Un algoritmo modular para el seguimiento de partículas en videos de microscopía

Autores
Sánchez, Jorge A.; Pury, Pedro A.; Marconi, Verónica I.
Año de publicación
2016
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Fil: Sánchez, Jorge A. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.
Fil: Sánchez, Jorge A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Pury, Pedro A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.
En el presente trabajo se aborda el problema de seguimiento de una población de partículas (como células, microorganismos o entes autopropulsados en general) en videos de microscopía óptica y la extracción de información cuantitativa confiable de manera automatizada. Para ello se propone un esquema modular de procesamiento compuesto por las siguientes etapas: i) detección de partículas; ii) reconstrucción de trayectorias; iii) análisis de trayectorias. El módulo de detección se basa en la extracción de extremos locales en el Laplaciano de la función intensidad, evitando así el empleo de técnicas de binarización y la consecuente pérdida de precisión en localización. Para la reconstrucción de trayectorias se establece un criterio que explota las nociones de proximidad y continuidad temporal. El método propuesto se evalúa y compara experimentalmente empleando secuencias y métricas conocidas en la literatura, obteniéndose resultados alentadores.
https://amcaonline.org.ar/ojs/index.php/mc/article/view/5214
Fil: Sánchez, Jorge A. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.
Fil: Sánchez, Jorge A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Pury, Pedro A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.
Ciencias de la Información y Bioinformática
Ingeniería eléctrica, electrónica y de información
Fuente
ISSN: 2591-3522
Materia
Tracking en videos de microscopía
Nado de microorganismos
Detección automática
Seguimiento
Movilidad
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
Repositorio
Repositorio Digital Universitario (UNC)
Institución
Universidad Nacional de Córdoba
OAI Identificador
oai:rdu.unc.edu.ar:11086/547804
Acceder
id RDUUNC_35c58beb2242329a73f6f9f93f492a77
oai_identifier_str oai:rdu.unc.edu.ar:11086/547804
network_acronym_str RDUUNC
repository_id_str 2572
network_name_str Repositorio Digital Universitario (UNC)
spelling Un algoritmo modular para el seguimiento de partículas en videos de microscopíaSánchez, Jorge A.Pury, Pedro A.Marconi, Verónica I.Tracking en videos de microscopíaNado de microorganismosDetección automáticaSeguimientoMovilidadFil: Sánchez, Jorge A. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.Fil: Sánchez, Jorge A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.Fil: Pury, Pedro A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.Fil: Marconi, Verónica I. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.En el presente trabajo se aborda el problema de seguimiento de una población de partículas (como células, microorganismos o entes autopropulsados en general) en videos de microscopía óptica y la extracción de información cuantitativa confiable de manera automatizada. Para ello se propone un esquema modular de procesamiento compuesto por las siguientes etapas: i) detección de partículas; ii) reconstrucción de trayectorias; iii) análisis de trayectorias. El módulo de detección se basa en la extracción de extremos locales en el Laplaciano de la función intensidad, evitando así el empleo de técnicas de binarización y la consecuente pérdida de precisión en localización. Para la reconstrucción de trayectorias se establece un criterio que explota las nociones de proximidad y continuidad temporal. El método propuesto se evalúa y compara experimentalmente empleando secuencias y métricas conocidas en la literatura, obteniéndose resultados alentadores.https://amcaonline.org.ar/ojs/index.php/mc/article/view/5214Fil: Sánchez, Jorge A. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.Fil: Sánchez, Jorge A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.Fil: Pury, Pedro A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.Fil: Marconi, Verónica I. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.Ciencias de la Información y BioinformáticaIngeniería eléctrica, electrónica y de información2016info:eu-repo/semantics/conferenceObjectinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_5794info:ar-repo/semantics/documentoDeConferenciaapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11086/547804ISSN: 2591-3522reponame:Repositorio Digital Universitario (UNC)instname:Universidad Nacional de Córdobainstacron:UNCspainfo:eu-repo/semantics/openAccess2025-09-29T13:43:36Zoai:rdu.unc.edu.ar:11086/547804Institucionalhttps://rdu.unc.edu.ar/Universidad públicaNo correspondehttp://rdu.unc.edu.ar/oai/snrdoca.unc@gmail.comArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:25722025-09-29 13:43:36.882Repositorio Digital Universitario (UNC) - Universidad Nacional de Córdobafalse
dc.title.none.fl_str_mv Un algoritmo modular para el seguimiento de partículas en videos de microscopía
title Un algoritmo modular para el seguimiento de partículas en videos de microscopía
spellingShingle Un algoritmo modular para el seguimiento de partículas en videos de microscopía
Sánchez, Jorge A.
