Epidemiología molecular del Herpesvirus humano tipo 8 (HHV-8) en Argentina: asociación con eventos migratorios humanos

Autores
Hulaniuk Wolaniuk, María Laura
Año de publicación
2020
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis doctoral
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Caputo, Mariela
Trinks, Julieta
Campos, Rodolfo
Pando, María de los Angeles
Ré, Viviana
Descripción
HHV-8 genetic diversity shows a worldwide distribution exhibiting a clear ethnic and geographic clustering. Data regarding the prevalence, genetic diversity and evolutionary history of HHV-8 is still scarce in multi-ethnic Latin American populations.\nThe prevalence of HHV-8 was determined in 772 blood donors, 101 HIV-1 infected subjects and 93 Kaposi?s Sarcoma patients. ORF-26 and ORF-K1 were analyzed for subtype assignment. A mini-sequencing protocol was designed to identify subtypes. Genetic ancestry was determined by ancestry-sensitive DNA markers from autosomal, Y and mitochondrial chromosomes. Phylogeographic analysis was performed in the ORF-K1.\nHHV-8 DNA was less prevalent among blood donors (p<0.0001), and, among those, viral prevalence was higher among donors from north-western Argentina than from the metropolitan area (p=0.001), Bolivians (p=0.0008), Peruvians and Paraguayans. Analyses of ORF-26 revealed that most strains were subtype A/C, followed by subtypes J, B2, K or R. ORF-K1 analyses revealed the presence of subtypes A, B, C and F. The mini-sequencing technique developed in this thesis was a fast, efficient and cheap to identify the most prevalent subtypes in Argentina. Subtypes A/C and J were significantly associated with Native (p=0.004) and non-Native American maternal haplogroups (p<0.0001), respectively. HHV-8 was introduced from Africa, Europe and Latin America.\nThese results reveal the prevalence and HHV-8 genetic diversity in Argentina and their relationship with human migrations.
Fil: Hulaniuk Wolaniuk, María Laura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina
La diversidad genética del HHV-8 presenta una distribución mundial con un patrón geográfico y étnico característico. Los datos sobre la prevalencia, diversidad genética e historia evolutiva viral son aún escasos en poblaciones multi-étnicas latinoamericanas.\nSe determinó la prevalencia viral en 772 donantes de sangre, en 101 individuos VIH [+] y en 93 con Sarcoma de Kaposi. Se caracterizaron los subtipos virales y se desarrolló un método de caracterización genotípica basado en mini-secuenciación. Se analizó la ascendencia genética y se realizó un análisis filogeográfico.\nLa prevalencia viral fue menor en los donantes (p<0,0001), entre los cuales, fue mayor en el noroeste argentino en comparación con la región metropolitana (p=0,001), con Bolivia (p=0,0008), Perú y Paarguay. El análisis del ORF-26E reveló la presencia mayoritaria del subtipo A/C seguido de los subtipos J, K o R y B2; mientras que el ORF-K1 demostró la circulación de los subtipos A, B, C y F. La técnica desarrollada resultó ser un método rápido, eficiente y de bajo costo para identificar los subtipos más prevalentes en Argentina. Los subtipos A/C y J se asociaron con haplogrupos maternos nativo-americanos (p=0,004) y no nativo-americanos (p<0,0001), respectivamente. Este virus se introdujo desde África Subsahariana y Europa o de Latinoamérica.\nEstos resultados revelan la prevalencia y circulación del HHV-8 en Argentina y su relación con las migraciones humanas.
Doctora de la Universidad de Buenos Aires en Ciencias Biológicas
Materia
HHV-8
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires
Institución
Universidad de Buenos Aires
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La diversidad genética del HHV-8 presenta una distribución mundial con un patrón geográfico y étnico característico. Los datos sobre la prevalencia, diversidad genética e historia evolutiva viral son aún escasos en poblaciones multi-étnicas latinoamericanas.\nSe determinó la prevalencia viral en 772 donantes de sangre, en 101 individuos VIH [+] y en 93 con Sarcoma de Kaposi. Se caracterizaron los subtipos virales y se desarrolló un método de caracterización genotípica basado en mini-secuenciación. Se analizó la ascendencia genética y se realizó un análisis filogeográfico.\nLa prevalencia viral fue menor en los donantes (p<0,0001), entre los cuales, fue mayor en el noroeste argentino en comparación con la región metropolitana (p=0,001), con Bolivia (p=0,0008), Perú y Paarguay. El análisis del ORF-26E reveló la presencia mayoritaria del subtipo A/C seguido de los subtipos J, K o R y B2; mientras que el ORF-K1 demostró la circulación de los subtipos A, B, C y F. La técnica desarrollada resultó ser un método rápido, eficiente y de bajo costo para identificar los subtipos más prevalentes en Argentina. Los subtipos A/C y J se asociaron con haplogrupos maternos nativo-americanos (p=0,004) y no nativo-americanos (p<0,0001), respectivamente. Este virus se introdujo desde África Subsahariana y Europa o de Latinoamérica.\nEstos resultados revelan la prevalencia y circulación del HHV-8 en Argentina y su relación con las migraciones humanas.
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description HHV-8 genetic diversity shows a worldwide distribution exhibiting a clear ethnic and geographic clustering. Data regarding the prevalence, genetic diversity and evolutionary history of HHV-8 is still scarce in multi-ethnic Latin American populations.\nThe prevalence of HHV-8 was determined in 772 blood donors, 101 HIV-1 infected subjects and 93 Kaposi?s Sarcoma patients. ORF-26 and ORF-K1 were analyzed for subtype assignment. A mini-sequencing protocol was designed to identify subtypes. Genetic ancestry was determined by ancestry-sensitive DNA markers from autosomal, Y and mitochondrial chromosomes. Phylogeographic analysis was performed in the ORF-K1.\nHHV-8 DNA was less prevalent among blood donors (p<0.0001), and, among those, viral prevalence was higher among donors from north-western Argentina than from the metropolitan area (p=0.001), Bolivians (p=0.0008), Peruvians and Paraguayans. Analyses of ORF-26 revealed that most strains were subtype A/C, followed by subtypes J, B2, K or R. ORF-K1 analyses revealed the presence of subtypes A, B, C and F. The mini-sequencing technique developed in this thesis was a fast, efficient and cheap to identify the most prevalent subtypes in Argentina. Subtypes A/C and J were significantly associated with Native (p=0.004) and non-Native American maternal haplogroups (p<0.0001), respectively. HHV-8 was introduced from Africa, Europe and Latin America.\nThese results reveal the prevalence and HHV-8 genetic diversity in Argentina and their relationship with human migrations.
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