIRE en regiones 5' UTR. A su vez se estudió en profundidad las secuencias requeridas en el transsplicing y se definió la existencia de elementos reguladores del mencionado proceso y al mismo tiempo de la traductibilidad del ARNm correspondiente. Por último los resultados determinan la falta de consensos estrictos para las señales reconocidas en los primeros pasos del trans-splicing.
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