Population genomics of native maize through pooled sequencing
- Autores
- Freilij, Damián; Defacio, Raquel Alicia; Vera, Pablo; Puebla, Andrea Fabiana; Paniego, Norma Beatriz; Dominguez, Pia Guadalupe; Lia, Veronica Viviana
- Año de publicación
- 2025
- Idioma
- inglés
- Tipo de recurso
- documento de conferencia
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- Poster
Argentina harbors nearly 60 native maize varieties showing broad morphological and genetic variability, mainly concentrated in two centers of diversity: the Northwest (NWA) and the Northeast (NEA). Yet their genomic characterization remains incomplete, as it requires genotyping numerous individuals and populations. Here, we characterized 21 populations (9 NWA, 9 NEA, and 3 Pampas) using a pooled ddRAD-Seq approach, simultaneously genotyping 50 individuals per population from a single genomic library.
EEA Pergamino
Fil: Freilij, Damián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria-Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Freilij, Damián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
Fil: Defacio, Raquel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino. Recursos Genéticos; Argentina
Fil: Vera, Pablo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Puebla, Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Paniego, Norma Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Dominguez, Pia Guadalupe. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Lia, Verónica Viviana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
Fil: Lia, Verónica Viviana. Universidad de Buenos Aires - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina - Fuente
- I Jornada Argentina de Bioinformática y Biología Computacional, Buenos Aires, 25 noviembre de 2025.
- Materia
-
Maíz
Mejoramiento Genético
Genoma
Caracterización
Maize
Genetic Improvement
Genomes
Characterization
Región Noroeste, Argentina
Región Noreste, Argentina
Región Pampeana - Nivel de accesibilidad
- acceso abierto
- Condiciones de uso
- http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Repositorio
.jpg)
- Institución
- Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
- OAI Identificador
- oai:localhost:20.500.12123/24689
Ver los metadatos del registro completo
| id |
INTADig_cea3cb749adc5fc1a47cf31a2e6f2734 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:localhost:20.500.12123/24689 |
| network_acronym_str |
INTADig |
| repository_id_str |
l |
| network_name_str |
INTA Digital (INTA) |
| spelling |
Population genomics of native maize through pooled sequencingFreilij, DamiánDefacio, Raquel AliciaVera, PabloPuebla, Andrea FabianaPaniego, Norma BeatrizDominguez, Pia GuadalupeLia, Veronica VivianaMaízMejoramiento GenéticoGenomaCaracterizaciónMaizeGenetic ImprovementGenomesCharacterizationRegión Noroeste, ArgentinaRegión Noreste, ArgentinaRegión PampeanaPosterArgentina harbors nearly 60 native maize varieties showing broad morphological and genetic variability, mainly concentrated in two centers of diversity: the Northwest (NWA) and the Northeast (NEA). Yet their genomic characterization remains incomplete, as it requires genotyping numerous individuals and populations. Here, we characterized 21 populations (9 NWA, 9 NEA, and 3 Pampas) using a pooled ddRAD-Seq approach, simultaneously genotyping 50 individuals per population from a single genomic library.EEA PergaminoFil: Freilij, Damián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria-Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Freilij, Damián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Defacio, Raquel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino. Recursos Genéticos; ArgentinaFil: Vera, Pablo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Puebla, Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Paniego, Norma Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Dominguez, Pia Guadalupe. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Lia, Verónica Viviana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Lia, Verónica Viviana. Universidad de Buenos Aires - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; ArgentinaAsociación Argentina de Bioinformática y Biología Computacional2025-12-22T11:07:29Z2025-12-22T11:07:29Z2025-11info:eu-repo/semantics/conferenceObjectinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_5794info:ar-repo/semantics/documentoDeConferenciaapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/24689I Jornada Argentina de Bioinformática y Biología Computacional, Buenos Aires, 25 noviembre de 2025.reponame:INTA Digital (INTA)instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariaenginfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)2025-12-26T11:13:02Zoai:localhost:20.500.12123/24689instacron:INTAInstitucionalhttp://repositorio.inta.gob.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://repositorio.inta.gob.ar/oai/requesttripaldi.nicolas@inta.gob.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:l2025-12-26 11:13:03.272INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariafalse |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Population genomics of native maize through pooled sequencing |
