Búsqueda de secuencias repetidas en un modelo de secuenciamiento aleatorio

Autores
Rocha, Cristian Sebastián
Año de publicación
2002
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis de grado
Estado
versión publicada
Colaborador/a o director/a de tesis
Loiseau, Irene
Descripción
El objetivo de esta tesis es proponer una nueva metodología para identificar secuencias repetidas exactas en un conjunto de fragmentos de una secuencia de ADN, y así permitir el acceso a estos elementos durante su proceso de secuenciamiento aleatorio. Surgido de la limitación de conocer el genoma completo del Trypanosoma cruzi, para luego así obtener todas sus repeticiones para su eventual anotación, este trabajo introduce la teoría de álgebra de repeticiones. Permitiendo así relacionar correctamente una nueva estructura de datos, AS2 , con el problema de encontrar las repeticiones supermaximales de un conjunto de subsecuencias de una secuencia.
These work introduces a new method to identify exact DNA repeats from a set of fragments of a DNA sequence, to allow queries about them while the random sequence strategy is in progress. The limits to know the complete genome of Trypanosoma cruzi, do not permit to researchers to annot ate all repeats in the known way. In order to solve this problem, these thesis introduces the repeats algebra theory to relate a new data structure, AS2, to the supermaximal repeats in a set of subsequences of a sequence search problem.
Fil: Rocha, Cristian Sebastián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar
Repositorio
Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
Institución
Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
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Acceder
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