Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations

Autores
Angulo, Diego F; Amarilla, Leonardo D; Anton, Ana M; Sosa, Victoria
Año de publicación
2017
Idioma
inglés
Tipo de recurso
conjunto de datos
Estado
versión publicada
Descripción
Fil: Angulo, Diego F. Universidad Autónoma de Yucatán; México.
Fil: Amarilla, Leonardo D. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Fil: Amarilla, Leonardo D. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Fil: Anton, Ana M. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Fil: Anton, Ana M. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Fil: Sosa, Victoria. Instituto de Ecología. Departamento de Biología Evolutiva; México.
Here we conduct research to understand the evolutionary history of a shrubby species known as Agarito (Berberis trifoliolata), an endemic species to the Chihuahuan Desert. We identify genetic signatures based on plastid DNA and AFLP markers and perform niche modelling and spatial connectivity analyses as well as niche modelling based on records in packrats to elucidate whether orogenic events such as mountain range uplift in the Miocene or the contraction/expansion dynamics of vegetation in response to climate oscillations in the Pliocene/Pleistocene had an effect on evolutionary processes in Agarito. Our results of current niche modelling and palaeomodelling showed that the area currently occupied by Berberis trifoliolata is substantially larger than it was during the Last Interglacial period and the Last Glacial Maximum. Agarito was probably confined to small areas in the Northeastern and gradually expanded its distribution just after the Last Glacial Maximum when the weather in the Chihuahuan Desert and adjacent regions became progressively warmer and drier. The most contracted range was predicted for the Interglacial period. Populations remained in stable areas during the Last Glacial Maximum and expanded at the beginning of the Holocene. Most genetic variation occured in populations from the Sierra Madre Oriental.
Aquí realizamos una investigación para comprender la historia evolutiva de una especie arbustiva conocida como Agarito (Berberis trifoliolata), una especie endémica del desierto de Chihuahua. Identificamos firmas genéticas basadas en marcadores de ADN plastidial y AFLP y realizamos análisis de modelado de nicho y de conectividad espacial, así como de modelado de nicho basado en registros en packrats para dilucidar si los eventos orogénicos como el levantamiento de la cordillera en el Mioceno o la dinámica de contracción/expansión de la vegetación en respuesta a las oscilaciones climáticas en el Plioceno/Pleistoceno tuvieron un efecto en los procesos evolutivos de Agarito. Nuestros resultados de la modelización del nicho actual y de la paleomodelización mostraron que el área ocupada actualmente por Berberis trifoliolata es sustancialmente mayor de lo que era durante el último período interglacial y el último máximo glacial. El agarito estaba probablemente confinado en pequeñas zonas del noreste y amplió gradualmente su distribución justo después del Último Máximo Glacial, cuando el clima en el desierto de Chihuahua y las regiones adyacentes se volvió progresivamente más cálido y seco. El área de distribución más contraída se predijo para el periodo interglaciar. Las poblaciones permanecieron en zonas estables durante el Último Máximo Glacial y se expandieron a principios del Holoceno. La mayor variación genética se produjo en las poblaciones de la Sierra Madre Oriental.
Fil: Angulo, Diego F. Universidad Autónoma de Yucatán; México.
Fil: Amarilla, Leonardo D. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Fil: Amarilla, Leonardo D. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Fil: Anton, Ana M. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Fil: Anton, Ana M. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Fil: Sosa, Victoria. Instituto de Ecología. Departamento de Biología Evolutiva; México.
Materia
Niche modelling
Niche modelling predictions
Last Glacial Maximum
Northeastern
Agarito
Last Interglacial period
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
Repositorio
Repositorio Digital Universitario (UNC)
Institución
Universidad Nacional de Córdoba
OAI Identificador
oai:rdu.unc.edu.ar:11086/21004

id RDUUNC_03c0c9e0d1f420e320c032d646ac0169
oai_identifier_str oai:rdu.unc.edu.ar:11086/21004
network_acronym_str RDUUNC
repository_id_str 2572
network_name_str Repositorio Digital Universitario (UNC)
spelling Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populationsAnálisis espacial de la varianza molecular (SAMOVA) para las poblaciones de Berberis trifoliolataAngulo, Diego FAmarilla, Leonardo DAnton, Ana MSosa, VictoriaNiche modellingNiche modelling predictionsLast Glacial MaximumNortheasternAgaritoLast Interglacial periodhttps://purl.org/becyt/ford/1.5Fil: Angulo, Diego F. Universidad Autónoma de Yucatán; México.Fil: Amarilla, Leonardo D. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.Fil: Amarilla, Leonardo D. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.Fil: Anton, Ana M. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.Fil: Anton, Ana M. