Un algoritmo modular para el seguimiento de partículas en videos de microscopía

Autores
Sánchez, Jorge A.; Pury, Pedro A.; Marconi, Verónica I.
Año de publicación
2016
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Fil: Sánchez, Jorge A. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.
Fil: Sánchez, Jorge A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Pury, Pedro A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.
En el presente trabajo se aborda el problema de seguimiento de una población de partículas (como células, microorganismos o entes autopropulsados en general) en videos de microscopía óptica y la extracción de información cuantitativa confiable de manera automatizada. Para ello se propone un esquema modular de procesamiento compuesto por las siguientes etapas: i) detección de partículas; ii) reconstrucción de trayectorias; iii) análisis de trayectorias. El módulo de detección se basa en la extracción de extremos locales en el Laplaciano de la función intensidad, evitando así el empleo de técnicas de binarización y la consecuente pérdida de precisión en localización. Para la reconstrucción de trayectorias se establece un criterio que explota las nociones de proximidad y continuidad temporal. El método propuesto se evalúa y compara experimentalmente empleando secuencias y métricas conocidas en la literatura, obteniéndose resultados alentadores.
https://amcaonline.org.ar/ojs/index.php/mc/article/view/5214
Fil: Sánchez, Jorge A. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.
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Fil: Pury, Pedro A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.
Ciencias de la Información y Bioinformática
Ingeniería eléctrica, electrónica y de información
Fuente
ISSN: 2591-3522
Materia
Tracking en videos de microscopía
Nado de microorganismos
Detección automática
Seguimiento
Movilidad
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
Repositorio
Repositorio Digital Universitario (UNC)
Institución
Universidad Nacional de Córdoba
OAI Identificador
oai:rdu.unc.edu.ar:11086/547804
Acceder
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En el presente trabajo se aborda el problema de seguimiento de una población de partículas (como células, microorganismos o entes autopropulsados en general) en videos de microscopía óptica y la extracción de información cuantitativa confiable de manera automatizada. Para ello se propone un esquema modular de procesamiento compuesto por las siguientes etapas: i) detección de partículas; ii) reconstrucción de trayectorias; iii) análisis de trayectorias. El módulo de detección se basa en la extracción de extremos locales en el Laplaciano de la función intensidad, evitando así el empleo de técnicas de binarización y la consecuente pérdida de precisión en localización. Para la reconstrucción de trayectorias se establece un criterio que explota las nociones de proximidad y continuidad temporal. El método propuesto se evalúa y compara experimentalmente empleando secuencias y métricas conocidas en la literatura, obteniéndose resultados alentadores.
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