Proteínas virales intrínsecamente desordenadas : disección estructural de la oncoproteína E7 del virus del papiloma humano y de la fosfoproteína P del virus sincicial respiratorio...

• Autores: Noval, María Gabriela
• Año de publicación: 2016
• Idioma: español castellano
• Tipo de recurso: tesis doctoral
• Colaborador/a o director/a de tesis: de Prat Gay, Gonzalo
• Materia: PROTEINAS INTRINSECAMENTE DESORDENADAS (IDPS); ONCOPROTEINA E7 HPV-16; DOMINIO E7N; VIRUS SINCICIAL RESPIRATORIO HUMANO; FOSFOPROTEINA P; FLEXIBILIDAD CONFORMACIONAL; TRANSICIONES ESTRUCTURALES ORDEN-DESORDEN; INTRINSICALLY DISORDERED PROTEINS (IDPS); HPV-16 E7 ONCOPROTEIN; E7N DOMAIN; RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUS; P PHOSPHOPROTEIN; CONFORMATIONAL ENSEMBLE; ORDER-DISORDER STRUCTURAL TRANSITIONS
• Institución: Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

Las proteínas intrínsecamente desordenadas (IDPs) son proteínas funcionales que carecen deestructura secundaria y terciaria definidas en solución. Este tipo de categoría estructural seencuentra sobrerepresentada en proteínas virales, otorgándole multifuncionalidad y versatilidaden las interacciones que establecen. Debido a flexibilidad asociada a las distintas transicionesconformacionales que presentan, las IDPs son muy difíciles de caracterizar estructuralmente,debiéndose recurrir principalmente a técnicas de estudio en solución. En este trabajo seestudiaron dos modelos de IDPs virales: el dominio amino-terminal de la oncoproteína E7 (E7N) del virus del papiloma humano (HPV-16) y la fosfoproteína P del virus sincicialrespiratorio humano (RSV). En primer lugar, utilizando un abordaje de fragmentación en conjunto con medidas de dicroismocircular y resonancia magnética nuclear, se estudiaron las tendencias conformacionales deldominio E7N. Identificamos tres regiones con estructura secundaria local y transitoria: dos α-hélices dentro de las regiones conservadas CR1 y CR2, y una región que adopta hélice depoliprolinas tipo II (PII) dentro del CR2. Las dos α-hélices se encuentran pobladas en formaparcial, representando solo al 20% de la población de moléculas de E7N. Por otro lado,demostramos que la hélice-II presenta transiciones conformacionales entre PII y α-hélicemoduladas por cambios de pH. Estas regiones de estructura local coinciden con los motivoslineales de interacción descriptos para este dominio, así como con sitios que experimentanmodificaciones post-traduccionales. Estas características sugieren que dichas transicionesestructurales podrían modular la accesibilidad a estos motivos, regulando la interacción con susproteínas blanco. En segundo lugar, utilizando distintas proteínas recombinantes, demostramos por primera vezla naturaleza IDP de la proteína P de RSV. La misma contiene dos módulos intrínsecamentedesordenados, los cuales presentan distinto contenido de desorden. Definimos al dominio Cterminalde P como un dominio con características en solución de tipo pre-molten globule like IDP, y al dominio N-terminal como un dominio con características de tipo random-coil like IDP. Describimos que P presenta un comportamiento térmico anómalo, conteniendo en el dominio C-terminal un elemento marginalmente estable modulable por variaciones de temperaturadentro del rango de temperaturas fisiológico. En conclusión, estos ejemplos resaltan la flexibilidad funcional inherente de las IDPs, la cual lespermite ser moduladas por cambios en el entorno. Esta capacidad permite a su vez explicar laplétora de procesos biológicos en los cuales se encuentran involucradas.
Fil: Noval, María Gabriela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.