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.Fil: Sosa, Victoria. Instituto de Ecología. Departamento de Biología Evolutiva; México.Here we conduct research to understand the evolutionary history of a shrubby species known as Agarito (Berberis trifoliolata), an endemic species to the Chihuahuan Desert. We identify genetic signatures based on plastid DNA and AFLP markers and perform niche modelling and spatial connectivity analyses as well as niche modelling based on records in packrats to elucidate whether orogenic events such as mountain range uplift in the Miocene or the contraction/expansion dynamics of vegetation in response to climate oscillations in the Pliocene/Pleistocene had an effect on evolutionary processes in Agarito. Our results of current niche modelling and palaeomodelling showed that the area currently occupied by Berberis trifoliolata is substantially larger than it was during the Last Interglacial period and the Last Glacial Maximum. Agarito was probably confined to small areas in the Northeastern and gradually expanded its distribution just after the Last Glacial Maximum when the weather in the Chihuahuan Desert and adjacent regions became progressively warmer and drier. The most contracted range was predicted for the Interglacial period. Populations remained in stable areas during the Last Glacial Maximum and expanded at the beginning of the Holocene. Most genetic variation occured in populations from the Sierra Madre Oriental.Aquí realizamos una investigación para comprender la historia evolutiva de una especie arbustiva conocida como Agarito (Berberis trifoliolata), una especie endémica del desierto de Chihuahua. Identificamos firmas genéticas basadas en marcadores de ADN plastidial y AFLP y realizamos análisis de modelado de nicho y de conectividad espacial, así como de modelado de nicho basado en registros en packrats para dilucidar si los eventos orogénicos como el levantamiento de la cordillera en el Mioceno o la dinámica de contracción/expansión de la vegetación en respuesta a las oscilaciones climáticas en el Plioceno/Pleistoceno tuvieron un efecto en los procesos evolutivos de Agarito. Nuestros resultados de la modelización del nicho actual y de la paleomodelización mostraron que el área ocupada actualmente por Berberis trifoliolata es sustancialmente mayor de lo que era durante el último período interglacial y el último máximo glacial. El agarito estaba probablemente confinado en pequeñas zonas del noreste y amplió gradualmente su distribución justo después del Último Máximo Glacial, cuando el clima en el desierto de Chihuahua y las regiones adyacentes se volvió progresivamente más cálido y seco. El área de distribución más contraída se predijo para el periodo interglaciar. Las poblaciones permanecieron en zonas estables durante el Último Máximo Glacial y se expandieron a principios del Holoceno. La mayor variación genética se produjo en las poblaciones de la Sierra Madre Oriental.Fil: Angulo, Diego F. Universidad Autónoma de Yucatán; México.Fil: Amarilla, Leonardo D. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.Fil: Amarilla, Leonardo D. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.Fil: Anton, Ana M. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.Fil: Anton, Ana M. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.Fil: Sosa, Victoria. Instituto de Ecología. Departamento de Biología Evolutiva; México.Plos One2017-02-01info:eu-repo/semantics/dataSetinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_ddb1info:ar-repo/semantics/conjuntoDeDatostext/csvapplication/vnd.ms-excelF. Angulo, Diego; D. Amarilla, Leonardo; M. Anton, Ana; Sosa, Victoria (2017): Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations.. PLOS ONE. Dataset. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0168933.t002http://hdl.handle.net/11086/21004enginfo:eu-repo/semantics/reference/url/https://figshare.com/articles/dataset/Spatial_analysis_of_molecular_variance_SAMOVA_for_i_Berberis_trifoliolata_i_populations_/4610578info:eu-repo/semantics/dataset/https:/doi/10.1371/journal.pone.0168933.t002MEXinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositorio Digital Universitario (UNC)instname:Universidad Nacional de Córdobainstacron:UNC2025-09-04T12:31:29Zoai:rdu.unc.edu.ar:11086/21004Institucionalhttps://rdu.unc.edu.ar/Universidad públicaNo correspondehttp://rdu.unc.edu.ar/oai/snrdoca.unc@gmail.comArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:25722025-09-04 12:31:29.918Repositorio Digital Universitario (UNC) - Universidad Nacional de Córdobafalse
dc.title.none.fl_str_mv Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations
Análisis espacial de la varianza molecular (SAMOVA) para las poblaciones de Berberis trifoliolata
title Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations
spellingShingle Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations
Angulo, Diego F
Niche modelling
Niche modelling predictions
Last Glacial Maximum
Northeastern
Agarito
Last Interglacial period
title_short Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations
title_full Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations
title_fullStr Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations
title_full_unstemmed Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations
title_sort Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations
dc.creator.none.fl_str_mv Angulo, Diego F
Amarilla, Leonardo D
Anton, Ana M
Sosa, Victoria
author Angulo, Diego F
author_facet Angulo, Diego F
Amarilla, Leonardo D
Anton, Ana M
Sosa, Victoria
author_role author
author2 Amarilla, Leonardo D
Anton, Ana M
Sosa, Victoria
author2_role author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Niche modelling
Niche modelling predictions
Last Glacial Maximum
Northeastern
Agarito
Last Interglacial period
topic Niche modelling
Niche modelling predictions
Last Glacial Maximum
Northeastern
Agarito
Last Interglacial period
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.5
dc.description.none.fl_txt_mv Fil: Angulo, Diego F. Universidad Autónoma de Yucatán; México.
