Análisis comparativo de los perfiles de expresión génica de células histiocíticas ante la exposición a LPS

Autores
Martinelli, Romina
Año de publicación
2017
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis de maestría
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Esteban, Luis
Daurelio, Lucas
Wainstok, Rosa
Rodriguez Seguí, Santiago
Chuluyan, Eduardo
Descripción
The cellular arm of the innate immune response, consisting of mononuclear phagocytes and\ndendritic cells, plays an important role by initiating, directing and modulating different aspects of\nthe adaptive immune response. These cells, despite their phenotypic diversity, share essential\nfunctions to the development of the immune response.\nIn this work were used data from cells exposed to lipopolysaccharide (LPS), a glycolipidic\nmacromolecule present on the wall of Gram negative bacteria. This model allows to make\ninferences about different kinds of diseases in which inflammation plays an essential role. Here,\ndata from DNA microarray experiments of monocytes, macrophages and dendritic cells exposed\nto LPS were analyzed. By means of clustering techniques and functional enrichment analysis\nwas identified a group of over-expressed genes in the three cell types, including some that can\nmodulate the inflammation through the inhibition of NFkB pathway and that also can be\nregulated by calcitriol.\nThis results allowed us to construct a gene regulatory network model that can help to understand\nthe vitamin D antiinflammatory action, one of the non-classical actions of this compound. This\nalso opens the search for molecules that can act as therapeutic targets for a variety of diseases in\nwhich inflammation plays an important role during their pathogenesis
Fil: Martinelli, Romina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina
La rama celular de la inmunidad innata, compuesta por fagocitos mononucleares y células\ndendríticas, cumple un rol importante iniciando, orientando y modulando varios aspectos de la\nrespuesta inmune adaptativa. Estas células, a pesar de su diversidad fenotípica, comparten\nfunciones esenciales para el desarrollo de la respuesta inmune. El modelo de células expuestas a\nlipopolisacárido (LPS), macromolécula glicolipídica presente en la pared de bacterias Gram\nnegativas, permite hacer inferencias sobre diferentes tipos de infermedades en las que la\ninflamación juega un rol fundamental.\nEn este trabajo se analizaron datos provenientes de experimentos de microarreglos de ADN de\nmonocitos, macrófagos y células dendríticas expuestas a LPS. Mediante análisis de\nclusterización y de enriquecimiento funcional se logró identificar un grupo de genes\nsobreexpresados en los tres tipos celulares, que contiene genes que pueden modular la\ninflamación a traves de la inhibición de la vía de NFkB y que a su vez pueden ser estimulados\npor calcitriol. Esto permitió esbozar un modelo de red de regulación génica que puede ayudar a\nentender la acción antiinflamatoria, una de las acciones no clásicas de este compuesto. Esto\ntambién abre la búsqueda de moléculas que puedan actuar como blancos terapéuticos para un\ngran expectro de enfermedades en las que la inflamación juega un rol importante en la\nfisiopatogenia.
Magíster de la Universidad de Buenos Aires en Biología Molecular Médica
Materia
NFKB
LPS
CYP27B1
Lipopolisacárido
ADN
Ciencia de la vida
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires
Institución
Universidad de Buenos Aires
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La rama celular de la inmunidad innata, compuesta por fagocitos mononucleares y células\ndendríticas, cumple un rol importante iniciando, orientando y modulando varios aspectos de la\nrespuesta inmune adaptativa. Estas células, a pesar de su diversidad fenotípica, comparten\nfunciones esenciales para el desarrollo de la respuesta inmune. El modelo de células expuestas a\nlipopolisacárido (LPS), macromolécula glicolipídica presente en la pared de bacterias Gram\nnegativas, permite hacer inferencias sobre diferentes tipos de infermedades en las que la\ninflamación juega un rol fundamental.\nEn este trabajo se analizaron datos provenientes de experimentos de microarreglos de ADN de\nmonocitos, macrófagos y células dendríticas expuestas a LPS. Mediante análisis de\nclusterización y de enriquecimiento funcional se logró identificar un grupo de genes\nsobreexpresados en los tres tipos celulares, que contiene genes que pueden modular la\ninflamación a traves de la inhibición de la vía de NFkB y que a su vez pueden ser estimulados\npor calcitriol. Esto permitió esbozar un modelo de red de regulación génica que puede ayudar a\nentender la acción antiinflamatoria, una de las acciones no clásicas de este compuesto. Esto\ntambién abre la búsqueda de moléculas que puedan actuar como blancos terapéuticos para un\ngran expectro de enfermedades en las que la inflamación juega un rol importante en la\nfisiopatogenia.
Magíster de la Universidad de Buenos Aires en Biología Molecular Médica
description The cellular arm of the innate immune response, consisting of mononuclear phagocytes and\ndendritic cells, plays an important role by initiating, directing and modulating different aspects of\nthe adaptive immune response. These cells, despite their phenotypic diversity, share essential\nfunctions to the development of the immune response.\nIn this work were used data from cells exposed to lipopolysaccharide (LPS), a glycolipidic\nmacromolecule present on the wall of Gram negative bacteria. This model allows to make\ninferences about different kinds of diseases in which inflammation plays an essential role. Here,\ndata from DNA microarray experiments of monocytes, macrophages and dendritic cells exposed\nto LPS were analyzed. By means of clustering techniques and functional enrichment analysis\nwas identified a group of over-expressed genes in the three cell types, including some that can\nmodulate the inflammation through the inhibition of NFkB pathway and that also can be\nregulated by calcitriol.\nThis results allowed us to construct a gene regulatory network model that can help to understand\nthe vitamin D antiinflammatory action, one of the non-classical actions of this compound. This\nalso opens the search for molecules that can act as therapeutic targets for a variety of diseases in\nwhich inflammation plays an important role during their pathogenesis
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