| title |
Population genomics of native maize through pooled sequencing |
| spellingShingle |
Population genomics of native maize through pooled sequencing Freilij, Damián Maíz Mejoramiento Genético Genoma Caracterización Maize Genetic Improvement Genomes Characterization Región Noroeste, Argentina Región Noreste, Argentina Región Pampeana |
| title_short |
Population genomics of native maize through pooled sequencing |
| title_full |
Population genomics of native maize through pooled sequencing |
| title_fullStr |
Population genomics of native maize through pooled sequencing |
| title_full_unstemmed |
Population genomics of native maize through pooled sequencing |
| title_sort |
Population genomics of native maize through pooled sequencing |
| dc.creator.none.fl_str_mv |
Freilij, Damián Defacio, Raquel Alicia Vera, Pablo Puebla, Andrea Fabiana Paniego, Norma Beatriz Dominguez, Pia Guadalupe Lia, Veronica Viviana |
| author |
Freilij, Damián |
| author_facet |
Freilij, Damián Defacio, Raquel Alicia Vera, Pablo Puebla, Andrea Fabiana Paniego, Norma Beatriz Dominguez, Pia Guadalupe Lia, Veronica Viviana |
| author_role |
author |
| author2 |
Defacio, Raquel Alicia Vera, Pablo Puebla, Andrea Fabiana Paniego, Norma Beatriz Dominguez, Pia Guadalupe Lia, Veronica Viviana |
| author2_role |
author author author author author author |
| dc.subject.none.fl_str_mv |
Maíz Mejoramiento Genético Genoma Caracterización Maize Genetic Improvement Genomes Characterization Región Noroeste, Argentina Región Noreste, Argentina Región Pampeana |
| topic |
Maíz Mejoramiento Genético Genoma Caracterización Maize Genetic Improvement Genomes Characterization Región Noroeste, Argentina Región Noreste, Argentina Región Pampeana |
| dc.description.none.fl_txt_mv |
Poster Argentina harbors nearly 60 native maize varieties showing broad morphological and genetic variability, mainly concentrated in two centers of diversity: the Northwest (NWA) and the Northeast (NEA). Yet their genomic characterization remains incomplete, as it requires genotyping numerous individuals and populations. Here, we characterized 21 populations (9 NWA, 9 NEA, and 3 Pampas) using a pooled ddRAD-Seq approach, simultaneously genotyping 50 individuals per population from a single genomic library. EEA Pergamino Fil: Freilij, Damián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria-Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Freilij, Damián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina Fil: Defacio, Raquel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino. Recursos Genéticos; Argentina Fil: Vera, Pablo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Puebla, Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Paniego, Norma Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Dominguez, Pia Guadalupe. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Lia, Verónica Viviana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina Fil: Lia, Verónica Viviana. Universidad de Buenos Aires - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina |
| description |
Poster |
| publishDate |
2025 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2025-12-22T11:07:29Z 2025-12-22T11:07:29Z 2025-11 |
| dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/conferenceObject info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://purl.org/coar/resource_type/c_5794 info:ar-repo/semantics/documentoDeConferencia |
| format |
conferenceObject |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/20.500.12123/24689 |
| url |
http://hdl.handle.net/20.500.12123/24689 |
| dc.language.none.fl_str_mv |
eng |
| language |
eng |
| dc.rights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0) |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0) |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Asociación Argentina de Bioinformática y Biología Computacional |
| publisher.none.fl_str_mv |
Asociación Argentina de Bioinformática y Biología Computacional |
| dc.source.none.fl_str_mv |
I Jornada Argentina de Bioinformática y Biología Computacional, Buenos Aires, 25 noviembre de 2025. reponame:INTA Digital (INTA) instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria |
| reponame_str |
INTA Digital (INTA) |
| collection |
INTA Digital (INTA) |
| instname_str |
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria |
| repository.name.fl_str_mv |
INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria |
| repository.mail.fl_str_mv |
tripaldi.nicolas@inta.gob.ar |
| _version_ |
1852582609305993216 |
| score |
13.075124 |