Dinámica evolutiva de los genotipos circulantes de rotavirus grupo A antes y después de la vacunación universal en Argentina

Autores
Degiuseppe, Juan Ignacio
Año de publicación
2024
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis doctoral
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Torres, Carolina
Mbayed, Viviana A.
Valva, Pamela
Quarleri, Jorge
Parreño, Gladys Viviana
Descripción
Fil: Degiuseppe, Juan Ignacio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina
El análisis de la diversidad genética de rotavirus es esencial para el diseño efectivo de estrategias de prevención y control, complementando los aspectos clínicos y epidemiológicos.\nSe estudiaron 180 muestras de materia fecal humana con diagnóstico de rotavirus en etapas pre y posvacunal (2010-2019) del Laboratorio de Gastroenteritis Virales del INEI-ANLIS ?Dr. Carlos Malbrán?. Se analizaron las secuencias de los genes VP7 y VP4, mediante abordajes filogenéticos y filodinámicos, y se determinó la constelación genómica en un subgrupo.\nSe identificaron 8 G-tipos y 5 P-tipos; G3 exhibió la mayor diversidad genética, mientras G2, G6, P[4] y P[6] presentaron un solo linaje. Se observaron numerosos fenómenos de ligamiento genético. A nivel global, los genotipos mostraron una tasa de sustitución del orden de 10-3 sustituciones/sitio/año. Las asociaciones G-/P- tipo más frecuentes exhibieron constelaciones puras, mientras que las inusuales mostraron constelaciones puras y mixtas, de origen humano y animal. En la etapa posvacunal, surgieron nuevos linajes de G3 y G9, y aumentó la frecuencia de asociaciones G-/P- tipo inusuales.\nSe evidenció la importancia de la vigilancia epidemiológica molecular continua para comprender los factores que afectan la configuración genética de los rotavirus y evaluar el impacto de la vacunación universal en la ecología viral.
Doctor de la Universidad de Buenos Aires en Ciencias de la Salud
Materia
Rotavirus
Argentina
Evolución
Análisis filogenéticos
Análisis filodinámicos
Ciencias de la vida
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires
Institución
Universidad de Buenos Aires
OAI Identificador
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El análisis de la diversidad genética de rotavirus es esencial para el diseño efectivo de estrategias de prevención y control, complementando los aspectos clínicos y epidemiológicos.\nSe estudiaron 180 muestras de materia fecal humana con diagnóstico de rotavirus en etapas pre y posvacunal (2010-2019) del Laboratorio de Gastroenteritis Virales del INEI-ANLIS ?Dr. Carlos Malbrán?. Se analizaron las secuencias de los genes VP7 y VP4, mediante abordajes filogenéticos y filodinámicos, y se determinó la constelación genómica en un subgrupo.\nSe identificaron 8 G-tipos y 5 P-tipos; G3 exhibió la mayor diversidad genética, mientras G2, G6, P[4] y P[6] presentaron un solo linaje. Se observaron numerosos fenómenos de ligamiento genético. A nivel global, los genotipos mostraron una tasa de sustitución del orden de 10-3 sustituciones/sitio/año. Las asociaciones G-/P- tipo más frecuentes exhibieron constelaciones puras, mientras que las inusuales mostraron constelaciones puras y mixtas, de origen humano y animal. En la etapa posvacunal, surgieron nuevos linajes de G3 y G9, y aumentó la frecuencia de asociaciones G-/P- tipo inusuales.\nSe evidenció la importancia de la vigilancia epidemiológica molecular continua para comprender los factores que afectan la configuración genética de los rotavirus y evaluar el impacto de la vacunación universal en la ecología viral.
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