Tracking en videos de microscopía
Nado de microorganismos
Detección automática
Seguimiento
Movilidad
title_short Un algoritmo modular para el seguimiento de partículas en videos de microscopía
title_full Un algoritmo modular para el seguimiento de partículas en videos de microscopía
title_fullStr Un algoritmo modular para el seguimiento de partículas en videos de microscopía
title_full_unstemmed Un algoritmo modular para el seguimiento de partículas en videos de microscopía
title_sort Un algoritmo modular para el seguimiento de partículas en videos de microscopía
dc.creator.none.fl_str_mv Sánchez, Jorge A.
Pury, Pedro A.
Marconi, Verónica I.
author Sánchez, Jorge A.
author_facet Sánchez, Jorge A.
Pury, Pedro A.
Marconi, Verónica I.
author_role author
author2 Pury, Pedro A.
Marconi, Verónica I.
author2_role author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Tracking en videos de microscopía
Nado de microorganismos
Detección automática
Seguimiento
Movilidad
topic Tracking en videos de microscopía
Nado de microorganismos
Detección automática
Seguimiento
Movilidad
dc.description.none.fl_txt_mv Fil: Sánchez, Jorge A. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.
Fil: Sánchez, Jorge A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Pury, Pedro A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.
En el presente trabajo se aborda el problema de seguimiento de una población de partículas (como células, microorganismos o entes autopropulsados en general) en videos de microscopía óptica y la extracción de información cuantitativa confiable de manera automatizada. Para ello se propone un esquema modular de procesamiento compuesto por las siguientes etapas: i) detección de partículas; ii) reconstrucción de trayectorias; iii) análisis de trayectorias. El módulo de detección se basa en la extracción de extremos locales en el Laplaciano de la función intensidad, evitando así el empleo de técnicas de binarización y la consecuente pérdida de precisión en localización. Para la reconstrucción de trayectorias se establece un criterio que explota las nociones de proximidad y continuidad temporal. El método propuesto se evalúa y compara experimentalmente empleando secuencias y métricas conocidas en la literatura, obteniéndose resultados alentadores.
https://amcaonline.org.ar/ojs/index.php/mc/article/view/5214
Fil: Sánchez, Jorge A. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.
Fil: Sánchez, Jorge A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Pury, Pedro A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.
Fil: Marconi, Verónica I. Universidad Nacional de Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina.
Ciencias de la Información y Bioinformática
Ingeniería eléctrica, electrónica y de información
description Fil: Sánchez, Jorge A. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.
publishDate 2016
dc.date.none.fl_str_mv 2016
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/conferenceObject
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_5794
info:ar-repo/semantics/documentoDeConferencia
format conferenceObject
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11086/547804
url http://hdl.handle.net/11086/547804
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv ISSN: 2591-3522
reponame:Repositorio Digital Universitario (UNC)
instname:Universidad Nacional de Córdoba
instacron:UNC
reponame_str Repositorio Digital Universitario (UNC)
collection Repositorio Digital Universitario (UNC)
instname_str Universidad Nacional de Córdoba
instacron_str UNC
institution UNC
repository.name.fl_str_mv Repositorio Digital Universitario (UNC) - Universidad Nacional de Córdoba
repository.mail.fl_str_mv oca.unc@gmail.com
_version_ 1844618960742383616
score 13.070432

Publicaciones similares