Fil: Amarilla, Leonardo D. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Fil: Amarilla, Leonardo D. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Fil: Anton, Ana M. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Fil: Anton, Ana M. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Fil: Sosa, Victoria. Instituto de Ecología. Departamento de Biología Evolutiva; México.
Here we conduct research to understand the evolutionary history of a shrubby species known as Agarito (Berberis trifoliolata), an endemic species to the Chihuahuan Desert. We identify genetic signatures based on plastid DNA and AFLP markers and perform niche modelling and spatial connectivity analyses as well as niche modelling based on records in packrats to elucidate whether orogenic events such as mountain range uplift in the Miocene or the contraction/expansion dynamics of vegetation in response to climate oscillations in the Pliocene/Pleistocene had an effect on evolutionary processes in Agarito. Our results of current niche modelling and palaeomodelling showed that the area currently occupied by Berberis trifoliolata is substantially larger than it was during the Last Interglacial period and the Last Glacial Maximum. Agarito was probably confined to small areas in the Northeastern and gradually expanded its distribution just after the Last Glacial Maximum when the weather in the Chihuahuan Desert and adjacent regions became progressively warmer and drier. The most contracted range was predicted for the Interglacial period. Populations remained in stable areas during the Last Glacial Maximum and expanded at the beginning of the Holocene. Most genetic variation occured in populations from the Sierra Madre Oriental.
Aquí realizamos una investigación para comprender la historia evolutiva de una especie arbustiva conocida como Agarito (Berberis trifoliolata), una especie endémica del desierto de Chihuahua. Identificamos firmas genéticas basadas en marcadores de ADN plastidial y AFLP y realizamos análisis de modelado de nicho y de conectividad espacial, así como de modelado de nicho basado en registros en packrats para dilucidar si los eventos orogénicos como el levantamiento de la cordillera en el Mioceno o la dinámica de contracción/expansión de la vegetación en respuesta a las oscilaciones climáticas en el Plioceno/Pleistoceno tuvieron un efecto en los procesos evolutivos de Agarito. Nuestros resultados de la modelización del nicho actual y de la paleomodelización mostraron que el área ocupada actualmente por Berberis trifoliolata es sustancialmente mayor de lo que era durante el último período interglacial y el último máximo glacial. El agarito estaba probablemente confinado en pequeñas zonas del noreste y amplió gradualmente su distribución justo después del Último Máximo Glacial, cuando el clima en el desierto de Chihuahua y las regiones adyacentes se volvió progresivamente más cálido y seco. El área de distribución más contraída se predijo para el periodo interglaciar. Las poblaciones permanecieron en zonas estables durante el Último Máximo Glacial y se expandieron a principios del Holoceno. La mayor variación genética se produjo en las poblaciones de la Sierra Madre Oriental.
Fil: Angulo, Diego F. Universidad Autónoma de Yucatán; México.
Fil: Amarilla, Leonardo D. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Fil: Amarilla, Leonardo D. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Fil: Anton, Ana M. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales; Argentina.
Fil: Anton, Ana M. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina.
Fil: Sosa, Victoria. Instituto de Ecología. Departamento de Biología Evolutiva; México.
description Fil: Angulo, Diego F. Universidad Autónoma de Yucatán; México.
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2017-02-01
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/dataSet
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_ddb1
info:ar-repo/semantics/conjuntoDeDatos
format dataSet
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv F. Angulo, Diego; D. Amarilla, Leonardo; M. Anton, Ana; Sosa, Victoria (2017): Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations.. PLOS ONE. Dataset. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0168933.t002
http://hdl.handle.net/11086/21004
identifier_str_mv F. Angulo, Diego; D. Amarilla, Leonardo; M. Anton, Ana; Sosa, Victoria (2017): Spatial analysis of molecular variance (SAMOVA) for Berberis trifoliolata populations.. PLOS ONE. Dataset. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0168933.t002
url http://hdl.handle.net/11086/21004
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/reference/url/https://figshare.com/articles/dataset/Spatial_analysis_of_molecular_variance_SAMOVA_for_i_Berberis_trifoliolata_i_populations_/4610578
info:eu-repo/semantics/dataset/https:/doi/10.1371/journal.pone.0168933.t002
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv text/csv
application/vnd.ms-excel
dc.coverage.none.fl_str_mv MEX
dc.publisher.none.fl_str_mv Plos One
publisher.none.fl_str_mv Plos One
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositorio Digital Universitario (UNC)
instname:Universidad Nacional de Córdoba
instacron:UNC
reponame_str Repositorio Digital Universitario (UNC)
collection Repositorio Digital Universitario (UNC)
instname_str Universidad Nacional de Córdoba
instacron_str UNC
institution UNC
repository.name.fl_str_mv Repositorio Digital Universitario (UNC) - Universidad Nacional de Córdoba
repository.mail.fl_str_mv oca.unc@gmail.com
_version_ 1842349616150872064
score 13.13397